Modeling by threading (Tito software) Unconserved sides chains calculation (Scwrl software) Evaluation (QMean software)
Input alignment information:
Query sequence | MSQKTFGKQLTVVDTKSRVKMHKSGKNWVRTVMSHFNLFKAIKGRATVEADVCIQDVEKEDRLSSGNLTYLKGILAAGALVGGASLTSRVYADETPVVQEQSSSVPTLAEQTEVTVKTTTVQNHQDGTVSKNIIDSNSVSMSESASTSTSESVSMSMSGSTLTSVSESVSTSALTSASESISTSASESVSKSTSISEVSNILETQASLTDKGRESFSANQIVTESSLVTDAGKNASVSSLIEITKPKSELQTSKMSNESLITPEKSQVMIASDKTGNESLTPTIRLKSVIQPRSMNLMTLSSEMDLIPLEEVSDTEMLGKDVSSELQKVNIALKDNTLSEPGTVKLDSSENLVLNFAFSIAS-VNEGDVFTVKLSDNLDTQGIGTIL----KVQDIMDETGQLLATGSYSPLTHNITYTWTRYASTLNNIKARVNMPVWPDQRIISKTTSDKQCFTATLNNQVASIEERVQYNSPSVTEHTNVKTNVRSRIMKLDDERQTETYITQINPEGKEMYFASGLGNLYTIIGSDGTSGSPVNLLNAEVKILKTNSKNLTDSMDQNYDSPEFEDVTSQYSYTNDGSKITIDWKTNSISSTTSYVVLVKIPKQSGVLYSTVSDINQTYGSKYSYGHTNISGDSDANAEIKLLSESASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASMSATTSASTSVSTSASTSASTSASTSSSSSVTSNSSKEKVYSALPSTGDQDYSVTATALGLGLMTGATLLGRKKSKKDKD |
1R17 Chain:B ((44-134)) | -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GIIKAHDAENLIYDVTFEVDDKVKSGDTMTV----NIDKNTVPSDLTDSFAIPKIKDNSGEIIATGTYDNTNKQITYTFTDYVDKYENIKAHLKLTSYIDKSKVPNNNTKLDVEYKTALSSVNKTITVEYQKPNENRTANLQSMFTNIDTKNHTVEQTIYINPLRYSAKETNVNISGNGDEGSTIIDDSTIIKVYKVGDNQNLPDSNRIYDYSEYEDVTNDDYAQLGNNNDVNINFGNIDSPYIIKVISKYDPNKDDYTTIQQTVTMQTTINEYTGEFRTASYDNTIAFSTSSGQGQGDLP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- |
|
General information:
TITO was launched using:
| RESULT:
|
Template: 1R17.pdb
Alignment : align.pir
Tito was launched with SMD and SCWRL
Tito text output
|
3D Compatibility (PKB) -44729 for 495 contacts (-90.4/contact) +
2D Compatibility (PS) -9195 + (NN) -1056 + (LL) 50856
1D Compatibility (HY) -8400 + (ID) 1550
Total energy: -14074.0 ( -28.43 by residue)
QMean score : 0.462
|
|
|