Study : SA1545 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C2_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C2_S1
Complex: FMT_A_2(3GA0) / Model_42(3GA0/A) = [3.3] Download280.2314.81MKQFNVLVADPISKDGIKALLDHEQFNVDIQTGLSEEALIKIIPSYHALIVRSQTTVTENIINAADSLKVIARAGVGVDNININAATLKGILVINAPDGNTISATEHSLAMLLSMARNIPQAHQSLTNKEWNRNAFKGTELYHKTLGVIGAGRIGLGVAKRAQSFGMKILAFDPYLTDEKAKSLSITKATVDEIAQHSDFVTLHTPLTPKTKGLINADFFAKAKPSLQIINVARGGIIDEKALIKALDEGQISRAAIDVFEHEPATDSPLVAHDKIIVTPHLGASTVEAQEKVAISVSNEIIEILIDGTVTHAVNAPKMDLSNIDDTVKSFINLSQTVGELAIQLMYNAPSSIKITYGGDLASIDSSLLTRTIITHILKDDLGPEVNIINALMLLNQQQVTLNIENNKAETGFSNYLEVELSNDSDSVKVGASVFTGFGPRIVRINNFSVDLKPNQYQIVSYHNDTPGMVGKTGALLGKYNINIASMTLGRTEAGGDALMILSVDQPVSNNIIDELKQVGEYNQIFTTELTVQS
Complex: NHE_E_5(2CUK) / Model_72(2CUK/C) = [3.4] Download767.8121.65MKQFNVLVADPISKDGIKALLDHEQFNVDIQTGLSEEALIKIIPSYHALIVRSQTTVTENIINAADSLKVIARAGVGVDNININAATLKGILVINAPDGNTISATEHSLAMLLSMARNIPQAHQSLTNKEWNRNAFKGTELYHKTLGVIGAGRIGLGVAKRAQSFGMKILAFDPYLTDEKAKSLSITKATVDEIAQHSDFVTLHTPLTPKTKGLINADFFAKAKPSLQIINVARGGIIDEKALIKALDEGQISRAAIDVFEHEPATDSPLVAHDKIIVTPHLGASTVEAQEKVAISVSNEIIEILIDGTVTHAVNAPKMDLSNIDDTVKSFINLSQTVGELAIQLMYNAPSSIKITYGGDLASIDSSLLTRTIITHILKDDLGPEVNIINALMLLNQQQVTLNIENNKAETGFSNYLEVELSNDSDSVKVGASVFTGFGPRIVRINNFSVDLKPNQYQIVSYHNDTPGMVGKTGALLGKYNINIASMTLGRTEAGGDALMILSVDQPVSNNIIDELKQVGEYNQIFTTELTVQS
Complex: FMT_A_4(1HKU) / Model_41(1HKU/A) = [3.7] Download379.469.20MKQFNVLVADPISKDGIKALLDHEQFNVDIQTGLSEEALIKIIPSYHALIVRSQTTVTENIINAADSLKVIARAGVGVDNININAATLKGILVINAPDGNTISATEHSLAMLLSMARNIPQAHQSLTNKEWNRNAFKGTELYHKTLGVIGAGRIGLGVAKRAQSFGMKILAFDPYLTDEKAKSLSITKATVDEIAQHSDFVTLHTPLTPKTKGLINADFFAKAKPSLQIINVARGGIIDEKALIKALDEGQISRAAIDVFEHEPATDSPLVAHDKIIVTPHLGASTVEAQEKVAISVSNEIIEILIDGTVTHAVNAPKMDLSNIDDTVKSFINLSQTVGELAIQLMYNAPSSIKITYGGDLASIDSSLLTRTIITHILKDDLGPEVNIINALMLLNQQQVTLNIENNKAETGFSNYLEVELSNDSDSVKVGASVFTGFGPRIVRINNFSVDLKPNQYQIVSYHNDTPGMVGKTGALLGKYNINIASMTLGRTEAGGDALMILSVDQPVSNNIIDELKQVGEYNQIFTTELTVQS
Complex: ACY_C_3(1MX3) / Model_18(1MX3/A) = [4.2] Download474.749.20MKQFNVLVADPISKDGIKALLDHEQFNVDIQTGLSEEALIKIIPSYHALIVRSQTTVTENIINAADSLKVIARAGVGVDNININAATLKGILVINAPDGNTISATEHSLAMLLSMARNIPQAHQSLTNKEWNRNAFKGTELYHKTLGVIGAGRIGLGVAKRAQSFGMKILAFDPYLTDEKAKSLSITKATVDEIAQHSDFVTLHTPLTPKTKGLINADFFAKAKPSLQIINVARGGIIDEKALIKALDEGQISRAAIDVFEHEPATDSPLVAHDKIIVTPHLGASTVEAQEKVAISVSNEIIEILIDGTVTHAVNAPKMDLSNIDDTVKSFINLSQTVGELAIQLMYNAPSSIKITYGGDLASIDSSLLTRTIITHILKDDLGPEVNIINALMLLNQQQVTLNIENNKAETGFSNYLEVELSNDSDSVKVGASVFTGFGPRIVRINNFSVDLKPNQYQIVSYHNDTPGMVGKTGALLGKYNINIASMTLGRTEAGGDALMILSVDQPVSNNIIDELKQVGEYNQIFTTELTVQS
Complex: NAI_E_5(2P9C) / Model_9(2P9C/A) = [8.3] Download1587.6617.39MKQFNVLVADPISKDGIKALLDHEQFNVDIQTGLSEEALIKIIPSYHALIVRSQTTVTENIINAADSLKVIARAGVGVDNININAATLKGILVINAPDGNTISATEHSLAMLLSMARNIPQAHQSLTNKEWNRNAFKGTELYHKTLGVIGAGRIGLGVAKRAQSFGMKILAFDPYLTDEKAKSLSITKATVDEIAQHSDFVTLHTPLTPKTKGLINADFFAKAKPSLQIINVARGGIIDEKALIKALDEGQISRAAIDVFEHEPATDSPLVAHDKIIVTPHLGASTVEAQEKVAISVSNEIIEILIDGTVTHAVNAPKMDLSNIDDTVKSFINLSQTVGELAIQLMYNAPSSIKITYGGDLASIDSSLLTRTIITHILKDDLGPEVNIINALMLLNQQQVTLNIENNKAETGFSNYLEVELSNDSDSVKVGASVFTGFGPRIVRINNFSVDLKPNQYQIVSYHNDTPGMVGKTGALLGKYNINIASMTLGRTEAGGDALMILSVDQPVSNNIIDELKQVGEYNQIFTTELTVQS
Consensus
[pKd Mean = 4.58]
-697
(s=473)
14
(s=4)
MKQFNVLVADPISKDGIKALLDHEQFNVDIQTGLSEEALIKIIPSYHALIVRSQTTVTENIINAADSLKVIARAGVGVDNININAATLKGILVINAPDGNTISATEHSLAMLLSMARNIPQAHQSLTNKEWNRNAFKGTELYHKTLGVIGAGRIGLGVAKRAQSFGMKILAFDPYLTDEKAKSLSITKATVDEIAQHSDFVTLHTPLTPKTKGLINADFFAKAKPSLQIINVARGGIIDEKALIKALDEGQISRAAIDVFEHEPATDSPLVAHDKIIVTPHLGASTVEAQEKVAISVSNEIIEILIDGTVTHAVNAPKMDLSNIDDTVKSFINLSQTVGELAIQLMYNAPSSIKITYGGDLASIDSSLLTRTIITHILKDDLGPEVNIINALMLLNQQQVTLNIENNKAETGFSNYLEVELSNDSDSVKVGASVFTGFGPRIVRINNFSVDLKPNQYQIVSYHNDTPGMVGKTGALLGKYNINIASMTLGRTEAGGDALMILSVDQPVSNNIIDELKQVGEYNQIFTTELTVQS