@TOME V2.3
(Nov 2016)

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Complexes Modeling
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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : 586_tV_MAIZE: (2014-05-11 )
AGECGATPPDTVALRLAPCASAAEDPGSAPSGSCCSAVHAIGKQSPRCLCAVMLSNTARSAGIKAEVAITIPKRCNLADRPVGYKCGDYTLP

Atome Classification :

(20 SA) -.........10..---..----....20....-------.------------.------.---------------.----30........40..-------.-------.-------.-------..--------.50...---------.-----...-------------.------60----------.--------.-----.----.-.....70------......--------.-.80...--......90.---------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) -AGECGATPPDTVA---LR----LAPCASAAED-------P------------G------S---------------A----PSGSCCSAVHAIGK-------Q-------S-------P-------RC--------LCAVML---------S-----NTA-------------R------S-----------A--------G-----I----K-AEVAITI------PKRCNL--------A-DR-PVG--YKCGDYTLP---------
9 SP3 84.2828%-104 - C3 -1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] ------AISCGQVA---SA----IAPCISYARG-------Q------------G------S---------------G----PSAGCCSGVRSLNN-------A-------A-------RTTADR--RA--------ACNCLK---------N-----AAA-------------G------V-----------S--------G-----L----N-AGNAASI------PSKCGV--------SIPY-TISTSTDCSRVN-----------
4 Fugue 66.4624%-114 - C3 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[5-124] ---MCYPGQAFQVP---A-----LPACRPLLRLQCNGSQVP-------------------E---------------A----VLRDCCQQLAHI-----------------S-------E-------WC--------RCGALY---------S-----MLDSMYKEHGAFPRCRR------E-----------V--------V-----K----L-TAASITA--------VCRLPIVVDASGD-GA-YVC--KDVAAYPDA---------
1 Fugue 66.3233%-102 - C3 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] AIDLCGMS-----Q---DE----LNECKPAVSK-------E------------NP-----T---------------S----PSQPCCTALQHA-----------------D-------F-------AC--------LCGYKN---------S-----PWL-------------G------S-----------F--------G-----V----D-PELASAL------PKQCGL--------A-NA-P-----TC---------------
19 HHSearch 66.0634% -93 - C3 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[3-80] --------SCGQVA---SA----IAPCISYARG-------Q------------G------S---------------G----PSAGCCSGVRSLNN-------A-------ARTTADRRA-------AC--------NC--LK---------N-----A-A-------------A------G-----------VS-------G-----L----N-AGNAASI------PSKCGV--------S-IP------------------------
20 HHSearch 62.4824%-103 - C3 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[2-82] --------DCGHVD---SL----VRPCLSYVQG-------G-------------------P---------------G----PSGQCCDGVKNLHNQAR----SQSDR---Q-------S-------AC--------NCLKGI---------A---------------------R------G-----------IH-------N-----L----N-EDNARSI------PPKCGV--------N-LPYTIS--------------------
24 HHSearch 61.1230%-102 - C3 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[2-78] -------ITCGQVT---SN----LAPCLAYLRN-------T------------G---------------------------PLGRCCGGVKALVN-------S-------A-------RTTEDRQIAC--------TC--LK---------S-----A-A-------------G------A-----------IS-------G-----I----N-LGKAAGL------PSTCGV--------N-IP------------------------
37 HHSearch 59.9321%-121 - C3 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[16-109] ------------------P----LPSCRWYVTS-------R------------TCGIG--PR--------------LPWPELKRRCCRELADI-----------------P-------A-------YC--------RCTALS---------ILMD--GAI-------------PPGPDAQLEGR--------LEDLPGCPRE-----V----Q-RGFAATLVT----EAECNL--------A-TI------------------------
38 HHSearch 59.4220%-122 - C3 -1B1U - IAAT_ELECO A:[16-110] ------------------P----LDSCRWYVST-------R------------TCGVGPRLATQ------------E----MKARCCRQLEAI-----------------P-------A-------YC--------RCEAVR---------ILMD--GVV-------------T------PSGQHEGRLLQDLP-------GCPRQ-VQ---RAFAPKLVT------EVECNL--------A-TI-HG---------------------
25 HHSearch 59.1833%-101 - C3 -1N89 NLT2G_WHEAT A:[5-65] -----------------SQ----LAVCASAILS-------G-------------------A---------------K----PSGECCGNLRAQ-----------------Q---------------GC--------FCQYAK---------D-----PTY-------------G------Q--------------------Y-----I----R-SPHARDT------LTSCGL--------A-VP------------------------
23 HHSearch 58.4724%-101 - C3 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[2-82] --------TCGQVQ---GN----LAQCIGFLQK-------G-------------------G---------------V----VPPSCCTGVKNILN-------SSRTTADRR-------A-------VC--------SCL--K---------A------AA-------------G------A-----------VR-------G-----I----N-PNNAEAL------PGKCGV--------N-IPYKIS--------------------
18 HHSearch 57.7630% -91 - C3 -2RKN DIRL1_ARATH A:[2-75] ------IDLCGMSQ---DE----LNECKPAVSK-------E------------NP-----T---------------S----PSQPCCTALQHA-----------------D-------F-------AC--------LCGYKN---------S-----PWL-------------G------S-----------F--------G-----V----D-PELASAL------PKQCGL--------A-NA-P----------------------
35 HHSearch 57.4218%-138 - C3 -1SM7 - ? A:[14-104] ------------------H----LRACQQWIRQ-------Q------------L------AGSPFSENQWGPQQGPS----LREQCCNELYQE-----------------D-------Q-------VC--------VCPTLK---------Q-----AAKSVRV---------QG-----Q-----------H--------GPFQSTR----I-YQIAKNL------PNVCNM--------K-Q---IG--TC----------------
22 HHSearch 57.0421%-102 - C3 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[2-79] -------ITCGQVS---SS----LAPCIPYVRG-------G-------------------G---------------A----VPPACCNGIRNVNNLARTTPDR-------Q-------A-------AC--------NC--LK---------Q------LS-------------A------S-----------VP-------G-----V----N-PNNAAAL------PGKCGV--------S-IP------------------------
7 Fugue 56.5513% -95 - C2 -2GOW - UBL3_HUMAN A:[2-117] ----SSNVPADMIN---LR----LILVSGKTKE-------F------------L------F---------------S----PNDSASDIAKHVYD-------N-------W-------P-------MDWEEEQVSSPNILRLIYQGRFLHGN-----VTL-------------G------A-----------L--------K-----LPFGKT-TVMHLVARETLPEPNSQGQ--------R-NR-EKT--GESNCCVIL---------
34 HHSearch 56.1722%-114 * C3 *1HSS - IAA1_WHEAT A:[16-105] ------------------A----LPACRPLLRL-------Q------------CNGSQ--VPE-------------A----VLRDCCQQLAHI-----------------S-------E-------WC--------RCGALY---------S-----MLDSMY----------K------E-----------HGAFPRCRRE-----V----V-KLTAASI------TAVCRL--------P-IV-V----------------------
36 HHSearch 52.0121%-110 - C3 -2LVF - ? A:[8-101] ---------CREQMQRQQM----LSHCRMYMRQQMEE---S------------T------YQTMPRRGME------P----HMSECCEQLEGM-----------------D-------E-------SC--------RCEGLR---------M-----MMR-------------MMQQKEMQ-----------PR-------GEQMR-R----M-MRLAENI------PSRCNL--------S---------------------------
5 Fugue 51.2717% -97 - C3 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] PYGRGRTESGCYQQ---MEEAEMLNHCGMYLMK-------NLGERSQVSPRMRE------E---------------D----HKQLCCMQLKNL-----------------D-------E-------KC--------MCPAIM---------MMLNEPMWI-------------R------M-----------R--------D-----Q----V-MSMAHNL------PIECNL--------M-SQ-------PCQM-------------
29 HHSearch 51.2416%-130 - C3 -1HYP - HPSE_SOYBN A:[10-79] ------------------D----LSICLNILGG-------S------------L------G---------------T-----VDDCCALIGGLGDI------E-------A-------I-------VC--------LCIQLR---------A---------------------L------G-----------I--------------L----N-LNRNLQLI-----LNSCGR----------SY-PSN--ATCPR-------------
6 Fugue 50.0516% -59 - C3 -1MOL - MONB_DIOCU A:[1-94] --GEWEIIDIGPFT---QN----LGKFAVDEEN-------K------------I------G---------------Q----YGRL------TFNK-------V-------I-------R-------PC--------MKKTIY---------E-----NER-------------E------I-----------K--------G-----Y----E-YQLYVYA------SDKLFR--------A-DI-SED--YKTRGRKLLRFNGPVPPP
30 HHSearch 49.5321%-163 - C3 -2DS2 - ? B:[7-64] ----------------------------------------------------------------------------------LRQCCNQLRQV-----------------D-------R-------PC--------VCPVLR---------Q-----AAQQVLQRQ-------I------I-----------Q--------GPQQLRR----L-FDAARNL------PNICNI--------P-NI------------------------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(4 SA) .........10........20........30........40........50........60........70........80........90.
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) AGECGATPPDTVALRLAPCASAAEDPGSAPSGSCCSAVHAIGKQSPRCLCAVMLSNTARSAGIKAEVAITIPKRCNLADRPVGYKCGDYTLP
43 88.55100%-122 - C- -M043 - A:[1-139] AGECGATPPDTVALRLAPCASAAEDPGSAPSGSCCSAVHAIGKQSPRCLCAVMLSNTARSAGIKAEVAITIPKRCNLADRPVGYKCGDYTLP
39 81.83100%-110 - C- -M039 - A:[1-139] AGECGATPPDTVALRLAPCASAAEDPGSAPSGSCCSAVHAIGKQSPRCLCAVMLSNTARSAGIKAEVAITIPKRCNLADRPVGYKCGDYTLP
45 80.92100%-114 - C- -M045 - A:[1-139] AGECGATPPDTVALRLAPCASAAEDPGSAPSGSCCSAVHAIGKQSPRCLCAVMLSNTARSAGIKAEVAITIPKRCNLADRPVGYKCGDYTLP
44 80.35100% -99 - C- -M044 - A:[1-139] AGECGATPPDTVALRLAPCASAAEDPGSAPSGSCCSAVHAIGKQSPRCLCAVMLSNTARSAGIKAEVAITIPKRCNLADRPVGYKCGDYTLP