Study : gbs0288 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C1_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C1_S1
Complex: EDO_B_11(2C5W) / Model_4(2C5W/B) = [3.1] Download389.8926.73MKKESVIKLLKYAFGIIMGFIILAIVIGGLLFAYYVSRSPKLTDQALKSVNSSLVYDGNNKLIADLGSEKRESVSADSIPLNLVNAITSIEDKRFFKHRGVDIYRILGAAWHNLVSSNTQGGSTLDQQLIKLAYFSTNKSDQTLKRKSQEVWLALQMERKYTKEEILTFYINKVYMGNGNYGMRTTAKSYFGKDLKELSIAQLALLAGIPQAPTQYDPYKNPESAQTRRNTVLQQMYQDKNISKKEYDQAVATPVTDGLKELKQKSTYPKYMDNYLKQVISEVKQKTGKDIFTAGLKVYTNINTDAQKQLYDIYNSDTYIAYPNNELQIASTIMDATNGKVIAQLGGRHQNENISFGTNQSVLTDRDWGSTMKPISAYAPAIDSGVYNSTGQSLNDSVYYWPGTSTQLYDWDRQYMGWMSMQTAIQQSRNVPAVRALEAAGLDEAKSFLEKLGIYYPEMNYSNAISSNNSSSDAKYGASSEKMAAAYSAFANGGTYYKPQYVNKIEFSDGTNDTYAASGSRAMKETTAYMMTDMLKTVLTFGTGTKAAIPGVAQAGKTGTSNYTEDELAKIEATTGIYNSAVGTMAPDENFVGYTSKYTMAIWTGYKNRLTPLYGSQLDIATEVYRAMMSYLTGGYSADWTMPEGLYRSGSYLYINGTTTTGTYSSSVYKNIYQNSGQSSQSSSSTSSEKQKEDKNTANDANSSSPQVETPNNGNATTPNNSNQTVPGTGHGNGNGNNNTVPNGN
Complex: TEB_B_13(2ZC6) / Model_3(2ZC6/B) = [3.2] Download1190.2712.73MKKESVIKLLKYAFGIIMGFIILAIVIGGLLFAYYVSRSPKLTDQALKSVNSSLVYDGNNKLIADLGSEKRESVSADSIPLNLVNAITSIEDKRFFKHRGVDIYRILGAAWHNLVSSNTQGGSTLDQQLIKLAYFSTNKSDQTLKRKSQEVWLALQMERKYTKEEILTFYINKVYMGNGNYGMRTTAKSYFGKDLKELSIAQLALLAGIPQAPTQYDPYKNPESAQTRRNTVLQQMYQDKNISKKEYDQAVATPVTDGLKELKQKSTYPKYMDNYLKQVISEVKQKTGKDIFTAGLKVYTNINTDAQKQLYDIYNSDTYIAYPNNELQIASTIMDATNGKVIAQLGGRHQNENISFGTNQSVLTDRDWGSTMKPISAYAPAIDSGVYNSTGQSLNDSVYYWPGTSTQLYDWDRQYMGWMSMQTAIQQSRNVPAVRALEAAGLDEAKSFLEKLGIYYPEMNYSNAISSNNSSSDAKYGASSEKMAAAYSAFANGGTYYKPQYVNKIEFSDGTNDTYAASGSRAMKETTAYMMTDMLKTVLTFGTGTKAAIPGVAQAGKTGTSNYTEDELAKIEATTGIYNSAVGTMAPDENFVGYTSKYTMAIWTGYKNRLTPLYGSQLDIATEVYRAMMSYLTGGYSADWTMPEGLYRSGSYLYINGTTTTGTYSSSVYKNIYQNSGQSSQSSSSTSSEKQKEDKNTANDANSSSPQVETPNNGNATTPNNSNQTVPGTGHGNGNGNNNTVPNGN
Complex: TEB_D_14(2ZC6) / Model_21(2ZC6/D) = [3.2] Download1079.3810.50MKKESVIKLLKYAFGIIMGFIILAIVIGGLLFAYYVSRSPKLTDQALKSVNSSLVYDGNNKLIADLGSEKRESVSADSIPLNLVNAITSIEDKRFFKHRGVDIYRILGAAWHNLVSSNTQGGSTLDQQLIKLAYFSTNKSDQTLKRKSQEVWLALQMERKYTKEEILTFYINKVYMGNGNYGMRTTAKSYFGKDLKELSIAQLALLAGIPQAPTQYDPYKNPESAQTRRNTVLQQMYQDKNISKKEYDQAVATPVTDGLKELKQKSTYPKYMDNYLKQVISEVKQKTGKDIFTAGLKVYTNINTDAQKQLYDIYNSDTYIAYPNNELQIASTIMDATNGKVIAQLGGRHQNENISFGTNQSVLTDRDWGSTMKPISAYAPAIDSGVYNSTGQSLNDSVYYWPGTSTQLYDWDRQYMGWMSMQTAIQQSRNVPAVRALEAAGLDEAKSFLEKLGIYYPEMNYSNAISSNNSSSDAKYGASSEKMAAAYSAFANGGTYYKPQYVNKIEFSDGTNDTYAASGSRAMKETTAYMMTDMLKTVLTFGTGTKAAIPGVAQAGKTGTSNYTEDELAKIEATTGIYNSAVGTMAPDENFVGYTSKYTMAIWTGYKNRLTPLYGSQLDIATEVYRAMMSYLTGGYSADWTMPEGLYRSGSYLYINGTTTTGTYSSSVYKNIYQNSGQSSQSSSSTSSEKQKEDKNTANDANSSSPQVETPNNGNATTPNNSNQTVPGTGHGNGNGNNNTVPNGN
Complex: PCZ_B_12(2C5W) / Model_4(2C5W/B) = [3.8] Download1013.764.95MKKESVIKLLKYAFGIIMGFIILAIVIGGLLFAYYVSRSPKLTDQALKSVNSSLVYDGNNKLIADLGSEKRESVSADSIPLNLVNAITSIEDKRFFKHRGVDIYRILGAAWHNLVSSNTQGGSTLDQQLIKLAYFSTNKSDQTLKRKSQEVWLALQMERKYTKEEILTFYINKVYMGNGNYGMRTTAKSYFGKDLKELSIAQLALLAGIPQAPTQYDPYKNPESAQTRRNTVLQQMYQDKNISKKEYDQAVATPVTDGLKELKQKSTYPKYMDNYLKQVISEVKQKTGKDIFTAGLKVYTNINTDAQKQLYDIYNSDTYIAYPNNELQIASTIMDATNGKVIAQLGGRHQNENISFGTNQSVLTDRDWGSTMKPISAYAPAIDSGVYNSTGQSLNDSVYYWPGTSTQLYDWDRQYMGWMSMQTAIQQSRNVPAVRALEAAGLDEAKSFLEKLGIYYPEMNYSNAISSNNSSSDAKYGASSEKMAAAYSAFANGGTYYKPQYVNKIEFSDGTNDTYAASGSRAMKETTAYMMTDMLKTVLTFGTGTKAAIPGVAQAGKTGTSNYTEDELAKIEATTGIYNSAVGTMAPDENFVGYTSKYTMAIWTGYKNRLTPLYGSQLDIATEVYRAMMSYLTGGYSADWTMPEGLYRSGSYLYINGTTTTGTYSSSVYKNIYQNSGQSSQSSSSTSSEKQKEDKNTANDANSSSPQVETPNNGNATTPNNSNQTVPGTGHGNGNGNNNTVPNGN
Complex: BMG_D_14(2ZC5) / Model_22(2ZC5/D) = [4.7] Download941.4010.17MKKESVIKLLKYAFGIIMGFIILAIVIGGLLFAYYVSRSPKLTDQALKSVNSSLVYDGNNKLIADLGSEKRESVSADSIPLNLVNAITSIEDKRFFKHRGVDIYRILGAAWHNLVSSNTQGGSTLDQQLIKLAYFSTNKSDQTLKRKSQEVWLALQMERKYTKEEILTFYINKVYMGNGNYGMRTTAKSYFGKDLKELSIAQLALLAGIPQAPTQYDPYKNPESAQTRRNTVLQQMYQDKNISKKEYDQAVATPVTDGLKELKQKSTYPKYMDNYLKQVISEVKQKTGKDIFTAGLKVYTNINTDAQKQLYDIYNSDTYIAYPNNELQIASTIMDATNGKVIAQLGGRHQNENISFGTNQSVLTDRDWGSTMKPISAYAPAIDSGVYNSTGQSLNDSVYYWPGTSTQLYDWDRQYMGWMSMQTAIQQSRNVPAVRALEAAGLDEAKSFLEKLGIYYPEMNYSNAISSNNSSSDAKYGASSEKMAAAYSAFANGGTYYKPQYVNKIEFSDGTNDTYAASGSRAMKETTAYMMTDMLKTVLTFGTGTKAAIPGVAQAGKTGTSNYTEDELAKIEATTGIYNSAVGTMAPDENFVGYTSKYTMAIWTGYKNRLTPLYGSQLDIATEVYRAMMSYLTGGYSADWTMPEGLYRSGSYLYINGTTTTGTYSSSVYKNIYQNSGQSSQSSSSTSSEKQKEDKNTANDANSSSPQVETPNNGNATTPNNSNQTVPGTGHGNGNGNNNTVPNGN
Consensus
[pKd Mean = 3.60]
-922
(s=278)
13
(s=7)
MKKESVIKLLKYAFGIIMGFIILAIVIGGLLFAYYVSRSPKLTDQALKSVNSSLVYDGNNKLIADLGSEKRESVSADSIPLNLVNAITSIEDKRFFKHRGVDIYRILGAAWHNLVSSNTQGGSTLDQQLIKLAYFSTNKSDQTLKRKSQEVWLALQMERKYTKEEILTFYINKVYMGNGNYGMRTTAKSYFGKDLKELSIAQLALLAGIPQAPTQYDPYKNPESAQTRRNTVLQQMYQDKNISKKEYDQAVATPVTDGLKELKQKSTYPKYMDNYLKQVISEVKQKTGKDIFTAGLKVYTNINTDAQKQLYDIYNSDTYIAYPNNELQIASTIMDATNGKVIAQLGGRHQNENISFGTNQSVLTDRDWGSTMKPISAYAPAIDSGVYNSTGQSLNDSVYYWPGTSTQLYDWDRQYMGWMSMQTAIQQSRNVPAVRALEAAGLDEAKSFLEKLGIYYPEMNYSNAISSNNSSSDAKYGASSEKMAAAYSAFANGGTYYKPQYVNKIEFSDGTNDTYAASGSRAMKETTAYMMTDMLKTVLTFGTGTKAAIPGVAQAGKTGTSNYTEDELAKIEATTGIYNSAVGTMAPDENFVGYTSKYTMAIWTGYKNRLTPLYGSQLDIATEVYRAMMSYLTGGYSADWTMPEGLYRSGSYLYINGTTTTGTYSSSVYKNIYQNSGQSSQSSSSTSSEKQKEDKNTANDANSSSPQVETPNNGNATTPNNSNQTVPGTGHGNGNGNNNTVPNGN