Modeling by threading (Tito software)
Unconserved sides chains calculation (Scwrl software)
Evaluation (QMean software)
Input alignment information:
| Query sequence | MSQKTFGKQLTVVDTKSRVKMHKSGKNWVRTVMSHFNLFKAIKGRATVEADVCIQDVEKEDRLSSGNLTYLKGILAAGALVGGASLTSRVYADETPVVQEQSSSVPTLAEQTEVTVKTTTVQNHQDGTVSKNIIDSNSVSMSESASTSTSESVSMSMSGSTLTSVSESVSTSALTSASESISTSASESVSKSTSISEVSNILETQASLTDKGRESFSANQIVTESSLVTDAGKNASVSSLIEITKPKSELQTSKMSNESLITPEKSQVMIASDKTGNESLTPTIRLKSVIQPRSMNLMTLSSEMDLIPLEEVSDTEMLGKDVSSELQKVNIALKDNTLSEPGTVKLDSSENLVLNFAFSIA-SVNEGDVFTVKLSDNLDTQGIGTILKVQDIMDETGQLLATGSYSPLTHNITYTWTRYASTLNNIKARVNMPVWPDQRIISKTTSDKQCFTATLNNQVASIEERVQYNSPSVTEHTNVKTNVRSRIMKLDDERQTETYITQINPEGKEMYFASGLGNLYTIIGSDGTSGSPVNLLNAEVKILKTNS-KNLTDSMDQNYDSPEFEDVTS-QYSYTNDGSKITIDWKTNSISSTTSYVVLVKIPKQSGVLYSTVSDINQTYGSKYSYGHTNISGDSDANAEIKLLSESASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASMSATTSASTSVSTSASTSASTSASTSSSSSVTSNSSKEKVYSALPSTGDQDYSVTATALGLGLMTGATLLGRKKSKKDKD |
| 3IRP Chain:X ((4-259)) | -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SGRNVNHLVFANTSYEILGGGKKYNQVFMTMDGKLKIKIDYTVDDSVVEGDYFTVDFGKYIHPGTSRKPYRVNNIHDANGRTIAIGSYDSATNTAKYTFTNYVDIYNNVRGSFSLLSWPFKELVTTDKQ-SVPVGITVAGEDYTQNVIFNYGNRTV-P-------VISDINYLT-K-DFAEFTTYINQNRAFNTGS----KV-RLSGQ----GF-KFTSPDEIEVYKVLNNSQFRDSFSPD--YANLTQVRNPKIIINSDG-SATVDLGD--IG-TLGYIIRSKPNTLPDFSGIGVLKSEYTFTNNKNQRDTRAHASSIQFVRAELAGFGGFGGYVWFDKNNDGVQNDSNAAAAGITVNLLDPTGIRLATTTTDITGHYNFDNLTNGNYLVEFVMPEGYIPTQANSTVDDKDSDVVFENGRYIAHVTIKDADNMTIDAGLVSD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- |
|
General information:
TITO was launched using:
| RESULT:
|
Template: 3IRP.pdb
Alignment : align.pir
Tito was launched with SMD and SCWRL
Tito text output
|
3D Compatibility (PKB) -59053 for 1903 contacts (-31.0/contact) +
2D Compatibility (PS) -27367 + (NN) -10153 + (LL) 42144
1D Compatibility (HY) -11600 + (ID) 2650
Total energy: -68679.0 ( -36.09 by residue)
QMean score : 0.294
|
|
|