Study : Lmo0288 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C3_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C3_S1
Complex: ADP_A_3(4BIX) / Model_13(4BIX/A) = [5.5] Download1478.0825.16MHKMRFFQSVQFKLVIMYLLLIIVAMQVIGAYFVRELEGQLEKNFQDSITNSITLLDYNAREEIIKNSDNSVKLQNDIRELLVDYSRASSNLIEVRIVDDKGKILGTSNLNNQGIVGQKSNDPLVKRTLSLGTTSEDKIYKDESNKNNRVWVNVSSIKNKGQVIGAIYLVADIESVYKQVDDITNIFITGTLIAMIITAVLGILLSRTITKPIVEMKRQAYAMARGNYSRKVKVYGVDEIGELADSFNTLTKRVQEAQAMTEGERRKLSSVLAYMTDGVIATDRRGKVILINTPAEKMLRVKHESANGRSIIDVLDIGDTYQFEDLMEVDGSLTMDRSTLDKPYVLRANFSVIQRETGFNNGVIAVLHDITDQEKVDQERRDFVSNVSHELRTPLTSMHSYLEALSDGAWEDKEIAPRFLEVTQNETERMIRLVNDLLKLSRMDGGREQLEKSFVNFTDFFNHIIDRFEMMKKETIMFKRHIPREPVIIEIDEDKVMQVLDNIISNANKYSPDGGRISFYLKKFEDEIEVSIADEGLGVPDEDLANVFDRFFRVDKARSREMGGTGLGLAIAREVIEAHGGRIWAERNKNKGTIIKFTLPYSDLPEDDWE
Complex: ATP_A_3(4BIV) / Model_16(4BIV/A) = [5.9] Download1107.9617.77MHKMRFFQSVQFKLVIMYLLLIIVAMQVIGAYFVRELEGQLEKNFQDSITNSITLLDYNAREEIIKNSDNSVKLQNDIRELLVDYSRASSNLIEVRIVDDKGKILGTSNLNNQGIVGQKSNDPLVKRTLSLGTTSEDKIYKDESNKNNRVWVNVSSIKNKGQVIGAIYLVADIESVYKQVDDITNIFITGTLIAMIITAVLGILLSRTITKPIVEMKRQAYAMARGNYSRKVKVYGVDEIGELADSFNTLTKRVQEAQAMTEGERRKLSSVLAYMTDGVIATDRRGKVILINTPAEKMLRVKHESANGRSIIDVLDIGDTYQFEDLMEVDGSLTMDRSTLDKPYVLRANFSVIQRETGFNNGVIAVLHDITDQEKVDQERRDFVSNVSHELRTPLTSMHSYLEALSDGAWEDKEIAPRFLEVTQNETERMIRLVNDLLKLSRMDGGREQLEKSFVNFTDFFNHIIDRFEMMKKETIMFKRHIPREPVIIEIDEDKVMQVLDNIISNANKYSPDGGRISFYLKKFEDEIEVSIADEGLGVPDEDLANVFDRFFRVDKARSREMGGTGLGLAIAREVIEAHGGRIWAERNKNKGTIIKFTLPYSDLPEDDWE
Complex: ATP_A_3(4CB0) / Model_17(4CB0/A) = [6.7] Download925.2724.52MHKMRFFQSVQFKLVIMYLLLIIVAMQVIGAYFVRELEGQLEKNFQDSITNSITLLDYNAREEIIKNSDNSVKLQNDIRELLVDYSRASSNLIEVRIVDDKGKILGTSNLNNQGIVGQKSNDPLVKRTLSLGTTSEDKIYKDESNKNNRVWVNVSSIKNKGQVIGAIYLVADIESVYKQVDDITNIFITGTLIAMIITAVLGILLSRTITKPIVEMKRQAYAMARGNYSRKVKVYGVDEIGELADSFNTLTKRVQEAQAMTEGERRKLSSVLAYMTDGVIATDRRGKVILINTPAEKMLRVKHESANGRSIIDVLDIGDTYQFEDLMEVDGSLTMDRSTLDKPYVLRANFSVIQRETGFNNGVIAVLHDITDQEKVDQERRDFVSNVSHELRTPLTSMHSYLEALSDGAWEDKEIAPRFLEVTQNETERMIRLVNDLLKLSRMDGGREQLEKSFVNFTDFFNHIIDRFEMMKKETIMFKRHIPREPVIIEIDEDKVMQVLDNIISNANKYSPDGGRISFYLKKFEDEIEVSIADEGLGVPDEDLANVFDRFFRVDKARSREMGGTGLGLAIAREVIEAHGGRIWAERNKNKGTIIKFTLPYSDLPEDDWE
Complex: ANP_B_7(4BIW) / Model_31(4BIW/B) = [7.6] Download988.1925.44MHKMRFFQSVQFKLVIMYLLLIIVAMQVIGAYFVRELEGQLEKNFQDSITNSITLLDYNAREEIIKNSDNSVKLQNDIRELLVDYSRASSNLIEVRIVDDKGKILGTSNLNNQGIVGQKSNDPLVKRTLSLGTTSEDKIYKDESNKNNRVWVNVSSIKNKGQVIGAIYLVADIESVYKQVDDITNIFITGTLIAMIITAVLGILLSRTITKPIVEMKRQAYAMARGNYSRKVKVYGVDEIGELADSFNTLTKRVQEAQAMTEGERRKLSSVLAYMTDGVIATDRRGKVILINTPAEKMLRVKHESANGRSIIDVLDIGDTYQFEDLMEVDGSLTMDRSTLDKPYVLRANFSVIQRETGFNNGVIAVLHDITDQEKVDQERRDFVSNVSHELRTPLTSMHSYLEALSDGAWEDKEIAPRFLEVTQNETERMIRLVNDLLKLSRMDGGREQLEKSFVNFTDFFNHIIDRFEMMKKETIMFKRHIPREPVIIEIDEDKVMQVLDNIISNANKYSPDGGRISFYLKKFEDEIEVSIADEGLGVPDEDLANVFDRFFRVDKARSREMGGTGLGLAIAREVIEAHGGRIWAERNKNKGTIIKFTLPYSDLPEDDWE
Complex: ATP_A_4(3SL2) / Model_4(3SL2/A) = [7.8] Download1102.4319.38MHKMRFFQSVQFKLVIMYLLLIIVAMQVIGAYFVRELEGQLEKNFQDSITNSITLLDYNAREEIIKNSDNSVKLQNDIRELLVDYSRASSNLIEVRIVDDKGKILGTSNLNNQGIVGQKSNDPLVKRTLSLGTTSEDKIYKDESNKNNRVWVNVSSIKNKGQVIGAIYLVADIESVYKQVDDITNIFITGTLIAMIITAVLGILLSRTITKPIVEMKRQAYAMARGNYSRKVKVYGVDEIGELADSFNTLTKRVQEAQAMTEGERRKLSSVLAYMTDGVIATDRRGKVILINTPAEKMLRVKHESANGRSIIDVLDIGDTYQFEDLMEVDGSLTMDRSTLDKPYVLRANFSVIQRETGFNNGVIAVLHDITDQEKVDQERRDFVSNVSHELRTPLTSMHSYLEALSDGAWEDKEIAPRFLEVTQNETERMIRLVNDLLKLSRMDGGREQLEKSFVNFTDFFNHIIDRFEMMKKETIMFKRHIPREPVIIEIDEDKVMQVLDNIISNANKYSPDGGRISFYLKKFEDEIEVSIADEGLGVPDEDLANVFDRFFRVDKARSREMGGTGLGLAIAREVIEAHGGRIWAERNKNKGTIIKFTLPYSDLPEDDWE
Consensus
[pKd Mean = 6.70]
-1120
(s=191)
22
(s=3)
MHKMRFFQSVQFKLVIMYLLLIIVAMQVIGAYFVRELEGQLEKNFQDSITNSITLLDYNAREEIIKNSDNSVKLQNDIRELLVDYSRASSNLIEVRIVDDKGKILGTSNLNNQGIVGQKSNDPLVKRTLSLGTTSEDKIYKDESNKNNRVWVNVSSIKNKGQVIGAIYLVADIESVYKQVDDITNIFITGTLIAMIITAVLGILLSRTITKPIVEMKRQAYAMARGNYSRKVKVYGVDEIGELADSFNTLTKRVQEAQAMTEGERRKLSSVLAYMTDGVIATDRRGKVILINTPAEKMLRVKHESANGRSIIDVLDIGDTYQFEDLMEVDGSLTMDRSTLDKPYVLRANFSVIQRETGFNNGVIAVLHDITDQEKVDQERRDFVSNVSHELRTPLTSMHSYLEALSDGAWEDKEIAPRFLEVTQNETERMIRLVNDLLKLSRMDGGREQLEKSFVNFTDFFNHIIDRFEMMKKETIMFKRHIPREPVIIEIDEDKVMQVLDNIISNANKYSPDGGRISFYLKKFEDEIEVSIADEGLGVPDEDLANVFDRFFRVDKARSREMGGTGLGLAIAREVIEAHGGRIWAERNKNKGTIIKFTLPYSDLPEDDWE