Study : bsu29190 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C3_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C3_S1
Complex: PEP_B_6(4I4I) / Model_6(4I4I/A) = [3.1] Download425.60-7.33MKRIGVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRKAIYHDVEVYGIYNGYAGLISGKIEKLELGSVGDIIHRGGTKLYTARCPEFKTVEGREKGIANLKKLGIEGLVVIGGDGSYMGAKKLTEHGFPCVGVPGTIDNDIPGTDFTIGFDTALNTVIDAIDKIRDTATSHERTYVIEVMGRHAGDIALWAGLAGGAESILIPEADYDMHEIIARLKRGHERGKKHSIIIVAEGVGSGVEFGKRIEEETNLETRVSVLGHIQRGGSPSAADRVLASRLGAYAVELLLEGKGGRCVGIQNNKLVDHDIIEILETKHTVEQNMYQLSKELSI
Complex: PEP_D_8(4I7E) / Model_31(4I7E/C) = [3.1] Download479.99-3.00MKRIGVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRKAIYHDVEVYGIYNGYAGLISGKIEKLELGSVGDIIHRGGTKLYTARCPEFKTVEGREKGIANLKKLGIEGLVVIGGDGSYMGAKKLTEHGFPCVGVPGTIDNDIPGTDFTIGFDTALNTVIDAIDKIRDTATSHERTYVIEVMGRHAGDIALWAGLAGGAESILIPEADYDMHEIIARLKRGHERGKKHSIIIVAEGVGSGVEFGKRIEEETNLETRVSVLGHIQRGGSPSAADRVLASRLGAYAVELLLEGKGGRCVGIQNNKLVDHDIIEILETKHTVEQNMYQLSKELSI
Complex: PEP_C_7(4I7E) / Model_30(4I7E/D) = [3.1] Download308.36-3.00MKRIGVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRKAIYHDVEVYGIYNGYAGLISGKIEKLELGSVGDIIHRGGTKLYTARCPEFKTVEGREKGIANLKKLGIEGLVVIGGDGSYMGAKKLTEHGFPCVGVPGTIDNDIPGTDFTIGFDTALNTVIDAIDKIRDTATSHERTYVIEVMGRHAGDIALWAGLAGGAESILIPEADYDMHEIIARLKRGHERGKKHSIIIVAEGVGSGVEFGKRIEEETNLETRVSVLGHIQRGGSPSAADRVLASRLGAYAVELLLEGKGGRCVGIQNNKLVDHDIIEILETKHTVEQNMYQLSKELSI
Complex: PEP_B_6(4I7E) / Model_8(4I7E/A) = [3.3] Download427.65-3.00MKRIGVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRKAIYHDVEVYGIYNGYAGLISGKIEKLELGSVGDIIHRGGTKLYTARCPEFKTVEGREKGIANLKKLGIEGLVVIGGDGSYMGAKKLTEHGFPCVGVPGTIDNDIPGTDFTIGFDTALNTVIDAIDKIRDTATSHERTYVIEVMGRHAGDIALWAGLAGGAESILIPEADYDMHEIIARLKRGHERGKKHSIIIVAEGVGSGVEFGKRIEEETNLETRVSVLGHIQRGGSPSAADRVLASRLGAYAVELLLEGKGGRCVGIQNNKLVDHDIIEILETKHTVEQNMYQLSKELSI
Complex: PEP_B_6(4I7E) / Model_83(4I7E/A) = [3.3] Download545.29-3.00MKRIGVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRKAIYHDVEVYGIYNGYAGLISGKIEKLELGSVGDIIHRGGTKLYTARCPEFKTVEGREKGIANLKKLGIEGLVVIGGDGSYMGAKKLTEHGFPCVGVPGTIDNDIPGTDFTIGFDTALNTVIDAIDKIRDTATSHERTYVIEVMGRHAGDIALWAGLAGGAESILIPEADYDMHEIIARLKRGHERGKKHSIIIVAEGVGSGVEFGKRIEEETNLETRVSVLGHIQRGGSPSAADRVLASRLGAYAVELLLEGKGGRCVGIQNNKLVDHDIIEILETKHTVEQNMYQLSKELSI
Consensus
[pKd Mean = 3.18]
-437
(s=77)
-3
(s=1)
MKRIGVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRKAIYHDVEVYGIYNGYAGLISGKIEKLELGSVGDIIHRGGTKLYTARCPEFKTVEGREKGIANLKKLGIEGLVVIGGDGSYMGAKKLTEHGFPCVGVPGTIDNDIPGTDFTIGFDTALNTVIDAIDKIRDTATSHERTYVIEVMGRHAGDIALWAGLAGGAESILIPEADYDMHEIIARLKRGHERGKKHSIIIVAEGVGSGVEFGKRIEEETNLETRVSVLGHIQRGGSPSAADRVLASRLGAYAVELLLEGKGGRCVGIQNNKLVDHDIIEILETKHTVEQNMYQLSKELSI