Study : bsu37720 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C2_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C2_S1
Complex: ADP_A_2(3WO1) / Model_4(3WO1/A) = [6.3] Download896.107.80MERKTVLVIADLGGCPPHMFYKSAAEKYNLVSFIPRPFAITASHAALIEKYSVAVIKDKDYFKSLADFEHPDSIYWAHEDHDKPEEEVVEEIVKVAGMFAVDAITTNNELFIAPMAKACERLGLRGAGVQAAENARDKNKMRAAFNRAGVKSIKNKRVTTLEDFRAALQEIGTPLILKPTYLASSIGVTLIKEMETAEAEFNRVNEYLKSINVPKAVTFEAPFIAEEFLQGEYDDWYETSGYSDYISIEGIMADGEYFPVAIHDKTPQIGFTETSHITPSILDDDAKRKIVEAAKKANEGLGLENCATHTEIKLMKNREAGLIESAARFAGWNMIPNIKKVFGVDMAQLLLDVLCFGKEADLPKGLLEQEPCYVADCHLYPQHFKENGQLPETAVDFVIESIDIPDGVLKGDTEIVSFSAAEAGTSVDLRLFEAFNSIAAFELKGSNSGDVAESIKQIQQQAKLTAKYALPV
Complex: ADP_A_4(3VMM) / Model_23(3VMM/A) = [6.7] Download667.4613.82MERKTVLVIADLGGCPPHMFYKSAAEKYNLVSFIPRPFAITASHAALIEKYSVAVIKDKDYFKSLADFEHPDSIYWAHEDHDKPEEEVVEEIVKVAGMFAVDAITTNNELFIAPMAKACERLGLRGAGVQAAENARDKNKMRAAFNRAGVKSIKNKRVTTLEDFRAALQEIGTPLILKPTYLASSIGVTLIKEMETAEAEFNRVNEYLKSINVPKAVTFEAPFIAEEFLQGEYDDWYETSGYSDYISIEGIMADGEYFPVAIHDKTPQIGFTETSHITPSILDDDAKRKIVEAAKKANEGLGLENCATHTEIKLMKNREAGLIESAARFAGWNMIPNIKKVFGVDMAQLLLDVLCFGKEADLPKGLLEQEPCYVADCHLYPQHFKENGQLPETAVDFVIESIDIPDGVLKGDTEIVSFSAAEAGTSVDLRLFEAFNSIAAFELKGSNSGDVAESIKQIQQQAKLTAKYALPV
Complex: ADP_A_4(3VMM) / Model_1(3VMM/A) = [6.7] Download698.6513.82MERKTVLVIADLGGCPPHMFYKSAAEKYNLVSFIPRPFAITASHAALIEKYSVAVIKDKDYFKSLADFEHPDSIYWAHEDHDKPEEEVVEEIVKVAGMFAVDAITTNNELFIAPMAKACERLGLRGAGVQAAENARDKNKMRAAFNRAGVKSIKNKRVTTLEDFRAALQEIGTPLILKPTYLASSIGVTLIKEMETAEAEFNRVNEYLKSINVPKAVTFEAPFIAEEFLQGEYDDWYETSGYSDYISIEGIMADGEYFPVAIHDKTPQIGFTETSHITPSILDDDAKRKIVEAAKKANEGLGLENCATHTEIKLMKNREAGLIESAARFAGWNMIPNIKKVFGVDMAQLLLDVLCFGKEADLPKGLLEQEPCYVADCHLYPQHFKENGQLPETAVDFVIESIDIPDGVLKGDTEIVSFSAAEAGTSVDLRLFEAFNSIAAFELKGSNSGDVAESIKQIQQQAKLTAKYALPV
Complex: ADP_A_2(3WNZ) / Model_36(3WNZ/A) = [7.5] Download675.7211.04MERKTVLVIADLGGCPPHMFYKSAAEKYNLVSFIPRPFAITASHAALIEKYSVAVIKDKDYFKSLADFEHPDSIYWAHEDHDKPEEEVVEEIVKVAGMFAVDAITTNNELFIAPMAKACERLGLRGAGVQAAENARDKNKMRAAFNRAGVKSIKNKRVTTLEDFRAALQEIGTPLILKPTYLASSIGVTLIKEMETAEAEFNRVNEYLKSINVPKAVTFEAPFIAEEFLQGEYDDWYETSGYSDYISIEGIMADGEYFPVAIHDKTPQIGFTETSHITPSILDDDAKRKIVEAAKKANEGLGLENCATHTEIKLMKNREAGLIESAARFAGWNMIPNIKKVFGVDMAQLLLDVLCFGKEADLPKGLLEQEPCYVADCHLYPQHFKENGQLPETAVDFVIESIDIPDGVLKGDTEIVSFSAAEAGTSVDLRLFEAFNSIAAFELKGSNSGDVAESIKQIQQQAKLTAKYALPV
Complex: ADP_A_2(3WNZ) / Model_2(3WNZ/A) = [7.5] Download644.919.54MERKTVLVIADLGGCPPHMFYKSAAEKYNLVSFIPRPFAITASHAALIEKYSVAVIKDKDYFKSLADFEHPDSIYWAHEDHDKPEEEVVEEIVKVAGMFAVDAITTNNELFIAPMAKACERLGLRGAGVQAAENARDKNKMRAAFNRAGVKSIKNKRVTTLEDFRAALQEIGTPLILKPTYLASSIGVTLIKEMETAEAEFNRVNEYLKSINVPKAVTFEAPFIAEEFLQGEYDDWYETSGYSDYISIEGIMADGEYFPVAIHDKTPQIGFTETSHITPSILDDDAKRKIVEAAKKANEGLGLENCATHTEIKLMKNREAGLIESAARFAGWNMIPNIKKVFGVDMAQLLLDVLCFGKEADLPKGLLEQEPCYVADCHLYPQHFKENGQLPETAVDFVIESIDIPDGVLKGDTEIVSFSAAEAGTSVDLRLFEAFNSIAAFELKGSNSGDVAESIKQIQQQAKLTAKYALPV
Consensus
[pKd Mean = 6.94]
-716
(s=91)
11
(s=2)
MERKTVLVIADLGGCPPHMFYKSAAEKYNLVSFIPRPFAITASHAALIEKYSVAVIKDKDYFKSLADFEHPDSIYWAHEDHDKPEEEVVEEIVKVAGMFAVDAITTNNELFIAPMAKACERLGLRGAGVQAAENARDKNKMRAAFNRAGVKSIKNKRVTTLEDFRAALQEIGTPLILKPTYLASSIGVTLIKEMETAEAEFNRVNEYLKSINVPKAVTFEAPFIAEEFLQGEYDDWYETSGYSDYISIEGIMADGEYFPVAIHDKTPQIGFTETSHITPSILDDDAKRKIVEAAKKANEGLGLENCATHTEIKLMKNREAGLIESAARFAGWNMIPNIKKVFGVDMAQLLLDVLCFGKEADLPKGLLEQEPCYVADCHLYPQHFKENGQLPETAVDFVIESIDIPDGVLKGDTEIVSFSAAEAGTSVDLRLFEAFNSIAAFELKGSNSGDVAESIKQIQQQAKLTAKYALPV