@TOME2 : Inverse Screening by homology:
EDCdb on NR_HUMAN
EDCdb.mol2 - [param]

Each ligand was docked into several models of each receptor. Two main information are presented here: Calculated affinity (pKd) and homology to the docking observed in the PDB for the same family complexes. Caution! The pKd calculated is an approximation and may depend on the size of the ligand. It is calculated with ligand into the bindind site and does not take into account the insertion step into the pocket (possibility of false positives) Click on pKd for more details on the different complexes and to visualize the favorite docking modes. Click on the receptors to see how they were modeled. Tab legend : Many complexes were calculated. Only the best is selected here: Value = ‹ pKd ›: Calculated affinity for the selected complex : [ ‹nMol | ‹μMol | ‹mMol ] Cells background color: Deviation from the profile of homologous contacts ligand/receptor observed in the PDB [ Good | Correct | Uncertain | Dubius ]

	Receptors	Complexes found	10342051	10436	104926	104942	105101	10522	1057	107377	10742	10747	107664	10787	107953	10800	108023	108120	10943	10953367	11164	11169	11334	11381	1140	11442	114716	11473	114900	117666	11843	11852	11855	119106	119359	119363	11954126	11954129	11954193	119704	12101	12110098	12251	12271304	12309466	12310947	123504	12358480	124052	12433	12580	12968	130490	130780	13089	13254	13263	13283771	13450	135	13618	13636	13878	13940	14252255	14327	14346	14347	1480	14851	14855	1486	1489	149104	1493	15202	154083	15413	15415	15420	155094	15509894	15509895	15509897	155166	15530	15531	156224	15625	15730	15731	15787	15788	158629	15910	15939	15965	16034	16115	16248	162807	16305	16318	16323	1639	16421	16422	16653	16945	17097	17132	1732	17348	174	17432	17435	17481	1752	17522	17533	17570	176111	177368	177947	1794427	181883	183016	183679	19539	1982	1988	20392	20393	20774	2078	20965	213031	21387	21510	21803	21804	21805	219592	22094	222	22544	2256	22563	2268	2286	2288503	23017	2314	2328	2336	23448	2347	241	243	246598	249266	2519	25429	25552	25641	2566	25669	25890	26124	26975	269933	27144	2723	2723650	2723790	2728	2730	27582	28115	2812	28780	2879	289	28936	2912	29307	29352	29353	29354	29393	2950	29732	299	3017	3026	3032832	3035	3036	3037	3039	30479	30709	30773	30814	3082	3102	3120	31200	31233	31242	31369	31373	31736	32154	3220	32230	3224	32490	32781	3286	32872	3292100	3293	3317081	3346	3347	33473	3352	3391107	34192	34277	34454	34466	34469	34526	3496	35823	3589	359	3598	3610	36159	36187	36188	36231	36242	36250	36324	36342	36400	36401	36647	36678	36679	36870	36980	36981	36982	37034	37035	37036	37123	37175	37247	37248	37249	37419	37517	3758	37766	37803	38016	38018	38019	38024	38033	38038	38213	38479	38779	38884	39040	39230	39327	39385	39676	39728	39729	39929	39985	4004	402	40326	40470	40585	40813	4115	4130	41368	41539	41540	4169	4201081	42027	4211	42131	42134	42138	42272	4277	42839	42844	42851	42948	43226	43234	43255	43495	439533	44101	442731	443036	445858	4534	45356241	4632	4684	47167	47299	47300	4764	4766	4767	4788	4793	47936	480764	4929	4937	4944	49923	49931	49973	50516	5053	5054	50610	50897	50980	5100	51041	51126	51130	5125	513197	51439	51605	519286	5216	526436	526437	5280343	5280373	5280443	5280445	5280489	5280863	5281576	5281607	5281707	5281708	5281873	5282363	5284378	5284469	5284645	53036	5317742	5317750	5327	53309	53524	5353758	5354198	5355130	5355863	5366546	5371562	5372477	5377791	5455	54696004	55103	55104	55111	55112	55119	55125	55130	55133	5564	5569	5794	5853	5889665	5943	60027	60059	60312	608116	6129	61529	61585	61899	6197	6228	62329	6253	62530	6271	6293	6294	63090	63103	63107	6319	6336	6344	6348	6354	637541	6421	6434217	6434236	6442842	656687	656688	6597	66030	66166	6618	6623	6626	6643	66461	66494	66495	66603	6669	6697	67114	67174	6720	67542	6776	6777	6781	67818	6782	6786	6795	6857447	6899	6914	69149	6931	69371	6950	6982	7005	7017	7095	7103	7112	71245	7153	7158	7175	7180	7184	7204	7206	7207	72281	7237	7239	7245	7257	7258	727	7270	7271	7276	7280	7290	7328	73665	73670	73852	73864	7393	7416	74483	7452	7453	7456	7469	74843	7501	7547	75607	7563	75767	76302	7637	7638	76739	7705	7808	7809	7835	7839	785	7904	7929	7933	7955	79688	7971	8019	8035	8058	80630	80801	8227	82315	8259	8268	8289	8342	8361	8362	8370	8371	8376	83975	8418	8427	8434	8449	8461	84677	8559	8570	8571	8572	8575	86102	86132	86138	86173	86291	86300	86367	86398	86429	8663	8690	8697	8814	8844	89440	89594	91469	91497	91632	91642	91644	91650	91656	91662	91664	91683	91686	91687	91689	91692	91693	91699	91716	91753	91776	92256	92292	92383	9298	932	9395	9411	9502	95170	9554	9570071	9595287	969491	97032	97701	9777	980	99016	991	992	9958	996	CID5280961.pdb
1	H_NR1A2_THRb	469	6.7	4.7	8.4	6.7	7.1	5.6	4.4	6.4	4.4	?	7.3	4.4	6.2	5.1	6.8	6.1	?	5.8	2.9	2.5	4.2	5.4	?	6.8	7.1	3.2	6.3	5.4	4.2	5.8	5.3	?	?	6.3	5.9	5.7	7.0	6.1	4.4	?	3.3	5.9	4.4	?	?	4.3	8.4	3.7	?	4.6	?	9.5	?	5.2	5.8	?	5.9	3.7	4.7	4.7	?	4.1	7.5	5.6	5.4	5.3	6.0	?	?	5.4	6.4	6.7	4.8	5.1	7.5	3.0	5.4	5.1	8.4	7.0	6.8	7.6	7.5	4.8	4.8	7.4	5.5	6.4	5.1	6.3	6.8	7.3	5.0	5.0	4.9	3.8	6.4	5.3	5.4	5.4	6.6	5.5	3.2	?	?	4.9	6.2	7.0	5.7	?	6.6	?	4.9	6.2	5.7	?	5.6	?	5.3	?	?	7.4	6.0	6.3	?	5.9	5.6	?	?	?	?	3.6	5.6	?	6.4	6.3	?	5.8	?	?	5.9	?	2.8	5.2	5.5	4.8	6.0	8.2	6.6	?	4.9	4.9	6.9	6.3	6.9	3.4	3.6	?	4.8	5.2	?	?	5.9	5.1	?	7.2	?	5.2	5.2	5.2	4.9	2.5	3.4	?	6.4	?	?	7.2	5.2	3.7	3.9	?	6.7	?	4.3	5.4	5.8	5.3	5.2	6.5	5.2	?	5.9	8.5	5.4	?	6.6	4.4	?	7.0	5.8	5.3	4.4	4.7	5.2	?	5.2	3.9	?	3.6	5.4	?	5.7	7.2	4.2	4.7	?	6.9	7.2	?	5.9	?	?	8.2	6.6	7.8	7.3	?	?	?	6.0	5.7	6.4	?	7.0	?	4.3	7.5	5.8	7.3	6.6	?	7.3	6.2	6.7	6.8	5.6	7.0	6.6	7.3	6.0	5.1	7.2	?	5.6	5.6	6.8	7.3	?	5.5	?	6.1	?	6.5	?	5.6	5.6	6.6	?	6.8	7.4	7.1	6.7	?	6.0	6.3	5.5	7.0	6.6	5.5	?	7.8	?	?	5.6	5.6	6.2	7.6	5.8	?	7.1	7.4	7.2	5.9	6.6	5.7	6.2	?	5.9	?	6.0	7.4	6.5	6.2	6.1	6.7	7.7	5.3	6.7	6.1	6.6	6.2	7.2	7.1	5.7	5.8	6.4	6.0	6.0	6.0	4.5	8.1	7.8	5.4	3.7	?	?	6.3	6.4	?	8.4	6.3	6.6	?	6.9	5.9	5.7	4.7	6.8	5.5	6.2	?	?	4.1	4.9	?	?	5.6	?	6.3	7.0	7.5	6.1	7.3	7.1	6.1	5.2	?	6.7	6.7	6.7	?	7.4	?	5.8	?	6.8	6.0	7.1	?	6.3	5.7	4.2	5.6	7.0	6.6	6.6	6.5	?	6.6	?	5.5	7.2	4.7	7.1	4.8	?	7.3	3.9	3.5	6.2	?	6.3	?	5.5	5.7	6.2	6.1	?	5.8	?	?	4.3	3.2	?	5.6	5.6	5.8	4.8	5.5	5.6	6.0	?	2.5	5.3	?	?	?	6.0	?	6.8	6.8	6.9	6.7	5.8	3.3	3.9	2.8	4.4	3.0	5.4	?	?	6.9	6.5	3.5	7.7	6.4	7.5	6.3	6.4	4.6	6.7	6.2	6.6	5.0	5.4	5.7	4.8	6.0	5.8	?	?	5.5	4.9	5.0	5.8	6.1	?	?	?	4.4	5.6	4.5	?	5.3	5.2	?	4.8	4.3	4.9	4.9	?	5.7	6.4	?	5.6	5.1	5.3	?	6.1	?	?	?	3.7	4.1	4.2	5.1	4.7	4.4	?	?	3.5	6.7	8.0	7.1	?	5.7	4.2	3.8	5.6	4.3	4.8	3.6	?	7.6	?	5.8	5.6	5.7	6.2	6.5	5.8	6.1	6.4	4.2	3.8	?	3.0	?	3.9	2.8	?	4.1	3.6	5.1	3.9	3.3	3.7	3.3	6.3	7.2	6.9	4.4	3.3	?	7.2	4.6	?	?	5.6	4.4	4.8	?	?	5.7	4.2	4.2	4.5	?	5.3	6.1	5.4	?	4.7	6.8	?	?	8.3	5.1	6.1	6.0	?	5.5	4.3	5.9	4.4	5.1	?	5.6	4.6	7.1	?	4.8	6.8	6.7	5.6	7.6	6.7	5.9	6.8	6.9	6.0	?	6.4	7.3	6.9	6.1	7.4	?	6.1	?	7.8	6.1	6.5	6.3	5.1	5.3	6.9	5.7	?	4.3	?	7.3	4.6	?	?	?	6.4	5.5	4.4	3.4	6.6
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