@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : PA1206: (2016-01-27 )
MQFEHLVQVNDRTLVDLPVLDRLQLWEGLVCRAREPQYFVVGLERFEILVDDGDRLHRRLYLPGLVVEDEVVLKAPDSAHYSIKPSAEVAGGSLDMTIEEPEPGSLFVRFAYCTRYLQPLGDELPYDAFVKQAYIAMDVETIATIRDRFGASAASGS

Atome Classification :

(20 SA) .........10.....----...20........30..--..-.....40-.-.......50-.--.----...--...--60.--.-.---.---..--..70..-.-.-.--.-.-.-.80-...--....----.----90-.--.--.......100--.---.---.--....110..-----.--....-120--..--.......130.......140.......150.....
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) MQFEHLVQVNDRTLVD----LPVLDRLQLWEGLV-CR--AR-EPQYFVV-G-LERFEILVD-D--G----DRL--HRR--LYL--P-G---L---VV--EDE-VV-L-K-A--P-D-S-AHY-SIK--PSAE----V----A--G--G--SLDMTIEEPE--P---G---S--LFVRFAYCT-----R--YLQP-L----GD--ELPYDAFVKQAYIAMDVETIATIRDRFGASAASGS
3 HHSearch 93.92100% -79 - C5 -2FFS - ? A:[2-151] -QFEHLVQVNDRT-------LPVLDRLQLWEGLV-CR--AR-EPQYFVV-G-LERFEILVD-D--G----DRL--HRR--LYL--P-G---L---VV--EDE-VV-L-K-A--P-D-S-AHY-SIK--PSAE----V----A--G--G--SLDMTIEEPE--P---G---S--LFVRFAYCT-----R--YLQP-------D--ELPYDAFVKQAYIAMDVETIATIRDRFGA------
23 Fugue 93.7797% -81 - C5 -2FFS - ? A:[2-151] -QFEHLVQVNDRTL-------PVLDRLQLWEGLV-CR--AR-EPQYFVV-G-LERFEILVD-D--G----DRL--HRR--LYL--P-G---L---VV--EDE-VV-L-K-A--P-D-S-AHY-SIK--PSAE----V----A--G--G--SLDMTIEEPE--P---G---S--LFVRFAYCT-----R--Y--L-Q----PD--ELPYDAFVKQAYIAMDVETIATIRDRFGA------
1 PsiBlast_PDB 93.5098% -79 - C5 -2FFS - ? A:[2-151] -QFEHLVQVNDRT-------LPVLDRLQLWEGLV-CR--AR-EPQYFVV-G-LERFEILVD-D--G----DRL--HRR--LYL--P-G---L---VV--EDE-VV-L-K-A--P-D-S-AHY-SIK--PSAE----V----A--G--G--SLDMTIEEPE--P---G---S--LFVRFAYCT-----R--YLQP-------D--ELPYDAFVKQAYIAMDVETIATIRDRFGA------
21 HHSearch 62.8415% -86 - C5 -3TL1 CYPC_STRCO A:[5-147] --TDNEITIAAPM-------------ELVWNMTN-DI--EK-WP-GLFS-E-YASVEVLGR-D--D----DKV--TFRLTMHPDAD-GKV-W---SW--VSE-RV-A-DPV--T-R-T-VRAQRVE---TGP----F----Q--Y--M--NIVWEYAETA--E---G------TVMRWTQDF-----A--MKPD----------APVDDAWMTDNINRNSRTQMALIRDRIEQAAGERR
6 HHSearch 61.8513% -82 - C5 -3TFZ ? A:[6-161] -HVEHTVTVAAPA-------------DLVWEVLA-DV--LG-YA-DIFP-P-TEKVEILEE-G--Q----GYQ--VVRLHVDV--A-GEI-N---TW--TSR-RD-L-D-P--A-RRV-IAY-RQL--ETAP----IV---G--H--M--SGEWRAFTLD--A---E---R--TQLVLTHDF-----VTRAAGD-DGLVAGKLTPDEAREMLEAVVERNSVADLNAVLGEAERRVRAAG
15 HHSearch 60.317% -85 - C5 -2LE1 - ? A:[3-144] -TLRRSVEVAAPA-------------ADVWTLVG-DF--SA-I-HRWHP-Q-VSAPTLRGA-S--PHT--PGA--ERV--FGAG-T-E---E---EL--VER-LV-E-R-D--ESARR-LVY-TMP--DPPFP---I----T--N--H--RAVLEVVPRD--D---R---H--CTVVWTAMF-----D--CSPE-T----A-------RELESVIGDGVFAVGLNALAERYGRLEHHHH
10 HHSearch 59.7714% -82 - C5 -3TVQ TCMN_STRGA A:[5-149] --TDNSIVVNAPF-------------ELVWDVTN-DI--EA-WP-ELFS-E-YAEAEILRQ-D--G----DGFDFRLK--TRPDAN-GRV-W---EW--VSH-RV-P-D-K--GSR-T-VRA-HRV--ETGP----F----A--Y--M--NLHWTYRAVA--G---G------TEMRWVQEF-----D--MKPG-A----P-----FDNAHMTAHLNTTTRANMERIKKIIEDRHREGQ
7 HHSearch 58.6316% -85 - C5 -2QIM ? A:[5-153] -TFQDEYTSTIAP-------------AKLYKALVTDA--DIIIPKAV-E-T-IQSVEIVEG-NG-G----PGT--IKK--LTFIEG-GES-K---YV--LHK-IEAI-D-E--A-NLG-YNY-SIV--GGVG----L----PDTI--EKISFETKLVEGA--N---G---G--SIGKVTIKI-----E--TKGDAQ----PN---EEEGK----AAKARGDAFFKAIESYLSAHPDYN-
8 HHSearch 57.7511% -81 - C5 -3IE5 ? A:[11-161] -TIVKEEESPIAP-------------HRLFKALVLER--HQ-VLVKAQP-HVFKSGEIIEG-DG-G----VGT--VTK--ITFV-D-G---HPLTYM--LHK-FDEI-D-A--A-N-FYCKY-TLF--EGDV----L----R--DNIEKVVYEVKLEAVG------G---G--SKGKITVTY-----H--PKPG-C----------TVNEEEVKIGEKKAYEFYKQVEEYLAANPEVFA
17 HHSearch 56.479% -75 - C5 -2FLH ? A:[5-151] --FNTQTELSVRL-------------EALWAVLSKDF--IT-VVPKVLP-HIVKDVQLIEG-D--GG---VGT--ILI--FNFLPE-VSP-S---YQ--REE-IT-E-FDE--SSH-E-IGL-QVI--EGGY----LSQGLS--Y--Y--KTTFKLSEIE--E---D---K--TLVNVKISY-----D--H-------------------VTPTKTSQSTLMYLRRLERYLS-------
22 HHSearch 56.2910% -72 - C5 -3KL1 - PYL2_ARATH A:[47-185] -------------------------ASVVWPLIR-RF---D-NPERYKH-F-VKRCRLISG-DG-D----VGS--VRE--VTVI-S-GLPAS---TS--TER-LE-FVD-DD-H-R-V-LSF-RVV--GGEH----RL---K--N--Y--KSVTSVNEFLNDS---G---KVYTVVLESYTV-----D--IPEG------NT--EE----DTKMFVDTVVKLNLQKLGVAATSAPM---
28 Fugue 56.0121% -83 - C4 -4CRI RB_HUMAN (first) A:[27-145] ------SFVGLRVVAK----WS--SNGYFYSGKI-TR--DV---------G-AGKYKLLFD-D--GYEC-DVL--GKD--ILL--C-D---P---IP--LDT-EV-T-A-L--S-E-D-EYF-SAGVVKGHR----K----E--S--G--ELYYSIEKEG--Q---R---K--WYKRMA-------------------------------------VILSLEQGNRLREQYGLGP----
5 HHSearch 54.4511% -73 - C5 -2VQ5 NCS_THLFG A:[40-182] ------------------------SADDIWTVYS-WPGLAK-HLPDLLP-GAFEKLEIIGD-G--G----VGT--ILD--MTFV-P-GEFPH---EY--KEK-FI-LVD-N--E-HRL-KKV-QMI--EGGYLDLGV----T--Y--Y--MDTIHVVPTG--K---D---S--CVIKSSTEY-----H--VKPE-------F--VKI---VEPLITTGPLAAMADAISKLVLEHKSK--
13 HHSearch 53.8310% -76 - C5 -3K3K - PYR1_ARATH A:[61-198] ------------------------PPELVWSIVR-RF---D-KPQTYKH-F-IKSCSVEQN-FEMR----VGC--TRD--VIVI-S-GLPAN---TS--TER-LD-I-LDDE-R-R-V-TGF-SII--GGEH----RL---T--N--Y--KSVTTVHRFE--KE--N---RIWTVVLESYVV-----D--MPEGNS----E----D----DTRMFADTVVKLNLQKLATVAEAMARNSG
9 HHSearch 51.0410% -76 - C5 -3JRS PYL1_ARATH A:[65-204] ------------------------PPETVWSVVR-RF---D-RPQIYKH-F-IKSCNVSED-FEMR----VGC--TRD--VNVI-S-GLPAN---TS--RER-LD-L-L-DDDR-R-V-TGF-SIT--GGEH----RL---R--N--Y--KSVTTVHRFE--K------------RIWTVVLESYVVD--VPEGNS----E--------EDTRLFADTVIRLNLQKLASITEAMN----
14 HHSearch 50.4610% -81 - C5 -3OJI PYL3_ARATH A:[42-186] -------------------------AHAIWRFVR-DF--AN-P-NKYKH-F-IKSCTIRVN-----KEIKVGT--IRE--VSVV-S-GLPAS---TS--VEI-LEVL-D-EE-K-R-I-LSF-RVL--GGEH----RL---N--N--Y--RSVTSVNEFV--VLEKDKKKRVYSVVLESYIV-----D--IPQG-N----T-------EEDTRMFVDTVVKSNLQNLAVISTA------
32 Fugue 49.9814% -57 - C3 -1NIG - ? A:[1-148] MDIKRYCPVTDSELPADHVYFKFRSEIEAAEAYL-GL--AI-SEG---I-K-VRETREILD-I--I----DTV--YNS--LSD--S-K---L---ND--FQE-KR-L-N-F--T-E-E-DWY-DIK--EKAN----N----G------------NRWSLY--M---F---L--ARSAVDSAV-----Y--WSYR-M----KE--TEEFKEIVKEEMISKLLKAGYVILRESLG------
4 HHSearch 49.366% -72 - C5 -2I9Y - MLP28_ARATH A:[25-162] -KLETDVEIKASA-------------DKFHHMFA-GK--PH-HVSKASPGN-IQGCDLHEG-D--WGT--VGS--IVF--WNYV-HDGEA-K---VA--KER-IE-AVE-P--D-KNL-ITF-RVI--EGDLMKE-Y----K--S--F--LLTIQVTPKP--GG--P---G--SIVHWHLEY-----E--KISEEV----AH--PETLLQFCVEVSKEIDEHLLAEE------------
20 HHSearch 47.028% -49 * C5 *2PCS ? A:[4-117] -NGNGSIELKGTV-------------EEVWSKLM-DP--SI-LSKC-IM-G-CKSLELIGE-D--K----YKA--DLQ--IGI--A-AVK-G---KYDAIIEVTD-I-K-P--P-Y-H-YKL-LVN--GEGGPG--F----V--N--A--EGVIDLTPIN--D---E---C--TQLTYTYSA-----E--VGGK-V----AA--IGQRMLGGVAKLLISDFFKKIQKEIAKSHHHHH--
16 HHSearch 46.2713% -72 - C5 -1TW0 - ? A:[3-123] FVFRDETSSSVAP-------------AKLYKALTKDS--DT-IAQKI-DGP-IQSIELVEGNG--G----VGT--IKK--ITAN-E-GDKTS---FV--LQK-VDAI-D-E--A-NLG-YDY-SIV--GGTGLPESL----E--K--L--SFETKVVAGS--G---G---G--SISKVTLKF-----H--TKGD-A----PL--SDAVRDDALAKGAGFFKAIEGYVLANPAEY-----