Study : Lmo1581 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C3_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C3_S1
Complex: ACY_B_7(1TUY) / Model_21(1TUY/B) = [3.3] Download518.824.00MEKTIAINAGSSSLKFQLYDMPSERVITAGIVERIGLKDSIFTITVDGEKIKEIIDIPDHEIAVQMLLEKLINHKVIGSYDEITGIGHRVVHGGERFPESVYIDDQVIKDIEALSELAPLHNPANVTGIKAFRKILPDVVSVAVFDTAFHQTMPPASYLYSLPYSYYEDYGIRKYGFHGTSHKYVSERAAELLGRPVEELRLLTCHLGNGASIAAIEGGKSMDTSMGFTPLAGVSMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLDVLNKESGMLGVSGISSDLRDLEDEAAKGNDRAELALQVFVDRIHKYIGSYAARMNGVDAIIFTAGIGENSSYIREKVLRGLEFMGVYWDPALNQVRGEERFLNYPHSPVKVIIIPTNEELMIARDVETIKNNR
Complex: C5P_A_4(4FWR) / Model_15(4FWR/A) = [3.9] Download1431.99-10.33MEKTIAINAGSSSLKFQLYDMPSERVITAGIVERIGLKDSIFTITVDGEKIKEIIDIPDHEIAVQMLLEKLINHKVIGSYDEITGIGHRVVHGGERFPESVYIDDQVIKDIEALSELAPLHNPANVTGIKAFRKILPDVVSVAVFDTAFHQTMPPASYLYSLPYSYYEDYGIRKYGFHGTSHKYVSERAAELLGRPVEELRLLTCHLGNGASIAAIEGGKSMDTSMGFTPLAGVSMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLDVLNKESGMLGVSGISSDLRDLEDEAAKGNDRAELALQVFVDRIHKYIGSYAARMNGVDAIIFTAGIGENSSYIREKVLRGLEFMGVYWDPALNQVRGEERFLNYPHSPVKVIIIPTNEELMIARDVETIKNNR
Complex: ADP_B_5(1TUY) / Model_21(1TUY/B) = [4.5] Download1149.67-9.38MEKTIAINAGSSSLKFQLYDMPSERVITAGIVERIGLKDSIFTITVDGEKIKEIIDIPDHEIAVQMLLEKLINHKVIGSYDEITGIGHRVVHGGERFPESVYIDDQVIKDIEALSELAPLHNPANVTGIKAFRKILPDVVSVAVFDTAFHQTMPPASYLYSLPYSYYEDYGIRKYGFHGTSHKYVSERAAELLGRPVEELRLLTCHLGNGASIAAIEGGKSMDTSMGFTPLAGVSMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLDVLNKESGMLGVSGISSDLRDLEDEAAKGNDRAELALQVFVDRIHKYIGSYAARMNGVDAIIFTAGIGENSSYIREKVLRGLEFMGVYWDPALNQVRGEERFLNYPHSPVKVIIIPTNEELMIARDVETIKNNR
Complex: AMP_F_6(1TUU) / Model_22(1TUU/B) = [4.6] Download1298.86-7.95MEKTIAINAGSSSLKFQLYDMPSERVITAGIVERIGLKDSIFTITVDGEKIKEIIDIPDHEIAVQMLLEKLINHKVIGSYDEITGIGHRVVHGGERFPESVYIDDQVIKDIEALSELAPLHNPANVTGIKAFRKILPDVVSVAVFDTAFHQTMPPASYLYSLPYSYYEDYGIRKYGFHGTSHKYVSERAAELLGRPVEELRLLTCHLGNGASIAAIEGGKSMDTSMGFTPLAGVSMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLDVLNKESGMLGVSGISSDLRDLEDEAAKGNDRAELALQVFVDRIHKYIGSYAARMNGVDAIIFTAGIGENSSYIREKVLRGLEFMGVYWDPALNQVRGEERFLNYPHSPVKVIIIPTNEELMIARDVETIKNNR
Complex: AMP_A_3(4FWK) / Model_10(4FWK/A) = [5.3] Download1199.83-7.10MEKTIAINAGSSSLKFQLYDMPSERVITAGIVERIGLKDSIFTITVDGEKIKEIIDIPDHEIAVQMLLEKLINHKVIGSYDEITGIGHRVVHGGERFPESVYIDDQVIKDIEALSELAPLHNPANVTGIKAFRKILPDVVSVAVFDTAFHQTMPPASYLYSLPYSYYEDYGIRKYGFHGTSHKYVSERAAELLGRPVEELRLLTCHLGNGASIAAIEGGKSMDTSMGFTPLAGVSMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLDVLNKESGMLGVSGISSDLRDLEDEAAKGNDRAELALQVFVDRIHKYIGSYAARMNGVDAIIFTAGIGENSSYIREKVLRGLEFMGVYWDPALNQVRGEERFLNYPHSPVKVIIIPTNEELMIARDVETIKNNR
Consensus
[pKd Mean = 4.32]
-1119
(s=315)
-6
(s=5)
MEKTIAINAGSSSLKFQLYDMPSERVITAGIVERIGLKDSIFTITVDGEKIKEIIDIPDHEIAVQMLLEKLINHKVIGSYDEITGIGHRVVHGGERFPESVYIDDQVIKDIEALSELAPLHNPANVTGIKAFRKILPDVVSVAVFDTAFHQTMPPASYLYSLPYSYYEDYGIRKYGFHGTSHKYVSERAAELLGRPVEELRLLTCHLGNGASIAAIEGGKSMDTSMGFTPLAGVSMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLDVLNKESGMLGVSGISSDLRDLEDEAAKGNDRAELALQVFVDRIHKYIGSYAARMNGVDAIIFTAGIGENSSYIREKVLRGLEFMGVYWDPALNQVRGEERFLNYPHSPVKVIIIPTNEELMIARDVETIKNNR