Modeling by threading (Tito software)
Unconserved sides chains calculation (Scwrl software)
Evaluation (QMean software)



Input alignment information:
Query sequenceMSQKTFGKQLTVVDTKSRVKMHKSGKNWVRTVMSHFNLFKAIKGRATVEADVCIQDVEKEDRLSSGNLTYLKGILAAGALVGGASLTSRVYADETPVVQEQSSSVPTLAEQTEVTVKTTTVQNHQDGTVSKNIIDSNSVSMSESASTSTSESVSMSMSGSTLTSVSESVSTSALTSASESISTSASESVSKSTSISEVSNILETQASLTDKGRESFSANQIVTESSLVTDAGKNASVSSLIEITKPKSELQTSKMSNESLITPEKSQVMIASDKTGNESLTPTIRLKSVIQPRSMNLMTLSSEMDLIPLEEVSDTEMLGKDVSSELQKVNIALKDNTLSEPGTVKLDSSENLVLNFAFSIAS-VNEGDVFTVKLSDNLDTQGIGTILKVQDIMDETGQLLATGSYSPLTHNITYTWTRYASTLNNIKARVNMPVWPDQRIISKTTSDKQCFTATLNNQVASIEERVQYNSPSVTEHTNVKT----NVRSRIMKLDDERQTETYITQINPEGKEMYFASGLGNLYTIIGSDGTSGSPVNLLNAEVKILKTNSKNLTDSMDQNYDSPEFEDVTSQYSYTNDGSKITIDWKTNSISSTTSYVVLVKIPKQSGVLYSTVSDINQTYGSKYSYGHTNISGDSD------ANAEIKLLSESASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASMSATTSASTSVSTSASTSASTSASTSSSSSVTSNSSKEKVYSALPSTGDQDYSVTATALGLGLMTGATLLGRKKSKKDKD
3IRP Chain:X ((2-419))---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AQSGRNVNHLVFANTSYEILGGGKKYNQVFMTMDGKLKIKIDYTVDDSVVEGDYFTVDFGKYIHPGTSRKPYRVNNIHDANGRTIAIGSYDSATNTAKYTFTNYVDIYNNVRGSFSLLSWPFKELV-TTDKQSVPVGITVAGEDYTQNVIFNYGNRTVPVISDINYLTKDFAEFTTYINQNRAFNTGSKVRLSGQGFKFTSPDEIEVYKVLNNSQFRDSFSPDYANLTQVRNPKIIINSDGSATVDLGDIGTLGYIIRSKPNTLPDFSGIGVLKSEYTFTNNKNQRDTRAHASSIQFVRAELAGFGGFGGYVWFDKNNDGVQNDSNAAAAGITVNLLDPTGIRLATTTTDITGHYNFDNLTNGNYLVEFVMPEGYIPT-QANSTVDDKDSDVVFENGRYIAHVTIKDADNMTIDAGLVSD----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------


General information:
TITO was launched using:
RESULT:

Template: 3IRP.pdb
Alignment : align.pir
Tito was launched with SMD and SCWRL
Tito text output
3D Compatibility (PKB) 89133 for 3267 contacts (27.3/contact) +
2D Compatibility (PS) -42601 + (NN) -16451 + (LL) 44000
1D Compatibility (HY) -4000 + (ID) 2600
Total energy: 67481.0 ( 20.66 by residue)
QMean score : ?

(partial model without unconserved sides chains):
PDB file : Tito_3IRP.pdb:





(Unconserved sides chains are recalculated) :
Sequence: align-3IRP-query.scw
PDB file : Tito_Scwrl_3IRP.pdb: