@TOME V2.3
(Mar 2018)
Ref.
-
-
Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Atome Result
Tools Result
PDB occurence
Core Structure Cluster
Sequence Color type :
Secondary Structure
Hydrophobicity
Disulfide Bonds
TCoffee Identity Score
Uniprot annotation
Core Structure Cluster
Contacts with Ligands
Show alignment :
Atome selection
All alignments
Only Template with Ligand
Column output:
Score:
Atome Rank Value
Tools Score
Hide column
Alignment:
Sequence Identity (%)
Tcoffee Alignment Score
Hide column
3D Common Core:
Tito PKB Score
Verify3D Score
QMean Score
Hide column
Structural Clustering:
Cluster Num
3D-Jury Struct. Score
Hide column
Modeller Result :
Model Rank
QMean Score
Dfire Score
Dope Score
Errat Score
Verify3D Score
Modeller Score
Hide column
Complexes Modeling
Show Ligands of Templates
Complexes Affinity Score
Main Binding Site Identity
Hide column
Templates Information:
Uniprot entry
Cath class
Scop class
Smart class
Prosite class
Pfam class
EC Number
Taxonomy
Experiment Method
Hide column
Sequence & Result Tab:
PDB Template Sequence
Complexes Tab
Values color: [
Good
|
Correct
|
Middling
|
Bad
]
Sequence color :
Mutated
Helix
Strand
Conserved
Query sequence : A2RQD7_HUMAN: (2017-05-31 )
WYHGPVSRNAAEHLLSSGINGSFLVRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHH
Atome Classification :
(30 SA)
.........10.-....--..-.20........30........40----.-----........50........60........70.....
(Atome)
(Ident)
(Tito)
(Num)
(QMean)
(Ligand)
(Uniprot)
WYHGPVS
R
N
A
A
E
-
H
L
L
S
--SG-IN
G
S
F
L
V
RESESSPGQ
R
S
I
S
L
R
-----Y-----E
G
R
V
Y
H
Y
R
INTASD
G
K
L
Y
VSSE
S
R
F
N
T
L
A
E
L
VHHH
7
PsiBlast_PDB
93.20
98%
-130
- C1 -
-
3UYO
-
A:
[18-93]
W
Y
H
G
P
V
S
R
N
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
G
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
R
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
A
S
D
G
K
L
Y
V
S
S
E
S
R
F
N
T
L
A
E
L
V
H
H
H
9
PsiBlast_PDB
92.86
98%
-133
- C1 -
-
5DC9
3
A:
[18-93]
W
Y
H
G
P
V
S
R
N
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
G
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
R
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
A
S
D
G
K
L
Y
V
S
S
E
S
R
F
N
T
L
A
E
L
V
H
H
H
11
PsiBlast_PDB
92.84
98%
-130
- C1 -
-
3K2M
-
ABL1_HUMAN
A:
[7-82]
W
Y
H
G
P
V
S
R
N
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
G
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
R
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
A
S
D
G
K
L
Y
V
S
S
E
S
R
F
N
T
L
A
E
L
V
H
H
H
294
HHSearch
92.19
99%
-119
- C1 -
-
1OPK
-
ABL1_MOUSE
A:
[107-182]
W
Y
H
G
P
V
S
R
N
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
G
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
R
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
A
S
D
G
K
L
Y
V
S
S
E
S
R
F
N
T
L
A
E
L
V
H
H
H
1
PsiBlast_PDB
91.95
98%
-119
- C1 -
-
1OPK
-
ABL1_MOUSE
A:
[107-182]
W
Y
H
G
P
V
S
R
N
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
G
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
R
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
A
S
D
G
K
L
Y
V
S
S
E
S
R
F
N
T
L
A
E
L
V
H
H
H
281
HHSearch
91.87
99%
-133
- C1 -
-
5DC4
1
A:
[18-93]
W
Y
H
G
P
V
S
R
N
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
G
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
R
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
A
S
D
G
K
L
Y
V
S
S
E
S
R
F
N
T
L
A
E
L
V
H
H
H
6
PsiBlast_PDB
91.80
98%
-128
- C1 -
-
3T04
2
A:
[18-93]
W
Y
H
G
P
V
S
R
N
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
G
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
R
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
A
S
D
G
K
L
Y
V
S
S
E
S
R
F
N
T
L
A
E
L
V
H
H
H
8
PsiBlast_PDB
91.63
98%
-133
- C1 -
-
5DC4
1
A:
[18-93]
W
Y
H
G
P
V
S
R
N
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
G
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
R
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
A
S
D
G
K
L
Y
V
S
S
E
S
R
F
N
T
L
A
E
L
V
H
H
H
5
PsiBlast_PDB
89.49
98%
-126
- C1 -
-
5DC0
-
ABL1_HUMAN
B:
[146-221]
W
Y
H
G
P
V
S
R
N
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
G
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
R
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
A
S
D
G
K
L
Y
V
S
S
E
S
R
F
N
T
L
A
E
L
V
H
H
H
2
PsiBlast_PDB
89.43
98%
-121
- C1 -
-
2FO0
1
ABL1_HUMAN
A:
[104-179]
W
Y
H
G
P
V
S
R
N
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
G
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
R
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
A
S
D
G
K
L
Y
V
S
S
E
S
R
F
N
T
L
A
E
L
V
H
H
H
3
PsiBlast_PDB
88.20
98%
0
- C- -
-
4XEY
-
B:
[12-108]
W
Y
H
G
P
V
S
R
N
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
G
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
R
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
A
S
D
G
K
L
Y
V
S
---
R
F
N
T
L
A
E
L
V
H
H
H
4
PsiBlast_PDB
87.87
98%
-119
- C1 -
-
1OPL
-
ABL1_HUMAN
A:
[146-221]
W
Y
H
G
P
V
S
R
N
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
G
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
R
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
A
S
D
G
K
L
Y
V
S
S
E
S
R
F
N
T
L
A
E
L
V
H
H
H
10
PsiBlast_PDB
87.30
98%
-124
- C1 -
-
2ABL
-
ABL1_HUMAN
A:
[146-221]
W
Y
H
G
P
V
S
R
N
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
G
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
R
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
A
S
D
G
K
L
Y
V
S
S
E
S
R
F
N
T
L
A
E
L
V
H
H
H
275
HHSearch
87.02
87%
-145
- C1 -
-
4EIH
-
A:
[14-89]
W
Y
H
G
P
V
S
R
S
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
L
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
L
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
T
A
D
G
K
V
Y
V
T
A
E
S
R
F
S
T
L
A
E
L
V
H
H
H
13
PsiBlast_PDB
86.78
86%
-145
- C1 -
-
4EIH
-
A:
[14-89]
W
Y
H
G
P
V
S
R
S
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
L
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
L
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
T
A
D
G
K
V
Y
V
T
A
E
S
R
F
S
T
L
A
E
L
V
H
H
H
14
PsiBlast_PDB
79.78
86%
-147
- C1 -
-
2ECD
-
A:
[18-93]
W
Y
H
G
P
V
S
R
S
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
L
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
L
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
T
A
D
G
K
V
Y
V
T
A
E
S
R
F
S
T
L
A
E
L
V
H
H
H
12
PsiBlast_PDB
74.96
98%
-89
- C1 -
-
1AB2
-
A:
[11-86]
W
Y
H
G
P
V
S
R
N
A
A
E
-
Y
L
L
S
--
S
G
-
I
N
G
S
F
L
V
R
E
S
E
S
S
P
G
Q
R
S
I
S
L
R
-----
Y
-----
E
G
R
V
Y
H
Y
R
I
N
T
A
S
D
G
K
L
Y
V
S
S
E
S
R
F
N
T
L
A
E
L
V
H
H
H
292
HHSearch
67.09
35%
-175
- C1 -
-
3US4
-
A:
[7-81]
W
F
H
G
K
I
S
G
Q
E
A
V
-
Q
Q
L
Q
--
P
P
-
E
D
G
L
F
L
V
R
E
S
A
R
H
P
G
D
Y
V
L
C
V
S
-----
F
-----
G
R
D
V
I
H
Y
R
V
L
H
R
-
D
G
H
L
T
I
D
E
A
V
F
F
C
N
L
M
D
M
V
E
H
Y
20
PsiBlast_PDB
64.53
42%
-159
- C1 -
-
1K9A
-
CSK_RAT
A:
[82-162]
W
F
H
G
K
I
T
R
E
Q
A
E
-
R
L
L
Y
--
P
P
-
E
T
G
L
F
L
V
R
E
S
T
N
Y
P
G
D
Y
T
L
C
V
S
-----
C
-----
E
G
K
V
E
H
Y
R
I
M
Y
H
A
S
-
K
L
S
I
D
E
E
V
Y
F
E
N
L
M
Q
L
V
E
H
Y
139
PsiBlast_CBE
63.56
38%
-137
- C1 -
-
1R1Q
1
GRAP2_MOUSE
A:
[11-85]
W
F
H
E
G
L
S
R
H
Q
A
E
-
N
L
L
M
--
G
K
-
D
I
G
F
F
I
I
R
A
S
Q
S
S
P
G
D
F
S
I
S
V
R
-----
H
-----
E
D
D
V
Q
H
F
K
V
M
R
D
T
K
G
N
Y
F
L
W
T
E
-
K
F
P
S
L
N
K
L
V
D
Y
Y
272
PsiBlast_CBE
51.91
40%
12
- C1 -
-
1X27
1
A:
[68-150]
W
F
F
K
N
L
S
R
K
D
A
E
R
Q
L
L
A
--
P
G
N
T
H
G
S
F
L
I
R
E
S
E
S
T
A
G
S
F
S
L
S
V
R
D
F
D
QN
Q
-----
G
E
V
V
K
H
Y
K
I
R
N
L
D
N
G
G
F
Y
I
S
P
R
I
T
F
P
G
L
H
E
L
V
R
H
Y
289
HHSearch
49.34
42%
27
- C1 -
-
1LKK
2
LCK_HUMAN
A:
[6-88]
W
F
F
K
N
L
S
R
K
D
A
E
-
R
Q
L
L
AP
G
N
-
T
H
G
S
F
L
I
R
E
S
E
S
T
A
G
S
F
S
L
S
V
R
-----
D
F
D
QNQ
G
E
V
V
K
H
Y
K
I
R
N
L
D
N
G
G
F
Y
I
S
P
R
I
T
F
P
G
L
H
E
L
V
R
H
Y
260
PsiBlast_CBE
49.02
40%
11
- C1 -
-
1LCJ
2
LCK_HUMAN
A:
[10-92]
W
F
F
K
N
L
S
R
K
D
A
E
R
Q
L
L
A
--
P
G
N
T
H
G
S
F
L
I
R
E
S
E
S
T
A
G
S
F
S
L
S
V
R
D
F
D
QN
Q
-----
G
E
V
V
K
H
Y
K
I
R
N
L
D
N
G
G
F
Y
I
S
P
R
I
T
F
P
G
L
H
E
L
V
R
H
Y
268
PsiBlast_CBE
48.20
40%
19
- C1 -
-
1X27
2
?
E:
[68-150]
W
F
F
K
N
L
S
R
K
D
A
E
R
Q
L
L
A
--
P
G
N
T
H
G
S
F
L
I
R
E
S
E
S
T
A
G
S
F
S
L
S
V
R
DFDQN
Q
-----
G
E
V
V
K
H
Y
K
I
R
N
L
D
N
G
G
F
Y
I
S
P
R
I
T
F
P
G
L
H
E
L
V
R
H
Y
271
PsiBlast_CBE
47.40
40%
19
- C1 -
-
1X27
2
?
B:
[68-150]
W
F
F
K
N
L
S
R
K
D
A
E
R
Q
L
L
A
--
P
G
N
T
H
G
S
F
L
I
R
E
S
E
S
T
A
G
S
F
S
L
S
V
R
D
F
D
QN
Q
-----
G
E
V
V
K
H
Y
K
I
R
N
L
D
N
G
G
F
Y
I
S
P
R
I
T
F
P
G
L
H
E
L
V
R
H
Y
265
PsiBlast_CBE
47.12
40%
16
- C1 -
-
1LKK
2
LCK_HUMAN
A:
[6-88]
W
F
F
K
N
L
S
R
K
D
A
E
R
Q
L
L
A
--
P
G
N
T
H
G
S
F
L
I
R
E
S
E
S
T
A
G
S
F
S
L
S
V
R
D
F
D
QN
Q
-----
G
E
V
V
K
H
Y
K
I
R
N
L
D
N
G
G
F
Y
I
S
P
R
I
T
F
P
G
L
H
E
L
V
R
H
Y
264
PsiBlast_CBE
46.75
40%
8
- C1 -
-
1BHF
2
A:
[9-91]
W
F
F
K
N
L
S
R
K
D
A
E
R
Q
L
L
A
--
P
G
N
T
H
G
S
F
L
I
R
E
S
E
S
T
A
G
S
F
S
L
S
V
R
D
F
D
QN
Q
-----
G
E
V
V
K
H
Y
K
I
R
N
L
D
N
G
G
F
Y
I
S
P
R
I
T
F
P
G
L
H
E
L
V
R
H
Y
269
PsiBlast_CBE
46.09
40%
7
- C1 -
-
1X27
1
?
D:
[68-150]
W
F
F
K
N
L
S
R
K
D
A
E
R
Q
L
L
A
--
P
G
N
T
H
G
S
F
L
I
R
E
S
E
S
T
A
G
S
F
S
L
S
V
R
DFDQN
Q
-----
G
E
V
V
K
H
Y
K
I
R
N
L
D
N
G
G
F
Y
I
S
P
R
I
T
F
P
G
L
H
E
L
V
R
H
Y
266
PsiBlast_CBE
45.98
40%
15
- C1 -
-
1LKL
3
?
A:
[5-87]
W
F
F
K
N
L
S
R
K
D
A
E
R
Q
L
L
A
--
P
G
N
T
H
G
S
F
L
I
R
E
S
E
S
T
A
G
S
F
S
L
S
V
R
D
F
D
QN
Q
-----
G
E
V
V
K
H
Y
K
I
R
N
L
D
N
G
G
F
Y
I
S
P
R
I
T
F
P
G
L
H
E
L
V
R
H
Y
252
PsiBlast_CBE
44.80
40%
20
- C1 -
-
1LCK
2
LCK_HUMAN
A:
[76-158]
W
F
F
K
N
L
S
R
K
D
A
E
R
Q
L
L
A
--
P
G
N
T
H
G
S
F
L
I
R
E
S
E
S
T
A
G
S
F
S
L
S
V
R
D
F
D
QN
Q
-----
G
E
V
V
K
H
Y
K
I
R
N
L
D
N
G
G
F
Y
I
S
P
R
I
T
F
P
G
L
H
E
L
V
R
H
Y