@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : 580_tV_VITVI: (2014-05-11 )
AGACGKSSPDSQALKLIPCATAASDKNAAVSSSCCLQVKKIIQNPSCLCAVVLSNMAKFSGVNPEIAITIPERCNFADRPVGFKCGAYTLP

Atome Classification :

(20 SA) ----------------....--.....10------..--.--.----...-------------.20.....------------.-----------------.---------------------.-----------------30........40.--.--------.--------..------...------50...-----...----------.------.------------60.---------.---.-.---------.---------------....-70-......--------.-..80.--.......90----
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) ----------------AGAC--GKSSPDS------QA--L--K----LIP-------------CATAASDK------------N-----------------A---------------------A-----------------VSSSCCLQVKKII--Q--------N--------PS------CLC------AVVLS-----NMA----------K------F------------S-G---------V---N-P---------E---------------IAIT-I--PERCNF--------A-DRPVG--FKCGAYTLP----
31 SP3 78.5520%-113 - C4 -1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] -----------------------AISCGQ------VA--S--A----IAP-------------CISYARGQ------------G-----------------S---------------------G-----------------PSAGCCSGVRSLN--N--------A--------ARTTADRRAAC------NCLKN-----AAA----------G------V------------S-G---------L---N-A---------G---------------NAAS-I--PSKCGV--------SIPYTISTSTDCSRVN------
23 Fugue 75.1023%-130 - C4 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[5-124] ------------------MCYPGQAFQVPALPACRPL--L--R----LQC-------------NGS--QVP------------------------------E---------------------A-----------------VLRDCCQQLAHI------------S--------EW------CRC------GALYS-----MLD----------S---------------------M---------Y---K-E---------HGAFPRCRREVVKLTAASIT-A----VCRLPIVVDASGD-GAYVC--KDVAAYPDA----
21 Fugue 71.4632% -92 - C4 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] ---------------AIDLC--G-----M------SQ--D--E----LNE-------------CKPAVSKE------------N-----------------PT--------------------S-----------------PSQPCCTALQHA------------D--------FA------CLC------GYKNS-----PWL----------G------S------------F-G---------V---D-P---------E---------------LASA-L--PKQCGL--------A-NAP-----TC----------
20 HHSearch 66.6425%-128 - C4 -1B1U - IAAT_ELECO A:[16-110] ------------------------------------------P----LDS-------------CRWYVSTR------------TCGVGPR-----------L---------------------ATQE--------------MKARCCRQLEAI------------P--------AY------CRC------EAVRILMD--GVV----------T------PSGQHEGRLLQDLP-GCPRQ-----VQ--RAF---------A---------------PKLV-T--EVECNL--------A-TIHG----------------
2 HHSearch 66.0126%-102 - C4 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[2-78] -------------------------TCGQ------VQ--G--N----LAQ-------------CIGFLQKG------------------------------G---------------------V-----------------VPPSCCTGVKNIL--NSSRTTADRR--------AV------CSC--------LKA------AA----------G------A------------VRG---------I---N-P---------N---------------NAEA-L--PGKCGV--------N-IP------------------
1 HHSearch 65.8328% -73 - C4 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-75] ----------------------AIDLCGM------SQ--D--E----LNE-------------CKPAVSKE------------NP----------------T---------------------S-----------------PSQPCCTALQHA------------D--------FA------CLC------GYKNS-----PWL----------G------S------------F-G---------V---D-P---------E---------------LASA-L--PKQCGL--------A-NAP-----------------
25 Fugue 64.3819%-116 - C4 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[1-127] ----------GPMRRERGRQ--GDSSSCE------RQ--V--DRVN-LKP-------------CEQHIMQR------------IMGEQEQYDSYDIRSTRSS---------------------D-----------------QQQRCCDELNEME--N--------T--------QG------CMC------EALQQ-----IME----------N------Q------------C-D---------R---L-QDRQMVQQFKR---------------ELMS-L--PQQCNF--------R-APQ-----RCDLDVSGGRCS
15 HHSearch 63.4025%-108 - C4 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[16-106] ------------------------------------------A----LPA-------------CRPLLRLQ------------CNGSQ-------------VPE-------------------A-----------------VLRDCCQQLAHI------------S--------EW------CRC------GALYS-----MLD----------SMYK---E------------H--GAFPRCRREV---V-K---------L---------------TAAS-I--TAVCRL--------P-IVVD----------------
6 HHSearch 60.1824%-107 - C4 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[3-79] -------------------------TCGQ------VS--S--S----LAP-------------CIPYVRGG------------------------------G---------------------A-----------------VPPACCNGIRNVN--NLARTTPDRQ--------AA------CNC--------LKQ------LS----------A------S------------VPG---------V---N-P---------N---------------NAAA-L--PGKCGV--------S-IP------------------
7 HHSearch 59.5824% -75 - C4 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[3-78] -------------------------TCGQ------VT--S--N----LAP-------------CLAYLRNT------------G---------------------------------------------------------PLGRCCGGVKALV--N--------SARTTEDRQIA------CTC--------LKS-----A-A----------G------A------------ISG---------I---N-L---------G---------------KAAG-L--PSTCGV--------N-IP------------------
26 Fugue 58.9015% -84 - C4 -2LTL - NFU1_YEAST A:[1-119] MGHHHHHHSHMNSQRLIHIK--TLTTPNE------NA--L--K----FLSTDGEMLQTRGSKSIVIKNTDE------------N-----------------L---------------------I-----------------NHSKLAQQIFLQC--P--------G--------VE------SLMIGDDFLTINKD-----RMV----------H------W------------N-S---------I---K-P---------E---------------IIDL-L--TKQLAY--------G-EDVIS--KE-----------
36 SP3 58.7516%-124 * C4 *1HYP - ? ?:[6-80] -----------------PSC--P-------------------D----LSI-------------CLNILGGS------------L-----------------G---------------------T-----------------V-DDCCALIGGLGDIE--------A--------IV------CLC----------------IQL----------R------A------------L-G---------IL--N-L---------N---------------RNLQLI--LNSCG---------R-SYPSN--ATCPRT-------
18 HHSearch 58.7521%-149 - C4 -1SM7 - ? A:[14-100] ------------------------------------------H----LRA-------------CQQWIRQQ------------L-----------------AGSPFSENQWGPQQGP------S-----------------LREQCCNELYQE------------D--------QV------CVC------PTLKQ-----AAKSVRV------QG-----Q------------H-GPFQST----R---I-Y---------Q---------------IAKN-L--PNVCNM--------K-Q-------------------
13 HHSearch 58.7019%-110 - C4 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[16-112] --------------------------CER------QVDRV--N----LKP-------------CEQHIMQR------------I-----------------M---------------------GEQEQYDSYDIRSTRSSDQQQRCCDELNEME--N--------T--------QG------CMC------EALQQ-----IMENQC-------D------R------------LQDRQ-------MVQQF-K---------R---------------ELMS-L--PQQCNF--------R---------------------
19 HHSearch 57.1621%-116 - C4 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[16-109] ------------------------------------------P----LPS-------------CRWYVTSR------------TCGIG-------------PR--------------------LPWPE-------------LKRRCCRELADI------------P--------AY------CRC------TALSILMD--GAI----------P------PGPDAQLEGR---L-EDLPGCPRE-V---Q-R---------G---------------FAAT-LVTEAECNL--------A-TI------------------
4 HHSearch 55.7821% -98 - C4 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[2-78] -------------------------DCGH------VD--S--L----VRP-------------CLSYVQGG------------------------------P---------------------G-----------------PSGQCCDGVKNLH--NQARSQSDRQ--------SA------CNC------LKGIA-----R-------------------G------------IHN---------L---N-E---------D---------------NARS-I--PPKCGV--------N-LP------------------
5 HHSearch 54.9126% -80 - C4 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[3-80] -------------------------SCGQ------VA--S--A----IAP-------------CISYARGQ------------G-----------------S---------------------G-----------------PSAGCCSGVRSLN--NAAR-----TTADRR---AA------CNC--------LKN-----A-A----------A------G------------VSG---------L---N-A---------G---------------NAAS-I--PSKCGV--------S-IP------------------
14 HHSearch 53.0624%-161 - C4 -2DS2 - ? B:[7-63] ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LRQCCNQLRQV------------D--------RP------CVC------PVLRQ-----AAQ----------QVLQRQII------------Q-GPQQLR----R---L-F---------D---------------AARN-L--PNICNI--------P-N-------------------
28 Fugue 51.1719% -92 - C4 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] ---------------PYGRG--RTESGCY------QQ--M--EEAEMLNH-------------CGMYLMKNLGERSQVSPRMRE-----------------E---------------------D-----------------HKQLCCMQLKNL------------D--------EK------CMC------PAIMMMLNEPMWI----------R------M------------R-D---------Q---V-M---------S---------------MAHN-L--PIECNL--------M-SQ------PCQM--------
17 HHSearch 48.3819% -71 - C4 -1PSY - 2SS_RICCO A:[16-116] ------------------------QQCRQ------EV--QRKD----LSS-------------CERYLRQS------------S-----------------SRRSTGEEVLRMPGDENQQQESQ-----------------QLQQCCNQVKQV------------R--------DE------CQC------EAIKY-----IAEDQIQQGQLHGE------E------------S-E---------R---V-A---------Q---------------RAGE-I--VSSCGV------------------------------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(3 SA) .........10........20........30........40........50........60........70........80........90
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) AGACGKSSPDSQALKLIPCATAASDKNAAVSSSCCLQVKKIIQNPSCLCAVVLSNMAKFSGVNPEIAITIPERCNFADRPVGFKCGAYTLP
48 97.17100%-155 - C- -M048 - A:[1-195] AGACGKSSPDSQALKLIPCATAASDKNAAVSSSCCLQVKKIIQNPSCLCAVVLSNMAKFSGVNPEIAITIPERCNFADRPVGFKCGAYTLP
47 94.15100%-143 - C- -M047 - A:[1-195] AGACGKSSPDSQALKLIPCATAASDKNAAVSSSCCLQVKKIIQNPSCLCAVVLSNMAKFSGVNPEIAITIPERCNFADRPVGFKCGAYTLP
42 91.41100%-133 - C- -M042 - A:[1-163] AGACGKSSPDSQALKLIPCATAASDKNAAVSSSCCLQVKKIIQNPSCLCAVVLSNMAKFSGVNPEIAITIPERCNFADRPVGFKCGAYTLP