Modeling by threading (Tito software) Unconserved sides chains calculation (Scwrl software) Evaluation (QMean software)
Input alignment information:
Query sequence | MSQKTFGKQLTVVDTKSRVKMHKSGKNWVRTVMSHFNLFKAIKGRATVEADVCIQDVEKEDRLSSGNLTYLKGILAAGALVGGASLTSRVYADETPVVQEQSSSVPTLAEQTEVTVKTTTVQNHQDGTVSKNIIDSNSVSMSESASTSTSESVSMSMSGSTLTSVSESVSTSALTSASESISTSASESVSKSTSISEVSNILETQASLTDKGRESFSANQIVTESSLVTDAGKNASVSSLIEITKPKSELQTSKMSNESLITPEKSQVMIASDKTGNESLTPTIRLKSVIQPRSMNLMTLSSEMDLIPLEEVSDTEMLGKDVSSELQKVNIALKDNTLSEPGTVKLDSSENLVLNFAFSIAS-VNEGDVFTVKLSDNLDTQGIGTILKVQDIMDETGQLLATGSYSPLTHNITYTWTRYASTLNNIKARVNMPVWPDQRIISKTTSDKQCFTATLNNQVASIEERVQYNSPSVTEHTNVKTNVRSRIMKLDDERQTETYITQINPEGKEMYFASGLGNLYTIIGSDGTSGSPVNLLNAEVKILKTNSKNLTDSMDQNYDSPEFEDVTSQYSYTNDGSKITIDWKTNSISSTTSYVVLVKIPKQSGVLYSTVSDINQTYGSKYSYGHTNISGDSDANAEIKLLSESASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASMSATTSASTSVSTSASTSASTSASTSSSSSVTSNSSKEKVYSALPSTGDQDYSVTATALGLGLMTGATLLGRKKSKKDKD |
2RAL Chain:A ((299-389)) | -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GIIKAHDAENLIYDVTFEVDDKVKSGDTMTVNIDKNTVPSDLTDSFAIPKIKDNSGEIIATGTYDNTNKQITYTFTDYVDKYCNIKAHLKL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- |
|
General information:
TITO was launched using:
| RESULT:
|
Template: 2RAL.pdb
Alignment : align.pir
Tito was launched with SMD and SCWRL
Tito text output
|
3D Compatibility (PKB) -41455 for 519 contacts (-79.9/contact) +
2D Compatibility (PS) -9636 + (NN) -1584 + (LL) 59204
1D Compatibility (HY) -8000 + (ID) 1450
Total energy: -2921.0 ( -5.63 by residue)
QMean score : 0.466
|
|
|