Study : Lmo0284 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C1_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C1_S1
Complex: ATP_A_9(1XEF) / Model_82(1XEF/A) = [4.7] Download1059.45-6.44LIELHQVSKSFNVNGKTVEAVKNVSITVEKGEIFGVVGYSGAGKSTLVRCINLLERPDAGQVVIDGKNLSTLSSKELRVARRKIGMIFQGYNLLKTATVYDNIAKPLKLEGVPKNEIETRVNKYLSIVGLEDKRNNYPSQLSGGQKQRVAIARALAHEPEILLSDEATSALDPETTEAILQLLLKINAELGITIFLITHELDVIQRICDRVAVMENGHLVEQGTVLDIFTKAKHATTKRFVGSEASFDIPQDLLEKYVATGKLVSLHFIGDEADEPALALVSRKFDVLPSILAGGIDHLKNGTLGKLLVHLKGDEVEYSKAISYLKESGVVVEEVELL
Complex: ADP_B_2(2FFB) / Model_72(2FFB/A) = [5.0] Download415.84-7.18LIELHQVSKSFNVNGKTVEAVKNVSITVEKGEIFGVVGYSGAGKSTLVRCINLLERPDAGQVVIDGKNLSTLSSKELRVARRKIGMIFQGYNLLKTATVYDNIAKPLKLEGVPKNEIETRVNKYLSIVGLEDKRNNYPSQLSGGQKQRVAIARALAHEPEILLSDEATSALDPETTEAILQLLLKINAELGITIFLITHELDVIQRICDRVAVMENGHLVEQGTVLDIFTKAKHATTKRFVGSEASFDIPQDLLEKYVATGKLVSLHFIGDEADEPALALVSRKFDVLPSILAGGIDHLKNGTLGKLLVHLKGDEVEYSKAISYLKESGVVVEEVELL
Complex: ADP_B_2(2FFA) / Model_78(2FFA/A) = [5.0] Download605.47-11.17LIELHQVSKSFNVNGKTVEAVKNVSITVEKGEIFGVVGYSGAGKSTLVRCINLLERPDAGQVVIDGKNLSTLSSKELRVARRKIGMIFQGYNLLKTATVYDNIAKPLKLEGVPKNEIETRVNKYLSIVGLEDKRNNYPSQLSGGQKQRVAIARALAHEPEILLSDEATSALDPETTEAILQLLLKINAELGITIFLITHELDVIQRICDRVAVMENGHLVEQGTVLDIFTKAKHATTKRFVGSEASFDIPQDLLEKYVATGKLVSLHFIGDEADEPALALVSRKFDVLPSILAGGIDHLKNGTLGKLLVHLKGDEVEYSKAISYLKESGVVVEEVELL
Complex: ADP_B_2(2FF7) / Model_65(2FF7/A) = [5.0] Download720.60-11.17LIELHQVSKSFNVNGKTVEAVKNVSITVEKGEIFGVVGYSGAGKSTLVRCINLLERPDAGQVVIDGKNLSTLSSKELRVARRKIGMIFQGYNLLKTATVYDNIAKPLKLEGVPKNEIETRVNKYLSIVGLEDKRNNYPSQLSGGQKQRVAIARALAHEPEILLSDEATSALDPETTEAILQLLLKINAELGITIFLITHELDVIQRICDRVAVMENGHLVEQGTVLDIFTKAKHATTKRFVGSEASFDIPQDLLEKYVATGKLVSLHFIGDEADEPALALVSRKFDVLPSILAGGIDHLKNGTLGKLLVHLKGDEVEYSKAISYLKESGVVVEEVELL
Complex: 128_A_2(2PMK) / Model_67(2PMK/A) = [5.1] Download238.20-11.27LIELHQVSKSFNVNGKTVEAVKNVSITVEKGEIFGVVGYSGAGKSTLVRCINLLERPDAGQVVIDGKNLSTLSSKELRVARRKIGMIFQGYNLLKTATVYDNIAKPLKLEGVPKNEIETRVNKYLSIVGLEDKRNNYPSQLSGGQKQRVAIARALAHEPEILLSDEATSALDPETTEAILQLLLKINAELGITIFLITHELDVIQRICDRVAVMENGHLVEQGTVLDIFTKAKHATTKRFVGSEASFDIPQDLLEKYVATGKLVSLHFIGDEADEPALALVSRKFDVLPSILAGGIDHLKNGTLGKLLVHLKGDEVEYSKAISYLKESGVVVEEVELL
Consensus
[pKd Mean = 4.96]
-607
(s=279)
-9
(s=2)
LIELHQVSKSFNVNGKTVEAVKNVSITVEKGEIFGVVGYSGAGKSTLVRCINLLERPDAGQVVIDGKNLSTLSSKELRVARRKIGMIFQGYNLLKTATVYDNIAKPLKLEGVPKNEIETRVNKYLSIVGLEDKRNNYPSQLSGGQKQRVAIARALAHEPEILLSDEATSALDPETTEAILQLLLKINAELGITIFLITHELDVIQRICDRVAVMENGHLVEQGTVLDIFTKAKHATTKRFVGSEASFDIPQDLLEKYVATGKLVSLHFIGDEADEPALALVSRKFDVLPSILAGGIDHLKNGTLGKLLVHLKGDEVEYSKAISYLKESGVVVEEVELL