Study : Lmo1947 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C2_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C2_S1
Complex: ADP_A_2(4JAU) / Model_8(4JAU/A) = [5.2] Download1077.9717.93MKIWNSIVGKIWSTIILLLIGILVISGFLVAMIYEKNNITRITNELEDKTASIITVMQENNEVISAENNNDSALILLDDTMGVIIEQNGKSVYQSQSPDTISSASANKLIQDKTLDKALEKDNSVTMKYNFKTEKSSLPVEISAQKFKLANGETGVVYVYQSYHDILKVNEKTMSTLIISGIIAIVITSILSFVFSSRMAFPLREMKKIAIAVSKGNFDNRVPTYTHDEIGELGVAFNDMAKQLKYNVSALRQEKEQLSNILVGMADGVIKFSVDKTIILSNPPAEEFLHNWFFSPENTEKVLIPVALNELLNDTLEKKESQVGEITFADHTYVAILTLLYTGEHVRSIVAVIRDMTEEKQLEKMKSDFVNNVSHELRTPISMLQGYSEAIIDGVAQSDEEVREFAQIIYDESLRIGRLVNDMLDLARMEAGFNQMDNQKLPLAPLLRKVISNFDVLAKENFVELGLELETPDLEYSYDPDRMEQVLINLIMNAIRHTGKEGYDGKVILKQTIDVARSNLVITVSDNGSGIAEEDIPYLFERFYKVDKARKRGKAVGTGIGLAIVKNIVEAHNGKISVESELGKGSDFIITLPLYK
Complex: ADP_B_13(4JAV) / Model_22(4JAV/B) = [5.4] Download774.9624.27MKIWNSIVGKIWSTIILLLIGILVISGFLVAMIYEKNNITRITNELEDKTASIITVMQENNEVISAENNNDSALILLDDTMGVIIEQNGKSVYQSQSPDTISSASANKLIQDKTLDKALEKDNSVTMKYNFKTEKSSLPVEISAQKFKLANGETGVVYVYQSYHDILKVNEKTMSTLIISGIIAIVITSILSFVFSSRMAFPLREMKKIAIAVSKGNFDNRVPTYTHDEIGELGVAFNDMAKQLKYNVSALRQEKEQLSNILVGMADGVIKFSVDKTIILSNPPAEEFLHNWFFSPENTEKVLIPVALNELLNDTLEKKESQVGEITFADHTYVAILTLLYTGEHVRSIVAVIRDMTEEKQLEKMKSDFVNNVSHELRTPISMLQGYSEAIIDGVAQSDEEVREFAQIIYDESLRIGRLVNDMLDLARMEAGFNQMDNQKLPLAPLLRKVISNFDVLAKENFVELGLELETPDLEYSYDPDRMEQVLINLIMNAIRHTGKEGYDGKVILKQTIDVARSNLVITVSDNGSGIAEEDIPYLFERFYKVDKARKRGKAVGTGIGLAIVKNIVEAHNGKISVESELGKGSDFIITLPLYK
Complex: ADP_A_2(2C2A) / Model_39(2C2A/A) = [5.5] Download1043.6416.73MKIWNSIVGKIWSTIILLLIGILVISGFLVAMIYEKNNITRITNELEDKTASIITVMQENNEVISAENNNDSALILLDDTMGVIIEQNGKSVYQSQSPDTISSASANKLIQDKTLDKALEKDNSVTMKYNFKTEKSSLPVEISAQKFKLANGETGVVYVYQSYHDILKVNEKTMSTLIISGIIAIVITSILSFVFSSRMAFPLREMKKIAIAVSKGNFDNRVPTYTHDEIGELGVAFNDMAKQLKYNVSALRQEKEQLSNILVGMADGVIKFSVDKTIILSNPPAEEFLHNWFFSPENTEKVLIPVALNELLNDTLEKKESQVGEITFADHTYVAILTLLYTGEHVRSIVAVIRDMTEEKQLEKMKSDFVNNVSHELRTPISMLQGYSEAIIDGVAQSDEEVREFAQIIYDESLRIGRLVNDMLDLARMEAGFNQMDNQKLPLAPLLRKVISNFDVLAKENFVELGLELETPDLEYSYDPDRMEQVLINLIMNAIRHTGKEGYDGKVILKQTIDVARSNLVITVSDNGSGIAEEDIPYLFERFYKVDKARKRGKAVGTGIGLAIVKNIVEAHNGKISVESELGKGSDFIITLPLYK
Complex: ADP_A_2(2C2A) / Model_6(2C2A/A) = [5.5] Download1158.0816.73MKIWNSIVGKIWSTIILLLIGILVISGFLVAMIYEKNNITRITNELEDKTASIITVMQENNEVISAENNNDSALILLDDTMGVIIEQNGKSVYQSQSPDTISSASANKLIQDKTLDKALEKDNSVTMKYNFKTEKSSLPVEISAQKFKLANGETGVVYVYQSYHDILKVNEKTMSTLIISGIIAIVITSILSFVFSSRMAFPLREMKKIAIAVSKGNFDNRVPTYTHDEIGELGVAFNDMAKQLKYNVSALRQEKEQLSNILVGMADGVIKFSVDKTIILSNPPAEEFLHNWFFSPENTEKVLIPVALNELLNDTLEKKESQVGEITFADHTYVAILTLLYTGEHVRSIVAVIRDMTEEKQLEKMKSDFVNNVSHELRTPISMLQGYSEAIIDGVAQSDEEVREFAQIIYDESLRIGRLVNDMLDLARMEAGFNQMDNQKLPLAPLLRKVISNFDVLAKENFVELGLELETPDLEYSYDPDRMEQVLINLIMNAIRHTGKEGYDGKVILKQTIDVARSNLVITVSDNGSGIAEEDIPYLFERFYKVDKARKRGKAVGTGIGLAIVKNIVEAHNGKISVESELGKGSDFIITLPLYK
Complex: ATP_A_3(4CB0) / Model_16(4CB0/A) = [5.7] Download861.5223.64MKIWNSIVGKIWSTIILLLIGILVISGFLVAMIYEKNNITRITNELEDKTASIITVMQENNEVISAENNNDSALILLDDTMGVIIEQNGKSVYQSQSPDTISSASANKLIQDKTLDKALEKDNSVTMKYNFKTEKSSLPVEISAQKFKLANGETGVVYVYQSYHDILKVNEKTMSTLIISGIIAIVITSILSFVFSSRMAFPLREMKKIAIAVSKGNFDNRVPTYTHDEIGELGVAFNDMAKQLKYNVSALRQEKEQLSNILVGMADGVIKFSVDKTIILSNPPAEEFLHNWFFSPENTEKVLIPVALNELLNDTLEKKESQVGEITFADHTYVAILTLLYTGEHVRSIVAVIRDMTEEKQLEKMKSDFVNNVSHELRTPISMLQGYSEAIIDGVAQSDEEVREFAQIIYDESLRIGRLVNDMLDLARMEAGFNQMDNQKLPLAPLLRKVISNFDVLAKENFVELGLELETPDLEYSYDPDRMEQVLINLIMNAIRHTGKEGYDGKVILKQTIDVARSNLVITVSDNGSGIAEEDIPYLFERFYKVDKARKRGKAVGTGIGLAIVKNIVEAHNGKISVESELGKGSDFIITLPLYK
Consensus
[pKd Mean = 5.46]
-983
(s=142)
19
(s=3)
MKIWNSIVGKIWSTIILLLIGILVISGFLVAMIYEKNNITRITNELEDKTASIITVMQENNEVISAENNNDSALILLDDTMGVIIEQNGKSVYQSQSPDTISSASANKLIQDKTLDKALEKDNSVTMKYNFKTEKSSLPVEISAQKFKLANGETGVVYVYQSYHDILKVNEKTMSTLIISGIIAIVITSILSFVFSSRMAFPLREMKKIAIAVSKGNFDNRVPTYTHDEIGELGVAFNDMAKQLKYNVSALRQEKEQLSNILVGMADGVIKFSVDKTIILSNPPAEEFLHNWFFSPENTEKVLIPVALNELLNDTLEKKESQVGEITFADHTYVAILTLLYTGEHVRSIVAVIRDMTEEKQLEKMKSDFVNNVSHELRTPISMLQGYSEAIIDGVAQSDEEVREFAQIIYDESLRIGRLVNDMLDLARMEAGFNQMDNQKLPLAPLLRKVISNFDVLAKENFVELGLELETPDLEYSYDPDRMEQVLINLIMNAIRHTGKEGYDGKVILKQTIDVARSNLVITVSDNGSGIAEEDIPYLFERFYKVDKARKRGKAVGTGIGLAIVKNIVEAHNGKISVESELGKGSDFIITLPLYK