Study : gbs1740 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C1_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C1_S1
Complex: ADP_B_6(2HYD) / Model_22(2HYD/B) = [4.5] Download1017.5812.00MKSKLMDKYGITEDSSIDLIKASIASFWKNVVYMFPITLILFFLMNISNSKYLQEWFYFVSILIVFVVMYYFTNRQYIKSYSTTFKGSKNLRIELVEIIKRLPLSYFSTHDLTDLSQTVMADVSKIEQALSHAICAYYGWIGYFVFLSLSLLIGSLQLGLCIIVPVITALLILYLSKNIQYRINRKYYKKLRENSQAFQDSFEMQQDIKSYNMQHTVRKDVQDKLKDSEKIQIKTELFTTIPSSLLSILPQFSIALVIIFGFQLYLTGQIQLIFYIGYIICATKVASGFTGMLDSLLMIINFQSSFKQVTAIRKTPLQEGVNADIQTFNVEFRDVSFAYEKGRNVVSNLSFNANQGEVTAIVGPSGCGKSTILKLLSRLYDYNAGQILIGGKDISEISTNSLFENISTVFQDVELFDDTIFENIKCGNPKATIEEVLEAAKIANVDEIADKFVDKYDTKIGENGSKLSGGERQRISIARAILKDAPIILLDEISASLDIENEIKIQAGLDKLIKNKTVIIVSHRMKSIENANKIIVIENGKVENFGTHSYLLENSTRYRKLVECSQLASEYEY
Complex: ADP_A_5(2HYD) / Model_11(2HYD/A) = [4.8] Download1054.4915.94MKSKLMDKYGITEDSSIDLIKASIASFWKNVVYMFPITLILFFLMNISNSKYLQEWFYFVSILIVFVVMYYFTNRQYIKSYSTTFKGSKNLRIELVEIIKRLPLSYFSTHDLTDLSQTVMADVSKIEQALSHAICAYYGWIGYFVFLSLSLLIGSLQLGLCIIVPVITALLILYLSKNIQYRINRKYYKKLRENSQAFQDSFEMQQDIKSYNMQHTVRKDVQDKLKDSEKIQIKTELFTTIPSSLLSILPQFSIALVIIFGFQLYLTGQIQLIFYIGYIICATKVASGFTGMLDSLLMIINFQSSFKQVTAIRKTPLQEGVNADIQTFNVEFRDVSFAYEKGRNVVSNLSFNANQGEVTAIVGPSGCGKSTILKLLSRLYDYNAGQILIGGKDISEISTNSLFENISTVFQDVELFDDTIFENIKCGNPKATIEEVLEAAKIANVDEIADKFVDKYDTKIGENGSKLSGGERQRISIARAILKDAPIILLDEISASLDIENEIKIQAGLDKLIKNKTVIIVSHRMKSIENANKIIVIENGKVENFGTHSYLLENSTRYRKLVECSQLASEYEY
Complex: ANP_A_2(4AYW) / Model_39(4AYW/A) = [5.5] Download1361.8916.55MKSKLMDKYGITEDSSIDLIKASIASFWKNVVYMFPITLILFFLMNISNSKYLQEWFYFVSILIVFVVMYYFTNRQYIKSYSTTFKGSKNLRIELVEIIKRLPLSYFSTHDLTDLSQTVMADVSKIEQALSHAICAYYGWIGYFVFLSLSLLIGSLQLGLCIIVPVITALLILYLSKNIQYRINRKYYKKLRENSQAFQDSFEMQQDIKSYNMQHTVRKDVQDKLKDSEKIQIKTELFTTIPSSLLSILPQFSIALVIIFGFQLYLTGQIQLIFYIGYIICATKVASGFTGMLDSLLMIINFQSSFKQVTAIRKTPLQEGVNADIQTFNVEFRDVSFAYEKGRNVVSNLSFNANQGEVTAIVGPSGCGKSTILKLLSRLYDYNAGQILIGGKDISEISTNSLFENISTVFQDVELFDDTIFENIKCGNPKATIEEVLEAAKIANVDEIADKFVDKYDTKIGENGSKLSGGERQRISIARAILKDAPIILLDEISASLDIENEIKIQAGLDKLIKNKTVIIVSHRMKSIENANKIIVIENGKVENFGTHSYLLENSTRYRKLVECSQLASEYEY
Complex: ACP_A_4(4AYX) / Model_35(4AYX/A) = [5.8] Download1201.4118.90MKSKLMDKYGITEDSSIDLIKASIASFWKNVVYMFPITLILFFLMNISNSKYLQEWFYFVSILIVFVVMYYFTNRQYIKSYSTTFKGSKNLRIELVEIIKRLPLSYFSTHDLTDLSQTVMADVSKIEQALSHAICAYYGWIGYFVFLSLSLLIGSLQLGLCIIVPVITALLILYLSKNIQYRINRKYYKKLRENSQAFQDSFEMQQDIKSYNMQHTVRKDVQDKLKDSEKIQIKTELFTTIPSSLLSILPQFSIALVIIFGFQLYLTGQIQLIFYIGYIICATKVASGFTGMLDSLLMIINFQSSFKQVTAIRKTPLQEGVNADIQTFNVEFRDVSFAYEKGRNVVSNLSFNANQGEVTAIVGPSGCGKSTILKLLSRLYDYNAGQILIGGKDISEISTNSLFENISTVFQDVELFDDTIFENIKCGNPKATIEEVLEAAKIANVDEIADKFVDKYDTKIGENGSKLSGGERQRISIARAILKDAPIILLDEISASLDIENEIKIQAGLDKLIKNKTVIIVSHRMKSIENANKIIVIENGKVENFGTHSYLLENSTRYRKLVECSQLASEYEY
Complex: ANP_A_8(2ONJ) / Model_12(2ONJ/A) = [6.0] Download996.817.86MKSKLMDKYGITEDSSIDLIKASIASFWKNVVYMFPITLILFFLMNISNSKYLQEWFYFVSILIVFVVMYYFTNRQYIKSYSTTFKGSKNLRIELVEIIKRLPLSYFSTHDLTDLSQTVMADVSKIEQALSHAICAYYGWIGYFVFLSLSLLIGSLQLGLCIIVPVITALLILYLSKNIQYRINRKYYKKLRENSQAFQDSFEMQQDIKSYNMQHTVRKDVQDKLKDSEKIQIKTELFTTIPSSLLSILPQFSIALVIIFGFQLYLTGQIQLIFYIGYIICATKVASGFTGMLDSLLMIINFQSSFKQVTAIRKTPLQEGVNADIQTFNVEFRDVSFAYEKGRNVVSNLSFNANQGEVTAIVGPSGCGKSTILKLLSRLYDYNAGQILIGGKDISEISTNSLFENISTVFQDVELFDDTIFENIKCGNPKATIEEVLEAAKIANVDEIADKFVDKYDTKIGENGSKLSGGERQRISIARAILKDAPIILLDEISASLDIENEIKIQAGLDKLIKNKTVIIVSHRMKSIENANKIIVIENGKVENFGTHSYLLENSTRYRKLVECSQLASEYEY
Consensus
[pKd Mean = 5.32]
-1126
(s=137)
14
(s=3)
MKSKLMDKYGITEDSSIDLIKASIASFWKNVVYMFPITLILFFLMNISNSKYLQEWFYFVSILIVFVVMYYFTNRQYIKSYSTTFKGSKNLRIELVEIIKRLPLSYFSTHDLTDLSQTVMADVSKIEQALSHAICAYYGWIGYFVFLSLSLLIGSLQLGLCIIVPVITALLILYLSKNIQYRINRKYYKKLRENSQAFQDSFEMQQDIKSYNMQHTVRKDVQDKLKDSEKIQIKTELFTTIPSSLLSILPQFSIALVIIFGFQLYLTGQIQLIFYIGYIICATKVASGFTGMLDSLLMIINFQSSFKQVTAIRKTPLQEGVNADIQTFNVEFRDVSFAYEKGRNVVSNLSFNANQGEVTAIVGPSGCGKSTILKLLSRLYDYNAGQILIGGKDISEISTNSLFENISTVFQDVELFDDTIFENIKCGNPKATIEEVLEAAKIANVDEIADKFVDKYDTKIGENGSKLSGGERQRISIARAILKDAPIILLDEISASLDIENEIKIQAGLDKLIKNKTVIIVSHRMKSIENANKIIVIENGKVENFGTHSYLLENSTRYRKLVECSQLASEYEY