@TOME V3
(Feb 2022)
Ref.
-
-
Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Atome Result
Tools Result
PDB occurence
3D Alignment Cluster
Sequence Color type :
Secondary Structure
Hydrophobicity
Disulfide Bonds
TCoffee Identity Score
Uniprot annotation
3D Alignment Cluster
Contacts with Ligands
Show alignment :
Atome selection
All alignments
Only Template with Ligand
Column output:
Score:
Atome Rank Value
Tools Score
Hide column
Alignment:
Sequence Identity (%)
Tcoffee Alignment Score
Hide column
3D Common Core:
Tito PKB Score
Verify3D Score
QMean Score
Hide column
Structural Clustering:
Cluster Num
3D-Jury Score
Hide column
Modeller Result :
Model Rank
QMean Score
Dfire Score
Dope Score
Errat Score
Verify3D Score
Modeller Score
Hide column
Complexes Modeling
PDB Ligands
Affinity Score
Binding Site Identity
Hide column
Templates Information:
Uniprot entry
Cath class
Scop class
Smart class
Prosite class
Pfam class
EC Number
Taxonomy
Experiment Method
Hide column
Sequence & Result Tab:
Sequence Alignment
Tab of Complexes
Values color: [
Good
|
Correct
|
Middling
|
Bad
]
Sequence color :
Mutated
Helix
Strand
Conserved
Query sequence : GMDS_HUMAN: (2020-02-01 )
MAHAPARCPSARGSGDGEMGKPRNVALITGITGQDGSYLAEFLLEKGYEVHGIVRRSSSFNTGRIEHLYKNPQAHIEGNMKLHYGDLTDSTCLVKIINEVKPTEIYNLGAQSHVKISFDLAEYTADVDGVGTLRLLDAVKTCGLINSVKFYQASTSELYGKVQEIPQKETTPFYPRSPYGAAKLYAYWIVVNFREAYNLFAVNGILFNHESPRRGANFVTRKISRSVAKIYLGQLECFSLGNLDAKRDWGHAKDYVEAMWLMLQNDEPEDFVIATGEVHSVREFVEKSFLHIGKTIVWEGKNENEVGRCKETGKVHVTVDLKYYRPTEVDFLQGDCTKAKQKLNWKPRVAFDELVREMVHADVELMRTNPNA
Atome Classification :
(21 SA)
.........10........20........30........40........50........60........70.....-...80........90........100.......110.......120.......130.......140-..--.--.--...150.......160----........170.......180.......190.......200.......210---.........220.......230.......240..--.....250.......260...--....270.......280.......290..-.....300.--..--....310----..----------.......320.......330.......340.......350.......360.......370
(Atome)
(Ident)
(Tito)
(Num)
(QMean)
(Ligand)
(Uniprot)
MAHAPARCPSARGSGDGEMGKPR
N
V
A
L
I
T
GITGQ
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
EKGY
E
V
H
G
I
V
RRSSSFNT
G
R
I
E
H
L
YKNPQ
A
H
I
-EG
N
M
K
L
H
YGDLTD
S
T
C
L
V
K
I
I
N
EVKPT
E
I
Y
NLGAQ
S
H
V
K
I
S
F
D
L
A
E
YTADVDG
V
G
T
L
R
L
L
D
A
V
K
T
C-GL--I--N--
S
V
K
F
Y
QA
S
T
S
E
L
Y
G
K
-----
V
Q
EIPQKETTPFYPRSPYGA
A
K
L
Y
A
Y
W
I
V
V
N
F
R
EA
Y
N
L
F
A
V
N
G
I
L
FNHE-----SPRR
G
A
N
F
V
T
R
K
I
S
R
S
V
A
K
I
Y
LGQ
L
E
C
F
SLGNLD--AKRDWG
H
A
K
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
LQN--DEPE
D
F
V
I
ATG
E
V
H
S
V
R
E
F
V
E
K
S
F
L
H
IG
K
-
T
I
V
WEGKNE--NE--VGRCK------ET----------
G
K
V
H
V
T
V
D
L
K
YYRPTEV
D
F
LQG
D
C
T
K
A
K
Q
KLNWKPRV
A
F
D
E
L
V
R
E
M
V
H
A
D
V
E
L
MRTNPNA
4
PsiBlast_PDB
98.56
100%
-81
- C1 -
-
5IN4
5
GMDS_HUMAN
A:
[15-364]
----------------------
R
N
V
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
V
R
R
S
S
S
F
N
T
G
R
I
E
H
L
Y
K
N
P
Q
A
H
I
-
E
G
N
M
K
L
H
Y
G
D
L
T
D
S
T
C
L
V
K
I
I
N
E
V
K
P
T
E
I
Y
N
L
G
A
Q
S
H
V
K
I
S
F
D
L
A
E
Y
T
A
D
V
D
G
V
G
T
L
R
L
L
D
A
V
K
T
C
-
G
L
--
I
--
N
--
S
V
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
K
-----
V
Q
E
I
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
A
A
K
L
Y
A
Y
W
I
V
V
N
F
R
E
A
Y
N
L
F
A
V
N
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
R
R
G
A
N
F
V
T
R
K
I
S
R
S
V
A
K
I
Y
L
G
Q
L
E
C
F
S
L
G
N
L
D
--
A
K
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
N
--
D
E
P
E
D
F
V
I
A
T
G
E
V
H
S
V
R
E
F
V
E
K
S
F
L
H
I
G
K
-
T
I
V
W
E
G
K
N
E
--
N
E
--
V
G
R
C
K
------
E
T
----------
G
K
V
H
V
T
V
D
L
K
Y
Y
R
P
T
E
V
D
F
L
Q
G
D
C
T
K
A
K
Q
K
L
N
W
K
P
R
V
A
F
D
E
L
V
R
E
M
V
H
A
D
V
E
L
M
R
T
N
P
N
A
36
HHSearch
98.26
98%
-81
- C1 -
-
6GPK
11
GMDS_HUMAN
B:
[24-373]
----------------------
R
N
V
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
V
R
R
S
S
S
F
N
T
G
R
I
E
H
L
Y
K
N
P
Q
A
H
I
-
E
G
N
M
K
L
H
Y
G
D
L
T
D
S
T
C
L
V
K
I
I
N
E
V
K
P
T
E
I
Y
N
L
G
A
Q
S
H
V
K
I
S
F
D
L
A
E
Y
T
A
D
V
D
G
V
G
T
L
R
L
L
D
A
V
K
T
C
-
G
L
--
I
--
N
--
S
V
K
F
Y
Q
A
S
T
S
Q
L
Y
G
K
-----
V
Q
E
I
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
A
A
K
L
Y
A
Y
W
I
V
V
N
F
R
E
A
Y
N
L
F
A
V
N
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
R
R
G
A
N
F
V
T
R
K
I
S
R
S
V
A
K
I
Y
L
G
Q
L
E
C
F
S
L
G
N
L
D
--
A
K
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
N
--
D
E
P
E
D
F
V
I
A
T
G
E
V
H
S
V
R
E
F
V
E
K
S
F
L
H
I
G
K
-
T
I
V
W
E
G
K
N
E
--
N
E
--
V
G
R
C
K
------
E
T
----------
G
K
V
H
V
T
V
D
L
K
Y
Y
R
P
T
E
V
D
F
L
Q
G
D
C
T
K
A
K
Q
K
L
N
W
K
P
R
V
A
F
D
E
L
V
R
E
M
V
H
A
D
V
E
L
M
R
T
N
P
N
A
6
PsiBlast_PDB
97.53
99%
-79
- C1 -
-
6GPK
16
GMDS_HUMAN
A:
[24-373]
----------------------
R
N
V
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
V
R
R
S
S
S
F
N
T
G
R
I
E
H
L
Y
K
N
P
Q
A
H
I
-
E
G
N
M
K
L
H
Y
G
D
L
T
D
S
T
C
L
V
K
I
I
N
E
V
K
P
T
E
I
Y
N
L
G
A
Q
S
H
V
K
I
S
F
D
L
A
E
Y
T
A
D
V
D
G
V
G
T
L
R
L
L
D
A
V
K
T
C
-
G
L
--
I
--
N
--
S
V
K
F
Y
Q
A
S
T
S
Q
L
Y
G
K
-----
V
Q
E
I
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
A
A
K
L
Y
A
Y
W
I
V
V
N
F
R
E
A
Y
N
L
F
A
V
N
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
R
R
G
A
N
F
V
T
R
K
I
S
R
S
V
A
K
I
Y
L
G
Q
L
E
C
F
S
L
G
N
L
D
--
A
K
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
N
--
D
E
P
E
D
F
V
I
A
T
G
E
V
H
S
V
R
E
F
V
E
K
S
F
L
H
I
G
K
-
T
I
V
W
E
G
K
N
E
--
N
E
--
V
G
R
C
K
------
E
T
----------
G
K
V
H
V
T
V
D
L
K
Y
Y
R
P
T
E
V
D
F
L
Q
G
D
C
T
K
A
K
Q
K
L
N
W
K
P
R
V
A
F
D
E
L
V
R
E
M
V
H
A
D
V
E
L
M
R
T
N
P
N
A
5
PsiBlast_PDB
96.43
100%
-78
- C1 -
-
5IN5
6
GMDS_HUMAN
A:
[15-364]
----------------------
R
N
V
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
V
R
R
S
S
S
F
N
T
G
R
I
E
H
L
Y
K
N
P
Q
A
H
I
-
E
G
N
M
K
L
H
Y
G
D
L
T
D
S
T
C
L
V
K
I
I
N
E
V
K
P
T
E
I
Y
N
L
G
A
Q
S
H
V
K
I
S
F
D
L
A
E
Y
T
A
D
V
D
G
V
G
T
L
R
L
L
D
A
V
K
T
C
-
G
L
--
I
--
N
--
S
V
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
K
-----
V
Q
E
I
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
A
A
K
L
Y
A
Y
W
I
V
V
N
F
R
E
A
Y
N
L
F
A
V
N
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
R
R
G
A
N
F
V
T
R
K
I
S
R
S
V
A
K
I
Y
L
G
Q
L
E
C
F
S
L
G
N
L
D
--
A
K
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
N
--
D
E
P
E
D
F
V
I
A
T
G
E
V
H
S
V
R
E
F
V
E
K
S
F
L
H
I
G
K
-
T
I
V
W
E
G
K
N
E
--
N
E
--
V
G
R
C
K
------
E
T
----------
G
K
V
H
V
T
V
D
L
K
Y
Y
R
P
T
E
V
D
F
L
Q
G
D
C
T
K
A
K
Q
K
L
N
W
K
P
R
V
A
F
D
E
L
V
R
E
M
V
H
A
D
V
E
L
M
R
T
N
P
N
A
3
PsiBlast_PDB
96.12
100%
-81
- C1 -
-
6GPL
10
GMDS_HUMAN
B:
[3-352]
----------------------
R
N
V
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
V
R
R
S
S
S
F
N
T
G
R
I
E
H
L
Y
---------
G
N
M
K
L
H
Y
G
D
L
T
D
S
T
C
L
V
K
I
I
N
E
V
K
P
T
E
I
Y
N
L
G
A
Q
S
H
V
K
I
S
F
D
L
A
E
Y
T
A
D
V
D
G
V
G
T
L
R
L
L
D
A
V
K
T
C
-
G
L
--
I
--
N
--
S
V
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
K
-----
V
Q
E
I
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
A
A
K
L
Y
A
Y
W
I
V
V
N
F
R
E
A
Y
N
L
F
A
V
N
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
R
R
G
A
N
F
V
T
R
K
I
S
R
S
V
A
K
I
Y
L
G
Q
L
E
C
F
S
L
G
N
L
D
--
A
K
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
N
--
D
E
P
E
D
F
V
I
A
T
G
E
V
H
S
V
R
E
F
V
E
K
S
F
L
H
I
G
K
-
T
I
V
W
E
G
K
N
E
--
N
E
--
V
G
R
C
K
------
E
T
----------
G
K
V
H
V
T
V
D
L
K
Y
Y
R
P
T
E
V
D
F
L
Q
G
D
C
T
K
A
K
Q
K
L
N
W
K
P
R
V
A
F
D
E
L
V
R
E
M
V
H
A
D
V
E
L
M
R
T
N
P
N
A
2
PsiBlast_PDB
94.61
100%
-81
- C1 -
-
6GPJ
5
GMDS_HUMAN
A:
[3-352]
----------------------
R
N
V
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
V
R
R
S
S
S
F
N
T
G
R
I
E
H
L
Y
----------
N
M
K
L
H
Y
G
D
L
T
D
S
T
C
L
V
K
I
I
N
E
V
K
P
T
E
I
Y
N
L
G
A
Q
S
H
V
K
I
S
F
D
L
A
E
Y
T
A
D
V
D
G
V
G
T
L
R
L
L
D
A
V
K
T
C
-
G
L
--
I
--
N
--
S
V
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
K
-----
V
Q
E
I
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
A
A
K
L
Y
A
Y
W
I
V
V
N
F
R
E
A
Y
N
L
F
A
V
N
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
R
R
G
A
N
F
V
T
R
K
I
S
R
S
V
A
K
I
Y
L
G
Q
L
E
C
F
S
L
G
N
L
D
--
A
K
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
N
--
D
E
P
E
D
F
V
I
A
T
G
E
V
H
S
V
R
E
F
V
E
K
S
F
L
H
I
G
K
-
T
I
V
W
E
G
K
N
E
--
N
E
--
V
G
R
C
K
------
E
T
----------
G
K
V
H
V
T
V
D
L
K
Y
Y
R
P
T
E
V
D
F
L
Q
G
D
C
T
K
A
K
Q
K
L
N
W
K
P
R
V
A
F
D
E
L
V
R
E
M
V
H
A
D
V
E
L
M
R
T
N
P
N
A
1
PsiBlast_PDB
92.52
99%
-81
- C1 -
-
1T2A
3
GMDS_HUMAN
A:
[24-370]
----------------------
R
N
V
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
V
R
R
S
S
S
F
N
T
G
R
I
E
H
L
Y
----------
N
M
K
L
H
Y
G
D
L
T
D
S
T
C
L
V
K
I
I
N
E
V
K
P
T
E
I
Y
N
L
G
A
Q
S
H
V
K
I
S
F
D
L
A
E
Y
T
A
D
V
D
G
V
G
T
L
R
L
L
D
A
V
K
T
C
-
G
L
--
I
--
N
--
S
V
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
K
-----
V
Q
E
I
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
A
A
K
L
Y
A
Y
W
I
V
V
N
F
R
E
A
Y
N
L
F
A
V
N
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
R
R
G
A
N
F
V
T
R
K
I
S
R
S
V
A
K
I
Y
L
G
Q
L
E
C
F
S
L
G
N
L
D
--
A
K
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
N
--
D
E
P
E
D
F
V
I
A
T
G
E
V
H
S
V
R
E
F
V
E
K
S
F
L
H
I
G
K
-
T
I
V
W
E
G
K
N
E
--
N
E
--
V
G
R
C
K
------
E
T
----------
G
K
V
H
V
T
V
D
L
K
Y
Y
R
P
T
E
V
D
F
L
Q
G
D
C
T
K
A
K
Q
K
L
N
W
K
P
R
V
A
F
D
E
L
V
R
E
M
V
H
A
D
V
E
L
M
R
T
N
---
38
HHSearch
82.26
68%
-62
- C1 -
-
5UZH
5
?
A:
[1-344]
----------------------
S
K
V
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
M
V
Y
G
I
I
R
R
S
S
S
F
N
T
G
R
V
E
H
L
Y
K
D
I
H
-
I
T
-
K
A
K
F
K
L
L
Y
G
D
L
T
D
T
G
N
L
I
S
I
I
A
K
I
K
P
D
E
I
Y
N
L
A
A
Q
S
H
V
K
V
S
F
E
M
P
E
Y
T
A
N
V
D
G
I
G
T
L
R
L
L
E
A
I
R
A
C
-
G
L
--
E
--
K
--
K
T
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
L
-----
V
Q
E
V
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
A
C
A
K
L
Y
S
Y
W
I
V
V
N
Y
R
E
A
Y
N
M
F
A
L
N
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
I
R
R
G
P
T
F
V
T
R
K
I
T
M
A
V
A
R
I
K
L
G
L
Q
D
C
L
Y
L
G
N
L
D
--
A
E
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
--
E
Q
P
R
D
F
C
V
A
T
G
E
K
H
S
V
R
E
F
V
E
K
A
F
A
C
I
G
Q
-
T
V
E
W
K
G
E
R
G
TV
E
E
--
H
G
V
V
D
------
G
V
----------
V
R
--
V
R
V
D
P
R
Y
F
R
P
T
E
V
D
Q
L
L
G
D
P
T
L
A
E
T
V
L
G
W
K
R
K
V
S
F
E
E
L
V
R
G
M
V
E
G
D
I
E
L
L
Q
-----
40
HHSearch
77.52
57%
-74
- C1 -
-
2Z1M
2
?
A:
[3-339]
----------------------
G
K
R
A
L
I
T
G
I
R
G
Q
D
G
A
Y
L
A
K
L
L
L
E
K
G
Y
E
V
Y
G
A
D
R
R
S
G
E
F
A
S
W
R
L
K
E
L
-
G
-----
I
-
E
N
D
V
K
I
I
H
M
D
L
L
E
F
S
N
I
I
R
T
I
E
K
V
Q
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
F
V
G
V
S
F
E
Q
P
I
L
T
A
E
V
D
A
I
G
V
L
R
I
L
E
A
L
R
T
V
-
K
------
P
--
D
T
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
M
F
G
K
-----
V
Q
E
I
P
Q
T
E
K
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
A
V
A
K
L
F
G
H
W
I
T
V
N
Y
R
E
A
Y
N
M
F
A
C
S
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
L
R
G
I
E
F
V
T
R
K
I
T
Y
S
L
A
R
I
K
Y
G
L
Q
D
K
L
V
L
G
N
L
N
--
A
K
R
D
W
G
Y
A
P
E
Y
V
E
A
M
W
L
M
M
Q
Q
--
P
E
P
D
D
Y
V
I
A
T
G
E
T
H
T
V
R
E
F
V
E
K
A
A
K
I
A
G
F
-
D
I
E
W
V
G
E
G
I
--
N
E
--
K
G
I
D
R
------
N
T
----------
G
K
V
I
V
E
V
S
E
E
F
F
R
P
A
E
V
D
I
L
V
G
N
P
E
K
A
M
K
K
L
G
W
K
P
R
T
T
F
D
E
L
V
E
I
M
M
E
A
D
L
K
R
V
R
-----
11
PsiBlast_PDB
75.66
56%
-77
- C1 -
-
2Z1M
2
?
A:
[6-339]
-------------------------
A
L
I
T
G
I
R
G
Q
D
G
A
Y
L
A
K
L
L
L
E
K
G
Y
E
V
Y
G
A
D
R
R
S
G
E
F
A
S
W
R
L
K
E
L
------
G
I
-
E
N
D
V
K
I
I
H
M
D
L
L
E
F
S
N
I
I
R
T
I
E
K
V
Q
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
F
V
G
V
S
F
E
Q
P
I
L
T
A
E
V
D
A
I
G
V
L
R
I
L
E
A
L
R
T
V
-
K
------
P
--
D
T
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
M
F
G
K
-----
V
Q
E
I
P
Q
T
E
K
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
A
V
A
K
L
F
G
H
W
I
T
V
N
Y
R
E
A
Y
N
M
F
A
C
S
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
L
R
G
I
E
F
V
T
R
K
I
T
Y
S
L
A
R
I
K
Y
G
L
Q
D
K
L
V
L
G
N
L
N
--
A
K
R
D
W
G
Y
A
P
E
Y
V
E
A
M
W
L
M
M
Q
Q
--
P
E
P
D
D
Y
V
I
A
T
G
E
T
H
T
V
R
E
F
V
E
K
A
A
K
I
A
G
F
-
D
I
E
W
V
G
E
G
I
--
N
E
--
K
G
I
D
R
------
N
T
----------
G
K
V
I
V
E
V
S
E
E
F
F
R
P
A
E
V
D
I
L
V
G
N
P
E
K
A
M
K
K
L
G
W
K
P
R
T
T
F
D
E
L
V
E
I
M
M
E
A
D
L
K
R
V
R
-----
12
PsiBlast_PDB
73.07
56%
-76
- C1 -
-
2Z95
1
?
A:
[6-339]
-------------------------
A
L
I
T
G
I
R
G
Q
D
G
A
Y
L
A
K
L
L
L
E
K
G
Y
E
V
Y
G
A
D
R
-----
A
S
W
R
L
K
E
L
------
G
I
-
E
N
D
V
K
I
I
H
M
D
L
L
E
F
S
N
I
I
R
T
I
E
K
V
Q
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
F
V
G
V
S
F
E
Q
P
I
L
T
A
E
V
D
A
I
G
V
L
R
I
L
E
A
L
R
T
V
-
K
------
P
--
D
T
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
M
F
G
K
-----
V
Q
E
I
P
Q
T
E
K
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
A
V
A
K
L
F
G
H
W
I
T
V
N
Y
R
E
A
Y
N
M
F
A
C
S
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
L
R
G
I
E
F
V
T
R
K
I
T
Y
S
L
A
R
I
K
Y
G
L
Q
D
K
L
V
L
G
N
L
N
--
A
K
R
D
W
G
Y
A
P
E
Y
V
E
A
M
W
L
M
M
Q
Q
--
P
E
P
D
D
Y
V
I
A
T
G
E
T
H
T
V
R
E
F
V
E
K
A
A
K
I
A
G
F
-
D
I
E
W
V
G
E
G
I
--
N
E
--
K
G
I
D
R
------
N
T
----------
G
K
V
I
V
E
V
S
E
E
F
F
R
P
A
E
V
D
I
L
V
G
N
P
E
K
A
M
K
K
L
G
W
K
P
R
T
T
F
D
E
L
V
E
I
M
M
E
A
D
L
K
R
V
R
-----
37
HHSearch
71.09
60%
-44
- C1 -
-
1DB3
-
GM4D_ECOLI
A:
[1-357]
----------------------
S
K
V
A
L
I
T
G
V
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
K
R
-----------------------
P
K
F
H
L
H
Y
G
D
L
S
D
T
S
N
L
T
R
I
L
R
E
V
Q
P
D
E
V
Y
N
L
G
A
M
S
H
V
A
V
S
F
E
S
P
E
Y
T
A
D
V
D
A
M
G
T
L
R
L
L
E
A
I
R
F
L
-
G
L
--
E
--
K
--
K
T
R
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
L
-----
V
Q
E
I
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
A
V
A
K
L
Y
A
Y
W
I
T
V
N
Y
R
E
S
Y
G
M
Y
A
C
N
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
R
R
G
E
T
F
V
T
R
K
I
T
R
A
I
A
N
I
A
Q
G
L
E
S
C
L
Y
L
G
N
M
D
--
S
L
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
K
M
Q
W
M
M
L
Q
Q
--
E
Q
P
E
D
F
V
I
A
T
G
V
Q
Y
S
V
R
Q
F
V
E
M
A
A
A
Q
L
G
I
-
K
L
R
F
E
G
T
G
V
EE
K
G
IV
V
S
V
T
G
HDAPGV
K
P
----------
G
D
V
I
I
A
V
D
P
R
Y
F
R
P
A
E
-
E
T
L
L
G
D
P
T
K
A
H
E
K
L
G
W
K
P
E
I
T
L
R
E
M
V
S
E
M
V
A
N
D
L
E
A
A
K
K
H
S
--
7
PsiBlast_PDB
71.02
67%
-6
- C1 -
-
5UZH
5
?
A:
[2-345]
-----------------------
K
V
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
M
V
Y
G
I
I
R
R
S
S
S
F
N
T
G
R
V
E
H
L
Y
K
D
--
I
H
I
T
K
A
K
F
K
L
L
Y
G
D
L
T
D
T
G
N
L
I
S
I
I
A
K
I
K
P
D
E
I
Y
N
L
A
A
Q
S
H
V
K
V
S
F
E
M
P
E
Y
T
A
N
V
D
G
I
G
T
L
R
L
L
E
A
I
R
A
C
-
G
L
--
E
--
K
--
K
T
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
L
-----
V
Q
E
V
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
A
C
A
K
L
Y
S
Y
W
I
V
V
N
Y
R
E
A
Y
N
M
F
A
L
N
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
I
R
R
G
P
T
F
V
T
R
K
I
T
M
A
V
A
R
I
K
L
G
L
Q
D
C
L
Y
L
G
N
L
D
--
A
E
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
--
E
Q
P
R
D
F
C
V
A
T
G
E
K
H
S
V
R
E
F
V
E
K
A
F
A
C
I
G
Q
-
T
V
E
W
K
G
E
R
G
--
T
V
--
E
E
H
G
V
------
V
D
----------
G
V
V
R
V
R
V
D
P
R
Y
F
R
P
T
E
V
D
Q
L
L
G
D
P
T
L
A
E
T
V
L
G
W
K
R
K
V
S
F
E
E
L
V
R
G
M
V
E
G
D
I
E
L
L
Q
S
----
13
PsiBlast_PDB
69.18
48%
-75
- C1 -
-
1RPN
3
GM4D_PSEAE
A:
[17-329]
-------------------------
A
L
V
T
G
I
T
G
Q
D
G
A
Y
L
A
K
L
L
L
E
K
G
Y
R
V
H
G
L
V
A
R
R
S
S
D
T
R
W
R
L
R
E
L
------
G
I
-
E
G
D
I
Q
Y
E
D
G
D
M
A
D
A
C
S
V
Q
R
A
V
I
K
A
Q
P
Q
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
F
V
G
A
S
W
N
Q
P
V
T
T
G
V
V
D
G
L
G
V
T
H
L
L
E
A
I
R
Q
F
-
S
------
P
--
E
T
R
F
Y
Q
A
S
T
S
E
M
F
G
L
-----
I
Q
A
E
R
Q
D
E
N
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
V
A
K
L
Y
G
H
W
I
T
V
N
Y
R
E
S
F
G
L
H
A
S
S
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
L
R
G
I
E
F
V
T
R
K
V
T
D
A
V
A
R
I
K
L
G
K
Q
Q
E
L
R
L
G
N
V
D
--
A
K
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
--
D
K
A
D
D
Y
V
V
A
T
G
V
T
T
T
V
R
D
M
C
Q
I
A
F
E
H
V
G
L
-
D
Y
-------------------------------------
R
D
F
L
K
I
D
P
A
F
F
R
P
A
E
V
D
V
L
L
G
N
P
A
K
A
Q
R
V
L
G
W
K
P
R
T
S
L
D
E
L
I
R
M
M
V
E
A
D
L
---------
8
PsiBlast_PDB
69.09
59%
-50
- C1 -
-
1DB3
-
GM4D_ECOLI
A:
[2-351]
-----------------------
K
V
A
L
I
T
G
V
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
K
R
-----------------------
P
K
F
H
L
H
Y
G
D
L
S
D
T
S
N
L
T
R
I
L
R
E
V
Q
P
D
E
V
Y
N
L
G
A
M
S
H
V
A
V
S
F
E
S
P
E
Y
T
A
D
V
D
A
M
G
T
L
R
L
L
E
A
I
R
F
L
-
G
L
--
E
--
K
--
K
T
R
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
L
-----
V
Q
E
I
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
A
V
A
K
L
Y
A
Y
W
I
T
V
N
Y
R
E
S
Y
G
M
Y
A
C
N
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
R
R
G
E
T
F
V
T
R
K
I
T
R
A
I
A
N
I
A
Q
G
L
E
S
C
L
Y
L
G
N
M
D
--
S
L
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
K
M
Q
W
M
M
L
Q
Q
--
E
Q
P
E
D
F
V
I
A
T
G
V
Q
Y
S
V
R
Q
F
V
E
M
A
A
A
Q
L
G
I
-
K
L
R
F
E
G
T
G
V
--
E
E
--
K
G
I
V
V
------
S
V
TGHDAPGVKP
G
D
V
I
I
A
V
D
P
R
Y
F
R
P
A
E
-
E
T
L
L
G
D
P
T
K
A
H
E
K
L
G
W
K
P
E
I
T
L
R
E
M
V
S
E
M
V
A
N
D
L
E
--------
48
HHSearch
61.45
50%
-19
* C1 *
-
1RPN
3
GM4D_PSEAE
B:
[15-334]
-----------------------
R
S
A
L
V
T
G
I
T
G
Q
D
G
A
Y
L
A
K
L
L
L
E
K
G
Y
R
V
H
G
L
V
A
R
R
S
S
D
T
R
W
R
L
R
E
L
G
------
I
-
E
G
D
I
Q
Y
E
D
G
D
M
A
D
A
C
S
V
Q
R
A
V
I
K
A
Q
P
Q
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
F
V
G
A
S
W
N
Q
P
V
T
T
G
V
V
D
G
L
G
V
T
H
L
L
E
A
I
R
Q
F
S
P
---------
E
T
R
F
Y
Q
A
S
T
S
E
M
F
G
L
-----
I
Q
A
E
R
Q
D
E
N
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
V
A
K
L
Y
G
H
W
I
T
V
N
Y
R
E
S
F
G
L
H
A
S
S
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
L
R
G
I
E
F
V
T
R
K
V
T
D
A
V
A
R
I
K
L
G
K
Q
Q
E
L
R
L
G
N
V
D
--
A
K
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
--
D
K
A
D
D
Y
V
V
A
T
G
V
T
T
T
V
R
D
M
C
Q
I
A
F
E
H
V
G
L
-
D
Y
R
D
F
-------------------------------------
L
K
I
D
P
A
F
F
R
P
A
E
V
D
V
L
L
G
N
P
A
K
A
Q
R
V
L
G
W
K
P
R
T
S
L
D
E
L
I
R
M
M
V
E
A
D
L
R
R
V
S
R
----
21
Fugue
61.22
54%
-24
- C1 -
-
1DB3
-
GM4D_ECOLI
A:
[1-357]
----------------------
S
K
V
A
L
I
T
G
V
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
K
R
------------------
P
-----
K
F
H
L
H
Y
G
D
L
S
D
T
S
N
L
T
R
I
L
R
E
V
Q
P
D
E
V
Y
N
L
G
A
M
S
H
V
A
V
S
F
E
S
P
E
Y
T
A
D
V
D
A
M
G
T
L
R
L
L
E
A
I
R
F
L
-
G
L
--
E
--
K
--
K
T
R
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
L
VQEIP
Q
K
E
T
T
P
F
--
Y
P
R
---
S
P
Y
A
V
A
K
L
Y
A
Y
W
I
T
V
N
Y
R
E
S
Y
G
-
M
Y
A
C
N
G
I
L
F
N
H
ESPRR
G
E
----
T
F
V
T
R
K
I
T
R
A
I
A
N
I
A
Q
G
L
E
S
C
L
Y
L
G
N
--MD
S
L
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
K
M
Q
W
M
M
L
Q
-QE-
Q
P
E
D
F
V
I
A
T
G
V
Q
Y
S
V
R
Q
F
V
E
M
A
A
A
Q
L
G
-I
K
L
R
F
E
G
T
G
V
--
E
E
--
K
G
I
V
V
------
S
V
TGHDAPGVKP
G
D
V
I
I
A
V
D
P
R
Y
-
F
R
P
A
E
E
T
L
L
G
D
P
T
K
A
H
E
K
L
G
W
K
P
E
I
T
L
R
E
M
V
S
E
M
V
A
N
D
L
E
---
A
A
K
K
H
49
HHSearch
61.20
50%
-16
- C1 -
-
1RPN
3
GM4D_PSEAE
D:
[14-334]
----------------------
T
R
S
A
L
V
T
G
I
T
G
Q
D
G
A
Y
L
A
K
L
L
L
E
K
G
Y
R
V
H
G
L
V
A
R
R
S
S
D
T
R
W
R
L
R
E
L
G
------
I
-
E
G
D
I
Q
Y
E
D
G
D
M
A
D
A
C
S
V
Q
R
A
V
I
K
A
Q
P
Q
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
F
V
G
A
S
W
N
Q
P
V
T
T
G
V
V
D
G
L
G
V
T
H
L
L
E
A
I
R
Q
F
S
P
---------
E
T
R
F
Y
Q
A
S
T
S
E
M
F
G
L
-----
I
Q
A
E
R
Q
D
E
N
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
V
A
K
L
Y
G
H
W
I
T
V
N
Y
R
E
S
F
G
L
H
A
S
S
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
L
R
G
I
E
F
V
T
R
K
V
T
D
A
V
A
R
I
K
L
G
K
Q
Q
E
L
R
L
G
N
V
D
--
A
K
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
--
D
K
A
D
D
Y
V
V
A
T
G
V
T
T
T
V
R
D
M
C
Q
I
A
F
E
H
V
G
L
-
D
Y
R
D
F
-------------------------------------
L
K
I
D
P
A
F
F
R
P
A
E
V
D
V
L
L
G
N
P
A
K
A
Q
R
V
L
G
W
K
P
R
T
S
L
D
E
L
I
R
M
M
V
E
A
D
L
R
R
V
S
R
----
43
HHSearch
59.26
59%
-10
- C1 -
-
1N7G
3
GMD2_ARATH
B:
[28-354]
----------------------
R
K
I
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
T
E
F
L
L
G
K
G
Y
E
V
H
G
L
I
R
R
S
S
N
F
N
T
Q
R
I
N
H
I
Y
I
D
------
K
A
L
M
K
L
H
Y
A
D
L
T
D
A
S
S
L
R
R
W
I
D
V
I
K
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
H
V
A
V
S
F
E
I
P
D
Y
T
A
D
V
V
A
T
G
A
L
R
L
L
E
A
V
R
S
H
-
T
I
DS
G
--
R
--
T
V
K
Y
Y
Q
A
G
S
S
E
M
F
G
S
-----
T
P
-
P
P
Q
S
E
T
T
P
F
H
P
R
S
P
Y
A
A
S
K
C
A
A
H
W
Y
T
V
N
Y
R
E
A
Y
G
L
F
A
C
N
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
R
R
G
E
N
F
V
T
R
K
I
T
R
A
L
G
R
I
K
V
G
L
Q
T
K
L
F
L
G
N
L
Q
--
A
S
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
--
E
K
P
D
D
Y
V
V
A
T
E
E
G
H
T
V
E
E
F
L
D
V
S
F
G
Y
L
G
L
-
N
W
K
D
Y
-------------------------------------
V
E
I
D
Q
R
Y
F
R
P
A
E
V
D
N
L
Q
G
D
A
S
K
A
K
E
V
L
G
W
K
P
Q
V
G
F
E
K
L
V
K
M
M
V
D
E
D
L
E
L
-------
44
HHSearch
59.19
59%
-12
- C1 -
-
1N7H
2
GMD2_ARATH
A:
[28-355]
----------------------
R
K
I
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
T
E
F
L
L
G
K
G
Y
E
V
H
G
L
I
R
R
S
S
N
F
N
T
Q
R
I
N
H
I
Y
---------
A
L
M
K
L
H
Y
A
D
L
T
D
A
S
S
L
R
R
W
I
D
V
I
K
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
H
V
A
V
S
F
E
I
P
D
Y
T
A
D
V
V
A
T
G
A
L
R
L
L
E
A
V
R
S
H
-
T
I
--
D
SG
R
--
T
V
K
Y
Y
Q
A
G
S
S
E
M
F
G
S
-----
T
P
-
P
P
Q
S
E
T
T
P
F
H
P
R
S
P
Y
A
A
S
K
C
A
A
H
W
Y
T
V
N
Y
R
E
A
Y
G
L
F
A
C
N
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
R
R
G
E
N
F
V
T
R
K
I
T
R
A
L
G
R
I
K
V
G
L
Q
T
K
L
F
L
G
N
L
Q
--
A
S
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
--
E
K
P
D
D
Y
V
V
A
T
E
E
G
H
T
V
E
E
F
L
D
V
S
F
G
Y
L
G
L
-
N
W
K
D
Y
-------------------------------------
V
E
I
D
Q
R
Y
F
R
P
A
E
V
D
N
L
Q
G
D
A
S
K
A
K
E
V
L
G
W
K
P
Q
V
G
F
E
K
L
V
K
M
M
V
D
E
D
L
E
L
A
------
10
PsiBlast_PDB
58.74
55%
-12
- C1 -
-
1N7H
2
GMD2_ARATH
A:
[28-356]
----------------------
R
K
I
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
T
E
F
L
L
G
K
G
Y
E
V
H
G
L
I
R
R
S
S
N
F
N
T
Q
R
I
N
H
I
Y
---------
A
L
M
K
L
H
Y
A
D
L
T
D
A
S
S
L
R
R
W
I
D
V
I
K
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
H
V
A
V
S
F
E
I
P
D
Y
T
A
D
V
V
A
T
G
A
L
R
L
L
E
A
V
R
S
H
-
T
I
--
D
--
S
GR
T
V
K
Y
Y
Q
A
G
S
S
E
M
F
G
S
-----
T
P
P
-
P
Q
S
E
T
T
P
F
H
P
R
S
P
Y
A
A
S
K
C
A
A
H
W
Y
T
V
N
Y
R
E
A
Y
G
L
F
A
C
N
G
I
L
F
N
H
E
-----
S
P
R
R
G
E
N
F
V
T
R
K
I
T
R
A
L
G
R
I
K
V
G
L
Q
T
K
L
F
L
G
N
L
Q
--
A
S
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
--
E
K
P
D
D
Y
V
V
A
T
E
E
G
H
T
V
E
E
F
L
D
V
S
F
G
Y
L
G
---
L
N
W
-----------------------------------
K
D
Y
V
E
I
D
Q
R
Y
F
R
P
A
E
V
D
N
L
Q
G
D
A
S
K
A
K
E
V
L
G
W
K
P
Q
V
G
F
E
K
L
V
K
M
M
V
D
E
D
L
E
L
A
K
-----