Modeling by threading (Tito software) Unconserved sides chains calculation (Scwrl software) Evaluation (QMean software)
Input alignment information:
Query sequence | MSQKTFGKQLTVVDTKSRVKMHKSGKNWVRTVMSHFNLFKAIKGRATVEADVCIQDVEKEDRLSSGNLTYLKGILAAGALVGGASLTSRVYADETPVVQEQSSSVPTLAEQTEVTVKTTTVQNHQDGTVSKNIIDSNSVSMSESASTSTSESVSMSMSGSTLTSVSESVSTSALTSASESISTSASESVSKSTSISEVSNILETQASLTDKGRESFSANQIVTESSLVTDAGKNASVSSLIEITKPKSELQTSKMSNESLITPEKSQVMIASDKTGNESLTPTI----RLKSVIQPRSMNLMTLSSEMDLIPLEEVSDTEMLGKDVSSELQKVNIALKDNTLSEPGTVK--LDSSENLVLN----FAFSIASVNEGDVFTVKLSDNL---DTQGIG-----TILKVQDIMDETGQLLATGSYSPLTHNITYTWTRYASTLNNIKARVNMPVWPDQRIISKTTSDKQCFTATLNNQVASIEERVQYNSPSVTEHTNVKTNVRSRIMKLDDERQTETYITQINPEGKEMYFASGLGNLYTIIGSDGTSGSPVNLLNAEVKILKTNSKNLTDSMDQNYDSPEFEDVTSQYSYTNDGSKITIDWKTNSISSTTSYVVLVKIPKQSGVLYSTVSDINQTYGSKYSYGHTNISGDSDANAEIKLLSESASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASMSATTSASTSVSTSASTSASTSASTSSSSSVTSNSSKEKVYSALPSTGDQDYSVTATALGLGLMTGATLLGRKKSKKDKD |
4QTS Chain:A ((1-369)) | ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MKMVVLKPKINSKFHFKIFHSNSLFSAIVNNYIKLYGREDLEKNIEKIKNIRLSSL--LYKIKNIYLIPKPEHPEFYPKDIKKIQFFSIKAYKELLDNELDWKNKIKHIVDYQTINKSIVISEKEIEEIKRIFGIK------AEKLKHAKISLISKHLEQKVADKGQLYNIEFIKLNENVEFYFLIDYNNEDKEFIKKLEASIKLIEDEGLGGAGFFEKVEIVDLPEDFNEILDENS---KYNNLEYKMLLGVGIPN--KDDIKNIEYYKLIEIGGYIYSLECLTKPKRNILALTEGSIVKNDF-IGDVKDVYTHGKPILLPFNP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- |
|
General information:
TITO was launched using:
| RESULT:
|
Template: 4QTS.pdb
Alignment : align.pir
Tito was launched with SMD and SCWRL
Tito text output
|
3D Compatibility (PKB) 59892 for 2189 contacts (27.4/contact) +
2D Compatibility (PS) -29805 + (NN) 1182 + (LL) 46100
1D Compatibility (HY) -10800 + (ID) 2800
Total energy: 63769.0 ( 29.13 by residue)
QMean score : 0.059
|
|
|