Study : bsu27510 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C2_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C2_S1
Complex: PLP_B_8(3A9Y) / Model_30(3A9Y/B) = [3.2] Download516.357.09MERIYLDHAATSPMDERVLEQMIPHFSGSFGNPSSIHSFGRESRKWVDEARAQIAAEIGAAEQEIIFTSGGTEADNLAIMGTALARKDLGRHIITTKIEHHAVLHTCEKLEGDGFDITYLDVDQNGRVSAKQVKEALRDDTILVTVMYGNNEVGTVQPIEEIGELLKEHKAYFHTDAVQAFGLLPIDVKNSHIDLLSVSGHKLNGPKGTGFLYASKDVKLSPLLFGGEQERKRRAGTENVPGIVGLKEAIKLSSEERDEKNEKYQSFKAIFADTLRDAGVAFEVNGDKEHSLPHVLNLYFPGVSVEALLVNLDMAGVAVSSGSACTAGSVLPSHVLTAMFGEESDRLTSSIRISFGLGNTAEQVKTAAKHVADVVKRLT
Complex: GOL_G_7(1T3I) / Model_32(1T3I/B) = [3.2] Download545.6410.00MERIYLDHAATSPMDERVLEQMIPHFSGSFGNPSSIHSFGRESRKWVDEARAQIAAEIGAAEQEIIFTSGGTEADNLAIMGTALARKDLGRHIITTKIEHHAVLHTCEKLEGDGFDITYLDVDQNGRVSAKQVKEALRDDTILVTVMYGNNEVGTVQPIEEIGELLKEHKAYFHTDAVQAFGLLPIDVKNSHIDLLSVSGHKLNGPKGTGFLYASKDVKLSPLLFGGEQERKRRAGTENVPGIVGLKEAIKLSSEERDEKNEKYQSFKAIFADTLRDAGVAFEVNGDKEHSLPHVLNLYFPGVSVEALLVNLDMAGVAVSSGSACTAGSVLPSHVLTAMFGEESDRLTSSIRISFGLGNTAEQVKTAAKHVADVVKRLT
Complex: PLP_A_3(3LVK) / Model_2(3LVK/A) = [3.5] Download563.209.68MERIYLDHAATSPMDERVLEQMIPHFSGSFGNPSSIHSFGRESRKWVDEARAQIAAEIGAAEQEIIFTSGGTEADNLAIMGTALARKDLGRHIITTKIEHHAVLHTCEKLEGDGFDITYLDVDQNGRVSAKQVKEALRDDTILVTVMYGNNEVGTVQPIEEIGELLKEHKAYFHTDAVQAFGLLPIDVKNSHIDLLSVSGHKLNGPKGTGFLYASKDVKLSPLLFGGEQERKRRAGTENVPGIVGLKEAIKLSSEERDEKNEKYQSFKAIFADTLRDAGVAFEVNGDKEHSLPHVLNLYFPGVSVEALLVNLDMAGVAVSSGSACTAGSVLPSHVLTAMFGEESDRLTSSIRISFGLGNTAEQVKTAAKHVADVVKRLT
Complex: CYS_F_6(1ECX) / Model_25(1ECX/B) = [3.6] Download660.3211.17MERIYLDHAATSPMDERVLEQMIPHFSGSFGNPSSIHSFGRESRKWVDEARAQIAAEIGAAEQEIIFTSGGTEADNLAIMGTALARKDLGRHIITTKIEHHAVLHTCEKLEGDGFDITYLDVDQNGRVSAKQVKEALRDDTILVTVMYGNNEVGTVQPIEEIGELLKEHKAYFHTDAVQAFGLLPIDVKNSHIDLLSVSGHKLNGPKGTGFLYASKDVKLSPLLFGGEQERKRRAGTENVPGIVGLKEAIKLSSEERDEKNEKYQSFKAIFADTLRDAGVAFEVNGDKEHSLPHVLNLYFPGVSVEALLVNLDMAGVAVSSGSACTAGSVLPSHVLTAMFGEESDRLTSSIRISFGLGNTAEQVKTAAKHVADVVKRLT
Complex: PLP_A_6(1EG5) / Model_10(1EG5/A) = [3.6] Download616.8412.91MERIYLDHAATSPMDERVLEQMIPHFSGSFGNPSSIHSFGRESRKWVDEARAQIAAEIGAAEQEIIFTSGGTEADNLAIMGTALARKDLGRHIITTKIEHHAVLHTCEKLEGDGFDITYLDVDQNGRVSAKQVKEALRDDTILVTVMYGNNEVGTVQPIEEIGELLKEHKAYFHTDAVQAFGLLPIDVKNSHIDLLSVSGHKLNGPKGTGFLYASKDVKLSPLLFGGEQERKRRAGTENVPGIVGLKEAIKLSSEERDEKNEKYQSFKAIFADTLRDAGVAFEVNGDKEHSLPHVLNLYFPGVSVEALLVNLDMAGVAVSSGSACTAGSVLPSHVLTAMFGEESDRLTSSIRISFGLGNTAEQVKTAAKHVADVVKRLT
Consensus
[pKd Mean = 3.42]
-580
(s=51)
10
(s=1)
MERIYLDHAATSPMDERVLEQMIPHFSGSFGNPSSIHSFGRESRKWVDEARAQIAAEIGAAEQEIIFTSGGTEADNLAIMGTALARKDLGRHIITTKIEHHAVLHTCEKLEGDGFDITYLDVDQNGRVSAKQVKEALRDDTILVTVMYGNNEVGTVQPIEEIGELLKEHKAYFHTDAVQAFGLLPIDVKNSHIDLLSVSGHKLNGPKGTGFLYASKDVKLSPLLFGGEQERKRRAGTENVPGIVGLKEAIKLSSEERDEKNEKYQSFKAIFADTLRDAGVAFEVNGDKEHSLPHVLNLYFPGVSVEALLVNLDMAGVAVSSGSACTAGSVLPSHVLTAMFGEESDRLTSSIRISFGLGNTAEQVKTAAKHVADVVKRLT