Study : Rv3329 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C1_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C1_S1
Complex: PLP_A_3(1VEF) / Model_68(1VEF/A) = [3.2] Download892.7225.30MHFARHGAGIQHPVIVRGDGVTIFDDRGKSYLDALSGLFVVQVGYGRAELAEAAARQAGTLGYFPLWGYATPPAIELAERLARYAPGDLNRVFFTSGGTEAVETAWKVAKQYFKLTGKPGKQKVISRSIAYHGTTQGALAITGLPLFKAPFEPLTPGGFRVPNTNFYRAPLHTDLKEFGRWAADRIAEAIEFEGPDTVAAVFLEPVQNAGGCIPAPPGYFERVREICDRYDVLLVSDEVICAFGRIGSMFACEDLGYVPDMITCAKGLTSGYSPLGAMIASDRLFEPFNDGETMFAHGYTFGGHPVSAAVGLANLDIFEREGLSDHVKRNSPALRATLEKLYDLPIVGDIRGEGYFFGIELVKDQATKQTFTDDERARLLGQVSAALFEAGLYCRTDDRGDPVVQVAPPLISGQPEFDTIETILRSVLTDTGRKYLHL
Complex: PLP_B_4(1VEF) / Model_67(1VEF/B) = [3.2] Download519.8325.65MHFARHGAGIQHPVIVRGDGVTIFDDRGKSYLDALSGLFVVQVGYGRAELAEAAARQAGTLGYFPLWGYATPPAIELAERLARYAPGDLNRVFFTSGGTEAVETAWKVAKQYFKLTGKPGKQKVISRSIAYHGTTQGALAITGLPLFKAPFEPLTPGGFRVPNTNFYRAPLHTDLKEFGRWAADRIAEAIEFEGPDTVAAVFLEPVQNAGGCIPAPPGYFERVREICDRYDVLLVSDEVICAFGRIGSMFACEDLGYVPDMITCAKGLTSGYSPLGAMIASDRLFEPFNDGETMFAHGYTFGGHPVSAAVGLANLDIFEREGLSDHVKRNSPALRATLEKLYDLPIVGDIRGEGYFFGIELVKDQATKQTFTDDERARLLGQVSAALFEAGLYCRTDDRGDPVVQVAPPLISGQPEFDTIETILRSVLTDTGRKYLHL
Complex: PLP_A_3(4JF1) / Model_73(4JF1/A) = [3.3] Download644.7326.40MHFARHGAGIQHPVIVRGDGVTIFDDRGKSYLDALSGLFVVQVGYGRAELAEAAARQAGTLGYFPLWGYATPPAIELAERLARYAPGDLNRVFFTSGGTEAVETAWKVAKQYFKLTGKPGKQKVISRSIAYHGTTQGALAITGLPLFKAPFEPLTPGGFRVPNTNFYRAPLHTDLKEFGRWAADRIAEAIEFEGPDTVAAVFLEPVQNAGGCIPAPPGYFERVREICDRYDVLLVSDEVICAFGRIGSMFACEDLGYVPDMITCAKGLTSGYSPLGAMIASDRLFEPFNDGETMFAHGYTFGGHPVSAAVGLANLDIFEREGLSDHVKRNSPALRATLEKLYDLPIVGDIRGEGYFFGIELVKDQATKQTFTDDERARLLGQVSAALFEAGLYCRTDDRGDPVVQVAPPLISGQPEFDTIETILRSVLTDTGRKYLHL
Complex: PLP_A_3(4JEY) / Model_71(4JEY/A) = [3.3] Download552.9426.40MHFARHGAGIQHPVIVRGDGVTIFDDRGKSYLDALSGLFVVQVGYGRAELAEAAARQAGTLGYFPLWGYATPPAIELAERLARYAPGDLNRVFFTSGGTEAVETAWKVAKQYFKLTGKPGKQKVISRSIAYHGTTQGALAITGLPLFKAPFEPLTPGGFRVPNTNFYRAPLHTDLKEFGRWAADRIAEAIEFEGPDTVAAVFLEPVQNAGGCIPAPPGYFERVREICDRYDVLLVSDEVICAFGRIGSMFACEDLGYVPDMITCAKGLTSGYSPLGAMIASDRLFEPFNDGETMFAHGYTFGGHPVSAAVGLANLDIFEREGLSDHVKRNSPALRATLEKLYDLPIVGDIRGEGYFFGIELVKDQATKQTFTDDERARLLGQVSAALFEAGLYCRTDDRGDPVVQVAPPLISGQPEFDTIETILRSVLTDTGRKYLHL
Complex: PLP_A_3(4JF1) / Model_114(4JF1/A) = [3.3] Download739.2426.40MHFARHGAGIQHPVIVRGDGVTIFDDRGKSYLDALSGLFVVQVGYGRAELAEAAARQAGTLGYFPLWGYATPPAIELAERLARYAPGDLNRVFFTSGGTEAVETAWKVAKQYFKLTGKPGKQKVISRSIAYHGTTQGALAITGLPLFKAPFEPLTPGGFRVPNTNFYRAPLHTDLKEFGRWAADRIAEAIEFEGPDTVAAVFLEPVQNAGGCIPAPPGYFERVREICDRYDVLLVSDEVICAFGRIGSMFACEDLGYVPDMITCAKGLTSGYSPLGAMIASDRLFEPFNDGETMFAHGYTFGGHPVSAAVGLANLDIFEREGLSDHVKRNSPALRATLEKLYDLPIVGDIRGEGYFFGIELVKDQATKQTFTDDERARLLGQVSAALFEAGLYCRTDDRGDPVVQVAPPLISGQPEFDTIETILRSVLTDTGRKYLHL
Consensus
[pKd Mean = 3.26]
-669
(s=135)
26
(s=0)
MHFARHGAGIQHPVIVRGDGVTIFDDRGKSYLDALSGLFVVQVGYGRAELAEAAARQAGTLGYFPLWGYATPPAIELAERLARYAPGDLNRVFFTSGGTEAVETAWKVAKQYFKLTGKPGKQKVISRSIAYHGTTQGALAITGLPLFKAPFEPLTPGGFRVPNTNFYRAPLHTDLKEFGRWAADRIAEAIEFEGPDTVAAVFLEPVQNAGGCIPAPPGYFERVREICDRYDVLLVSDEVICAFGRIGSMFACEDLGYVPDMITCAKGLTSGYSPLGAMIASDRLFEPFNDGETMFAHGYTFGGHPVSAAVGLANLDIFEREGLSDHVKRNSPALRATLEKLYDLPIVGDIRGEGYFFGIELVKDQATKQTFTDDERARLLGQVSAALFEAGLYCRTDDRGDPVVQVAPPLISGQPEFDTIETILRSVLTDTGRKYLHL