Study : Rv2781c (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C1_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C1_S1
Complex: FMN_A_3(4QIT) / Model_53(4QIT/A) = [9.2] Download772.4032.70MVLGFWDIAVPIVGAPMAGGPSTPALAAAVSNAGGLGFVAGGYLSADRLADDIAAARAATTGPIGANLFVPQPSVADWAQLEYYADELEEVAEYYHTEVGQPVYGDDDDWVRKLEVVADVRPEVVSFTFGAPPPDVVQRLSALGLLVSITVTSVYEAGVAIAAGADSLVVQGPAAGGHRGTFAPDMEPGTESLHQLLDRIGSAHDVPLVAAGGLGTAEDVAAVLRRGAIAAQVGTALLLADEAGTNAAHRAALKNPEFDATLVTRAFSGRYARGLANNFTRLLDHVAPLGYPEVHQMTKPIRAAAVQADDPHGTNLWAGSAHRKTRPGPAADIIASLTPDVCSA
Complex: FMN_A_3(4QIT) / Model_3(4QIT/A) = [9.2] Download747.5933.50MVLGFWDIAVPIVGAPMAGGPSTPALAAAVSNAGGLGFVAGGYLSADRLADDIAAARAATTGPIGANLFVPQPSVADWAQLEYYADELEEVAEYYHTEVGQPVYGDDDDWVRKLEVVADVRPEVVSFTFGAPPPDVVQRLSALGLLVSITVTSVYEAGVAIAAGADSLVVQGPAAGGHRGTFAPDMEPGTESLHQLLDRIGSAHDVPLVAAGGLGTAEDVAAVLRRGAIAAQVGTALLLADEAGTNAAHRAALKNPEFDATLVTRAFSGRYARGLANNFTRLLDHVAPLGYPEVHQMTKPIRAAAVQADDPHGTNLWAGSAHRKTRPGPAADIIASLTPDVCSA
Complex: FMN_B_5(4QIT) / Model_23(4QIT/B) = [9.2] Download768.2035.28MVLGFWDIAVPIVGAPMAGGPSTPALAAAVSNAGGLGFVAGGYLSADRLADDIAAARAATTGPIGANLFVPQPSVADWAQLEYYADELEEVAEYYHTEVGQPVYGDDDDWVRKLEVVADVRPEVVSFTFGAPPPDVVQRLSALGLLVSITVTSVYEAGVAIAAGADSLVVQGPAAGGHRGTFAPDMEPGTESLHQLLDRIGSAHDVPLVAAGGLGTAEDVAAVLRRGAIAAQVGTALLLADEAGTNAAHRAALKNPEFDATLVTRAFSGRYARGLANNFTRLLDHVAPLGYPEVHQMTKPIRAAAVQADDPHGTNLWAGSAHRKTRPGPAADIIASLTPDVCSA
Complex: FMN_A_3(4QIS) / Model_1(4QIS/A) = [9.2] Download855.0733.89MVLGFWDIAVPIVGAPMAGGPSTPALAAAVSNAGGLGFVAGGYLSADRLADDIAAARAATTGPIGANLFVPQPSVADWAQLEYYADELEEVAEYYHTEVGQPVYGDDDDWVRKLEVVADVRPEVVSFTFGAPPPDVVQRLSALGLLVSITVTSVYEAGVAIAAGADSLVVQGPAAGGHRGTFAPDMEPGTESLHQLLDRIGSAHDVPLVAAGGLGTAEDVAAVLRRGAIAAQVGTALLLADEAGTNAAHRAALKNPEFDATLVTRAFSGRYARGLANNFTRLLDHVAPLGYPEVHQMTKPIRAAAVQADDPHGTNLWAGSAHRKTRPGPAADIIASLTPDVCSA
Complex: FMN_A_3(4QIU) / Model_4(4QIU/A) = [9.4] Download856.5436.28MVLGFWDIAVPIVGAPMAGGPSTPALAAAVSNAGGLGFVAGGYLSADRLADDIAAARAATTGPIGANLFVPQPSVADWAQLEYYADELEEVAEYYHTEVGQPVYGDDDDWVRKLEVVADVRPEVVSFTFGAPPPDVVQRLSALGLLVSITVTSVYEAGVAIAAGADSLVVQGPAAGGHRGTFAPDMEPGTESLHQLLDRIGSAHDVPLVAAGGLGTAEDVAAVLRRGAIAAQVGTALLLADEAGTNAAHRAALKNPEFDATLVTRAFSGRYARGLANNFTRLLDHVAPLGYPEVHQMTKPIRAAAVQADDPHGTNLWAGSAHRKTRPGPAADIIASLTPDVCSA
Consensus
[pKd Mean = 9.24]
-799
(s=46)
34
(s=1)
MVLGFWDIAVPIVGAPMAGGPSTPALAAAVSNAGGLGFVAGGYLSADRLADDIAAARAATTGPIGANLFVPQPSVADWAQLEYYADELEEVAEYYHTEVGQPVYGDDDDWVRKLEVVADVRPEVVSFTFGAPPPDVVQRLSALGLLVSITVTSVYEAGVAIAAGADSLVVQGPAAGGHRGTFAPDMEPGTESLHQLLDRIGSAHDVPLVAAGGLGTAEDVAAVLRRGAIAAQVGTALLLADEAGTNAAHRAALKNPEFDATLVTRAFSGRYARGLANNFTRLLDHVAPLGYPEVHQMTKPIRAAAVQADDPHGTNLWAGSAHRKTRPGPAADIIASLTPDVCSA