Study : jhp_1112 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C8_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 4 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C8_S1
Complex: SAN_A_4(4COQ) / Model_7(4COQ/A) = [3.1] Download567.5238.29MKKTFLIALALTASLIGAENTKWDYKNKENGPHRWDKLHKDFEVCKSGKSQSPINIEHYYHTQDKADLQFKYAASKPKAVFFTHHTLKASFEPTNHINYRGHDYVLDNVHFHAPMEFLINNKTRPLSAHFVHKDAKGRLLVLAIGFEEGKENPNLDPILEGIQKKQNLKEVALDAFLPKSINYYHFNGSLTAPPCTEGVAWFVIEEPLEVSAKQLAEIKKRMKNSPNQRPVQPDYNTVIIKSSAETR
Complex: LSA_A_3(4RIV) / Model_20(4RIV/A) = [3.2] Download446.4136.79MKKTFLIALALTASLIGAENTKWDYKNKENGPHRWDKLHKDFEVCKSGKSQSPINIEHYYHTQDKADLQFKYAASKPKAVFFTHHTLKASFEPTNHINYRGHDYVLDNVHFHAPMEFLINNKTRPLSAHFVHKDAKGRLLVLAIGFEEGKENPNLDPILEGIQKKQNLKEVALDAFLPKSINYYHFNGSLTAPPCTEGVAWFVIEEPLEVSAKQLAEIKKRMKNSPNQRPVQPDYNTVIIKSSAETR
Complex: SAN_B_11(4COQ) / Model_43(4COQ/B) = [3.2] Download555.2440.19MKKTFLIALALTASLIGAENTKWDYKNKENGPHRWDKLHKDFEVCKSGKSQSPINIEHYYHTQDKADLQFKYAASKPKAVFFTHHTLKASFEPTNHINYRGHDYVLDNVHFHAPMEFLINNKTRPLSAHFVHKDAKGRLLVLAIGFEEGKENPNLDPILEGIQKKQNLKEVALDAFLPKSINYYHFNGSLTAPPCTEGVAWFVIEEPLEVSAKQLAEIKKRMKNSPNQRPVQPDYNTVIIKSSAETR
Complex: AZM_A_4(4G7A) / Model_5(4G7A/A) = [3.3] Download698.9438.00MKKTFLIALALTASLIGAENTKWDYKNKENGPHRWDKLHKDFEVCKSGKSQSPINIEHYYHTQDKADLQFKYAASKPKAVFFTHHTLKASFEPTNHINYRGHDYVLDNVHFHAPMEFLINNKTRPLSAHFVHKDAKGRLLVLAIGFEEGKENPNLDPILEGIQKKQNLKEVALDAFLPKSINYYHFNGSLTAPPCTEGVAWFVIEEPLEVSAKQLAEIKKRMKNSPNQRPVQPDYNTVIIKSSAETR
Consensus
[pKd Mean = 3.20]
-567
(s=89)
38
(s=1)
MKKTFLIALALTASLIGAENTKWDYKNKENGPHRWDKLHKDFEVCKSGKSQSPINIEHYYHTQDKADLQFKYAASKPKAVFFTHHTLKASFEPTNHINYRGHDYVLDNVHFHAPMEFLINNKTRPLSAHFVHKDAKGRLLVLAIGFEEGKENPNLDPILEGIQKKQNLKEVALDAFLPKSINYYHFNGSLTAPPCTEGVAWFVIEEPLEVSAKQLAEIKKRMKNSPNQRPVQPDYNTVIIKSSAETR