Modeling by threading (Tito software)
Unconserved sides chains calculation (Scwrl software)
Evaluation (QMean software)
Input alignment information:
| Query sequence | MSQKTFGKQLTVVDTKSRVKMHKSGKNWVRTVMSHFNLFKAIKGRATVEADVCIQDVEKEDRLSSGNLTYLKGILAAGALVGGASLTSRVYADETPVVQEQSSSVPTLAEQTEVTVKTTTVQNHQDGTVSKNIIDSNSVSMSESASTSTSESVSMSMSGSTLTSVSESVSTSALTSASESISTSASESVSKSTSISEVSNILETQASLTDKGRESFSANQIVTESSLVTDAGKNASVSSLIEITKPKSELQTSKMSNESLITPEKSQVMIASDKTGNESLTPTIRLKSVIQPRSMNLMTLSSEMDLIPLEEVSDTEMLGKDVSSELQKVNIALKDNTLSEPGTVKLDSSENLVLNFAFSIASVNEGDVFTVKLSDNLDTQGIGTILKVQDIMDETGQLLATGSYSPLTHNITYTWTRYASTLNNIKARVNMPVWPDQRIISKTTSDKQCFTATLNNQVASIEERVQYNSPSVTEHTNVKTNVRSRIMKLDDERQTETYITQINPEGKEMYFASGLGNLYTIIGSDGTSGSPVNLLNAEVKILKTNSKNLTDSMDQNYDSPEFEDVTSQY--SYTNDGSKITIDWKTNSISSTTSYVVLVKIPKQSGV-LYSTVSDINQTYGSKYSYGHTNISGDSDANA-EIKLLSESASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASMSATTSASTSVSTSASTSASTSASTSSSSSVTSNSSKEKVYSALPSTGDQDYSVTATALGLGLMTGATLLGRKKSKKDKD |
| 4MBR Chain:A ((20-333)) | ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GQDVTDKLQNLDIKLSGGVQAKAGVINMDKSESMHMSLKFTIDSVNRGDTFEIKLSDNIDTNGASNYSIVEPIKSPTGEVYATGIYDSQKKSIVYSFTDFAASKNNINGILDIPLWPDDTTVQNTKED-VLFSVKIKDQEATIKETVKYDPPVRIDFAG-GVSVDSRITNIDDVGKKMTYISQINVDGKSLYNYNG---LYTRI-YNYSKESTADLKNSTIKIYKTTSDNIVESMVQDYSS--MEDVTSKFANSYPEKGW-YDIYW-GQFIASNETYVIVVETPFTNAVTLNTTLSDYNENNGVEHNHTYSSESGYSDVNAQER------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ |
|
General information:
TITO was launched using:
| RESULT:
|
Template: 4MBR.pdb
Alignment : align.pir
Tito was launched with SMD and SCWRL
Tito text output
|
3D Compatibility (PKB) -76714 for 2435 contacts (-31.5/contact) +
2D Compatibility (PS) -33928 + (NN) -13896 + (LL) 48204
1D Compatibility (HY) -20400 + (ID) 6000
Total energy: -102734.0 ( -42.19 by residue)
QMean score : 0.340
|
|
|