Study : Lmo1132 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C3_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C3_S1
Complex: AGS_B_4(4S0F) / Model_23(4S0F/B) = [3.5] Download869.387.43MSEWTIIGWLLKFVKPLRGKMILAILLGIISNLSVIMISLIGTYGIIAVILQQPLNPYKWLFVMVACGVVRGLARYLEQYLNHDIAFRLLAIIRERIFATLRKLGPARLSGKKSGDLVAAITTDVEALEVFFAHTISPVFIALGTTIATVGFLASYDVGLAIILLVGQIMVGVVLPMISYKRNKKIGTAYQQAFVGLNQMVMENIASLQDIFQFKLGEERLRKLETQGEKLNRQYKKRIRQGSELQILGEWVLIGTATIILVLGSLSQLPLETVLIGTVLSLSSFGSVLALNALGTALLTTFASGKRLYALTEEKPVVLFNGQLELSDFESAELDKVSFSHDGKQPLLNELSLALPKGKWLGIGGESGSGKSTLVKLLMRYWDPDGQVKLNNNELPKITESSLHRLEGVMEQRTFLFEDTLGNNIRLGKKDATLEEVKEAARKAAIDTWIETLPEGYETIIGGQSRNLSDGERQRIGLARLFLHDAPLLLLDEPTSNLDYINEQAILNTLRSEIQDKTVLVISHRATTLDLAEEQLFIENGALKRAAK
Complex: ADP_A_2(5DGX) / Model_56(5DGX/A) = [4.1] Download1310.2114.12MSEWTIIGWLLKFVKPLRGKMILAILLGIISNLSVIMISLIGTYGIIAVILQQPLNPYKWLFVMVACGVVRGLARYLEQYLNHDIAFRLLAIIRERIFATLRKLGPARLSGKKSGDLVAAITTDVEALEVFFAHTISPVFIALGTTIATVGFLASYDVGLAIILLVGQIMVGVVLPMISYKRNKKIGTAYQQAFVGLNQMVMENIASLQDIFQFKLGEERLRKLETQGEKLNRQYKKRIRQGSELQILGEWVLIGTATIILVLGSLSQLPLETVLIGTVLSLSSFGSVLALNALGTALLTTFASGKRLYALTEEKPVVLFNGQLELSDFESAELDKVSFSHDGKQPLLNELSLALPKGKWLGIGGESGSGKSTLVKLLMRYWDPDGQVKLNNNELPKITESSLHRLEGVMEQRTFLFEDTLGNNIRLGKKDATLEEVKEAARKAAIDTWIETLPEGYETIIGGQSRNLSDGERQRIGLARLFLHDAPLLLLDEPTSNLDYINEQAILNTLRSEIQDKTVLVISHRATTLDLAEEQLFIENGALKRAAK
Complex: ADP_B_2(2FFB) / Model_36(2FFB/A) = [4.8] Download1115.4723.06MSEWTIIGWLLKFVKPLRGKMILAILLGIISNLSVIMISLIGTYGIIAVILQQPLNPYKWLFVMVACGVVRGLARYLEQYLNHDIAFRLLAIIRERIFATLRKLGPARLSGKKSGDLVAAITTDVEALEVFFAHTISPVFIALGTTIATVGFLASYDVGLAIILLVGQIMVGVVLPMISYKRNKKIGTAYQQAFVGLNQMVMENIASLQDIFQFKLGEERLRKLETQGEKLNRQYKKRIRQGSELQILGEWVLIGTATIILVLGSLSQLPLETVLIGTVLSLSSFGSVLALNALGTALLTTFASGKRLYALTEEKPVVLFNGQLELSDFESAELDKVSFSHDGKQPLLNELSLALPKGKWLGIGGESGSGKSTLVKLLMRYWDPDGQVKLNNNELPKITESSLHRLEGVMEQRTFLFEDTLGNNIRLGKKDATLEEVKEAARKAAIDTWIETLPEGYETIIGGQSRNLSDGERQRIGLARLFLHDAPLLLLDEPTSNLDYINEQAILNTLRSEIQDKTVLVISHRATTLDLAEEQLFIENGALKRAAK
Complex: ADP_B_2(2FFA) / Model_49(2FFA/A) = [4.8] Download1205.9413.50MSEWTIIGWLLKFVKPLRGKMILAILLGIISNLSVIMISLIGTYGIIAVILQQPLNPYKWLFVMVACGVVRGLARYLEQYLNHDIAFRLLAIIRERIFATLRKLGPARLSGKKSGDLVAAITTDVEALEVFFAHTISPVFIALGTTIATVGFLASYDVGLAIILLVGQIMVGVVLPMISYKRNKKIGTAYQQAFVGLNQMVMENIASLQDIFQFKLGEERLRKLETQGEKLNRQYKKRIRQGSELQILGEWVLIGTATIILVLGSLSQLPLETVLIGTVLSLSSFGSVLALNALGTALLTTFASGKRLYALTEEKPVVLFNGQLELSDFESAELDKVSFSHDGKQPLLNELSLALPKGKWLGIGGESGSGKSTLVKLLMRYWDPDGQVKLNNNELPKITESSLHRLEGVMEQRTFLFEDTLGNNIRLGKKDATLEEVKEAARKAAIDTWIETLPEGYETIIGGQSRNLSDGERQRIGLARLFLHDAPLLLLDEPTSNLDYINEQAILNTLRSEIQDKTVLVISHRATTLDLAEEQLFIENGALKRAAK
Complex: 12D_A_2(3B5J) / Model_37(3B5J/A) = [5.0] Download1361.7913.44MSEWTIIGWLLKFVKPLRGKMILAILLGIISNLSVIMISLIGTYGIIAVILQQPLNPYKWLFVMVACGVVRGLARYLEQYLNHDIAFRLLAIIRERIFATLRKLGPARLSGKKSGDLVAAITTDVEALEVFFAHTISPVFIALGTTIATVGFLASYDVGLAIILLVGQIMVGVVLPMISYKRNKKIGTAYQQAFVGLNQMVMENIASLQDIFQFKLGEERLRKLETQGEKLNRQYKKRIRQGSELQILGEWVLIGTATIILVLGSLSQLPLETVLIGTVLSLSSFGSVLALNALGTALLTTFASGKRLYALTEEKPVVLFNGQLELSDFESAELDKVSFSHDGKQPLLNELSLALPKGKWLGIGGESGSGKSTLVKLLMRYWDPDGQVKLNNNELPKITESSLHRLEGVMEQRTFLFEDTLGNNIRLGKKDATLEEVKEAARKAAIDTWIETLPEGYETIIGGQSRNLSDGERQRIGLARLFLHDAPLLLLDEPTSNLDYINEQAILNTLRSEIQDKTVLVISHRATTLDLAEEQLFIENGALKRAAK
Consensus
[pKd Mean = 4.44]
-1172
(s=173)
14
(s=5)
MSEWTIIGWLLKFVKPLRGKMILAILLGIISNLSVIMISLIGTYGIIAVILQQPLNPYKWLFVMVACGVVRGLARYLEQYLNHDIAFRLLAIIRERIFATLRKLGPARLSGKKSGDLVAAITTDVEALEVFFAHTISPVFIALGTTIATVGFLASYDVGLAIILLVGQIMVGVVLPMISYKRNKKIGTAYQQAFVGLNQMVMENIASLQDIFQFKLGEERLRKLETQGEKLNRQYKKRIRQGSELQILGEWVLIGTATIILVLGSLSQLPLETVLIGTVLSLSSFGSVLALNALGTALLTTFASGKRLYALTEEKPVVLFNGQLELSDFESAELDKVSFSHDGKQPLLNELSLALPKGKWLGIGGESGSGKSTLVKLLMRYWDPDGQVKLNNNELPKITESSLHRLEGVMEQRTFLFEDTLGNNIRLGKKDATLEEVKEAARKAAIDTWIETLPEGYETIIGGQSRNLSDGERQRIGLARLFLHDAPLLLLDEPTSNLDYINEQAILNTLRSEIQDKTVLVISHRATTLDLAEEQLFIENGALKRAAK