Study : Lmo0841 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C2_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C2_S1
Complex: ACP_A_4(3AR2) / Model_49(3AR2/A) = [3.4] Download1047.9027.89LEIYRKSAAETFTQLEATEKGLTTSEVTKRQEKYGFNELKNKKKDPLWKLFLETFKDPMVIVLVIAALVQLVLGEVVESLIIFLVLIVNSIISVVQTRKAESSLDALREMSAPVAKVIRDGSKQSIHARELVPGDVVILDAGDFVPADGRLFESGSLKIDEGMLTGESEAVEKYIDTIPDEVGLGDRVNMVFSGSLVVYGRGMFVVTGTASETEIGKIAGLLETAEAKQTPLQRKLESFSKKLGLGILALCVLIFAVEAGRVLLGDNSADMATAILNAFMFAVAVAVAAIPEALSSIVTIVLAVGTNKMAKQHAIIRKLPAVETLGSTSVICTDKTGTLTQNKMTVVDYYLPDGTKENFPESPENWSEGERRLIHIAVLCNDSNINSEGKELGDPTEVALIAFSNKNNQDYNEIREKFIREGEIPFDSDRKLMSTLHTFNENKAMLTKGGPDVMFARCSYVFLDGEEKPMTEEILAKLKETNEEFSNQALRVLAYGYKRMPADTTELKLEDEQDIVLVGLTAMIDPPREAVYASIEESKKAGIRTVMITGDHKTTAQAIGRDIGLMDADDIALTGQELDAMPEEELDKKLEHIAVYARVSPENKIRIVKAWQKKGKITAMTGDGVNDAPALKQADIGVAMGSGTDVAKDSAAMILTDDNFVSIVDAVGVGRTVFDNIKKSIAYLFAGNLGAIIAILFALVLDWINPFTALQLLFINLVNDSLPAIALGMEKAEPDVMKRKPRDINEGIFAGGTMRAVISRGVLIGIAVIISQYIGMQISPEMSVAMAFTTLILARTLQTFAARSNVQTAFGAGFFSNKYVIGAVLLCFVLYGITVLPGAREIFSIPASFGLHEWSIAAGLALAAVVMMEIIKVVQNKFFK
Complex: ACP_A_3(2C8K) / Model_14(2C8K/A) = [3.7] Download1878.909.07LEIYRKSAAETFTQLEATEKGLTTSEVTKRQEKYGFNELKNKKKDPLWKLFLETFKDPMVIVLVIAALVQLVLGEVVESLIIFLVLIVNSIISVVQTRKAESSLDALREMSAPVAKVIRDGSKQSIHARELVPGDVVILDAGDFVPADGRLFESGSLKIDEGMLTGESEAVEKYIDTIPDEVGLGDRVNMVFSGSLVVYGRGMFVVTGTASETEIGKIAGLLETAEAKQTPLQRKLESFSKKLGLGILALCVLIFAVEAGRVLLGDNSADMATAILNAFMFAVAVAVAAIPEALSSIVTIVLAVGTNKMAKQHAIIRKLPAVETLGSTSVICTDKTGTLTQNKMTVVDYYLPDGTKENFPESPENWSEGERRLIHIAVLCNDSNINSEGKELGDPTEVALIAFSNKNNQDYNEIREKFIREGEIPFDSDRKLMSTLHTFNENKAMLTKGGPDVMFARCSYVFLDGEEKPMTEEILAKLKETNEEFSNQALRVLAYGYKRMPADTTELKLEDEQDIVLVGLTAMIDPPREAVYASIEESKKAGIRTVMITGDHKTTAQAIGRDIGLMDADDIALTGQELDAMPEEELDKKLEHIAVYARVSPENKIRIVKAWQKKGKITAMTGDGVNDAPALKQADIGVAMGSGTDVAKDSAAMILTDDNFVSIVDAVGVGRTVFDNIKKSIAYLFAGNLGAIIAILFALVLDWINPFTALQLLFINLVNDSLPAIALGMEKAEPDVMKRKPRDINEGIFAGGTMRAVISRGVLIGIAVIISQYIGMQISPEMSVAMAFTTLILARTLQTFAARSNVQTAFGAGFFSNKYVIGAVLLCFVLYGITVLPGAREIFSIPASFGLHEWSIAAGLALAAVVMMEIIKVVQNKFFK
Complex: ATP_A_7(3FPB) / Model_38(3FPB/A) = [3.7] Download1856.908.41LEIYRKSAAETFTQLEATEKGLTTSEVTKRQEKYGFNELKNKKKDPLWKLFLETFKDPMVIVLVIAALVQLVLGEVVESLIIFLVLIVNSIISVVQTRKAESSLDALREMSAPVAKVIRDGSKQSIHARELVPGDVVILDAGDFVPADGRLFESGSLKIDEGMLTGESEAVEKYIDTIPDEVGLGDRVNMVFSGSLVVYGRGMFVVTGTASETEIGKIAGLLETAEAKQTPLQRKLESFSKKLGLGILALCVLIFAVEAGRVLLGDNSADMATAILNAFMFAVAVAVAAIPEALSSIVTIVLAVGTNKMAKQHAIIRKLPAVETLGSTSVICTDKTGTLTQNKMTVVDYYLPDGTKENFPESPENWSEGERRLIHIAVLCNDSNINSEGKELGDPTEVALIAFSNKNNQDYNEIREKFIREGEIPFDSDRKLMSTLHTFNENKAMLTKGGPDVMFARCSYVFLDGEEKPMTEEILAKLKETNEEFSNQALRVLAYGYKRMPADTTELKLEDEQDIVLVGLTAMIDPPREAVYASIEESKKAGIRTVMITGDHKTTAQAIGRDIGLMDADDIALTGQELDAMPEEELDKKLEHIAVYARVSPENKIRIVKAWQKKGKITAMTGDGVNDAPALKQADIGVAMGSGTDVAKDSAAMILTDDNFVSIVDAVGVGRTVFDNIKKSIAYLFAGNLGAIIAILFALVLDWINPFTALQLLFINLVNDSLPAIALGMEKAEPDVMKRKPRDINEGIFAGGTMRAVISRGVLIGIAVIISQYIGMQISPEMSVAMAFTTLILARTLQTFAARSNVQTAFGAGFFSNKYVIGAVLLCFVLYGITVLPGAREIFSIPASFGLHEWSIAAGLALAAVVMMEIIKVVQNKFFK
Complex: ACP_A_7(4H1W) / Model_26(4H1W/A) = [3.8] Download919.62-1.58LEIYRKSAAETFTQLEATEKGLTTSEVTKRQEKYGFNELKNKKKDPLWKLFLETFKDPMVIVLVIAALVQLVLGEVVESLIIFLVLIVNSIISVVQTRKAESSLDALREMSAPVAKVIRDGSKQSIHARELVPGDVVILDAGDFVPADGRLFESGSLKIDEGMLTGESEAVEKYIDTIPDEVGLGDRVNMVFSGSLVVYGRGMFVVTGTASETEIGKIAGLLETAEAKQTPLQRKLESFSKKLGLGILALCVLIFAVEAGRVLLGDNSADMATAILNAFMFAVAVAVAAIPEALSSIVTIVLAVGTNKMAKQHAIIRKLPAVETLGSTSVICTDKTGTLTQNKMTVVDYYLPDGTKENFPESPENWSEGERRLIHIAVLCNDSNINSEGKELGDPTEVALIAFSNKNNQDYNEIREKFIREGEIPFDSDRKLMSTLHTFNENKAMLTKGGPDVMFARCSYVFLDGEEKPMTEEILAKLKETNEEFSNQALRVLAYGYKRMPADTTELKLEDEQDIVLVGLTAMIDPPREAVYASIEESKKAGIRTVMITGDHKTTAQAIGRDIGLMDADDIALTGQELDAMPEEELDKKLEHIAVYARVSPENKIRIVKAWQKKGKITAMTGDGVNDAPALKQADIGVAMGSGTDVAKDSAAMILTDDNFVSIVDAVGVGRTVFDNIKKSIAYLFAGNLGAIIAILFALVLDWINPFTALQLLFINLVNDSLPAIALGMEKAEPDVMKRKPRDINEGIFAGGTMRAVISRGVLIGIAVIISQYIGMQISPEMSVAMAFTTLILARTLQTFAARSNVQTAFGAGFFSNKYVIGAVLLCFVLYGITVLPGAREIFSIPASFGLHEWSIAAGLALAAVVMMEIIKVVQNKFFK
Complex: 12D_A_5(3AR6) / Model_45(3AR6/A) = [3.9] Download2331.4634.68LEIYRKSAAETFTQLEATEKGLTTSEVTKRQEKYGFNELKNKKKDPLWKLFLETFKDPMVIVLVIAALVQLVLGEVVESLIIFLVLIVNSIISVVQTRKAESSLDALREMSAPVAKVIRDGSKQSIHARELVPGDVVILDAGDFVPADGRLFESGSLKIDEGMLTGESEAVEKYIDTIPDEVGLGDRVNMVFSGSLVVYGRGMFVVTGTASETEIGKIAGLLETAEAKQTPLQRKLESFSKKLGLGILALCVLIFAVEAGRVLLGDNSADMATAILNAFMFAVAVAVAAIPEALSSIVTIVLAVGTNKMAKQHAIIRKLPAVETLGSTSVICTDKTGTLTQNKMTVVDYYLPDGTKENFPESPENWSEGERRLIHIAVLCNDSNINSEGKELGDPTEVALIAFSNKNNQDYNEIREKFIREGEIPFDSDRKLMSTLHTFNENKAMLTKGGPDVMFARCSYVFLDGEEKPMTEEILAKLKETNEEFSNQALRVLAYGYKRMPADTTELKLEDEQDIVLVGLTAMIDPPREAVYASIEESKKAGIRTVMITGDHKTTAQAIGRDIGLMDADDIALTGQELDAMPEEELDKKLEHIAVYARVSPENKIRIVKAWQKKGKITAMTGDGVNDAPALKQADIGVAMGSGTDVAKDSAAMILTDDNFVSIVDAVGVGRTVFDNIKKSIAYLFAGNLGAIIAILFALVLDWINPFTALQLLFINLVNDSLPAIALGMEKAEPDVMKRKPRDINEGIFAGGTMRAVISRGVLIGIAVIISQYIGMQISPEMSVAMAFTTLILARTLQTFAARSNVQTAFGAGFFSNKYVIGAVLLCFVLYGITVLPGAREIFSIPASFGLHEWSIAAGLALAAVVMMEIIKVVQNKFFK
Consensus
[pKd Mean = 3.70]
-1606
(s=537)
15
(s=13)
LEIYRKSAAETFTQLEATEKGLTTSEVTKRQEKYGFNELKNKKKDPLWKLFLETFKDPMVIVLVIAALVQLVLGEVVESLIIFLVLIVNSIISVVQTRKAESSLDALREMSAPVAKVIRDGSKQSIHARELVPGDVVILDAGDFVPADGRLFESGSLKIDEGMLTGESEAVEKYIDTIPDEVGLGDRVNMVFSGSLVVYGRGMFVVTGTASETEIGKIAGLLETAEAKQTPLQRKLESFSKKLGLGILALCVLIFAVEAGRVLLGDNSADMATAILNAFMFAVAVAVAAIPEALSSIVTIVLAVGTNKMAKQHAIIRKLPAVETLGSTSVICTDKTGTLTQNKMTVVDYYLPDGTKENFPESPENWSEGERRLIHIAVLCNDSNINSEGKELGDPTEVALIAFSNKNNQDYNEIREKFIREGEIPFDSDRKLMSTLHTFNENKAMLTKGGPDVMFARCSYVFLDGEEKPMTEEILAKLKETNEEFSNQALRVLAYGYKRMPADTTELKLEDEQDIVLVGLTAMIDPPREAVYASIEESKKAGIRTVMITGDHKTTAQAIGRDIGLMDADDIALTGQELDAMPEEELDKKLEHIAVYARVSPENKIRIVKAWQKKGKITAMTGDGVNDAPALKQADIGVAMGSGTDVAKDSAAMILTDDNFVSIVDAVGVGRTVFDNIKKSIAYLFAGNLGAIIAILFALVLDWINPFTALQLLFINLVNDSLPAIALGMEKAEPDVMKRKPRDINEGIFAGGTMRAVISRGVLIGIAVIISQYIGMQISPEMSVAMAFTTLILARTLQTFAARSNVQTAFGAGFFSNKYVIGAVLLCFVLYGITVLPGAREIFSIPASFGLHEWSIAAGLALAAVVMMEIIKVVQNKFFK