Study : Rv2986c (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C8_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C8_S1
Complex: NACID_I_3(1P51) / Model_24(1P51/D) = [3.6] Download--MNKAELIDVLTQKLGSDRRQATAAVENVVDTIVRAVHKGDSVTITGFGVFEQRRRAARVARNPRTGETVKVKPTSVPAFRPGAQFKAVVSGAQRLPAEGPAVKRGVGASAAKKVAKKAPAKKATKAAKKAATKAPARKAATKAPAKKAATKAPAKKAVKATKSPAKKVTKAVKKTAVKASVRKAATKAPAKKAAAKRPATKAPAKKATARRGRK
Complex: NACID_E_1(1P51) / Model_26(1P51/B) = [4.2] Download--MNKAELIDVLTQKLGSDRRQATAAVENVVDTIVRAVHKGDSVTITGFGVFEQRRRAARVARNPRTGETVKVKPTSVPAFRPGAQFKAVVSGAQRLPAEGPAVKRGVGASAAKKVAKKAPAKKATKAAKKAATKAPARKAATKAPAKKAATKAPAKKAVKATKSPAKKVTKAVKKTAVKASVRKAATKAPAKKAAAKRPATKAPAKKATARRGRK
Complex: NACID_H_4(1P51) / Model_25(1P51/C) = [4.5] Download--MNKAELIDVLTQKLGSDRRQATAAVENVVDTIVRAVHKGDSVTITGFGVFEQRRRAARVARNPRTGETVKVKPTSVPAFRPGAQFKAVVSGAQRLPAEGPAVKRGVGASAAKKVAKKAPAKKATKAAKKAATKAPARKAATKAPAKKAATKAPAKKAVKATKSPAKKVTKAVKKTAVKASVRKAATKAPAKKAAAKRPATKAPAKKATARRGRK
Complex: NACID_D_2(1P78) / Model_22(1P78/B) = [4.7] Download--MNKAELIDVLTQKLGSDRRQATAAVENVVDTIVRAVHKGDSVTITGFGVFEQRRRAARVARNPRTGETVKVKPTSVPAFRPGAQFKAVVSGAQRLPAEGPAVKRGVGASAAKKVAKKAPAKKATKAAKKAATKAPARKAATKAPAKKAATKAPAKKAVKATKSPAKKVTKAVKKTAVKASVRKAATKAPAKKAAAKRPATKAPAKKATARRGRK
Complex: NACID_C_1(1P71) / Model_36(1P71/A) = [5.1] Download--MNKAELIDVLTQKLGSDRRQATAAVENVVDTIVRAVHKGDSVTITGFGVFEQRRRAARVARNPRTGETVKVKPTSVPAFRPGAQFKAVVSGAQRLPAEGPAVKRGVGASAAKKVAKKAPAKKATKAAKKAATKAPARKAATKAPAKKAATKAPAKKAVKATKSPAKKVTKAVKKTAVKASVRKAATKAPAKKAAAKRPATKAPAKKATARRGRK
Consensus
[pKd Mean = 4.42]
-0
(s=0)
0
(s=0)
MNKAELIDVLTQKLGSDRRQATAAVENVVDTIVRAVHKGDSVTITGFGVFEQRRRAARVARNPRTGETVKVKPTSVPAFRPGAQFKAVVSGAQRLPAEGPAVKRGVGASAAKKVAKKAPAKKATKAAKKAATKAPARKAATKAPAKKAATKAPAKKAVKATKSPAKKVTKAVKKTAVKASVRKAATKAPAKKAAAKRPATKAPAKKATARRGRK