@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : 584_tV_MAIZE: (2014-05-11 )
AGECGATPPDRMALKLAPCASAAQNPSSAPSNGCCTAVHTIGKQSPQCLCAVMLSKTAKKSGIKPEVAITIPKRCNLVDRPVGYKCGDYTLP

Atome Classification :

(20 SA) ------....--.....10-----...--.--.-----....20....----.-.------.---------------------.-----------------30------------..---------------------......40..-------.-------.-------.-------...50....-----.---.----------.------------.------60-----------.--------.-----.---.-....-.70--......--------.-.80..--......90.-----
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) ------AGEC--GATPPD------RMA--L--K-----LAPCASAAQN----P-S------S---------------------A-----------------PS------------NG---------------------CCTAVHTIGK-------Q-------S-------P-------QCLCAVMLS-----K---T----------A------------K------K------------S--------G-----I---K-PEVA-ITI--PKRCNL--------V-DRPVG--YKCGDYTLP-----
9 SP3 85.5225% -92 - C2 -1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] -------------AISCG------QVA--S--A-----IAPCISYARG----Q-G------S---------------------G-----------------PS------------AG---------------------CCSGVRSLNN-------A-------A-------RTTADR--RAACNCLKN-----A---A----------A------------G------V------------S--------G-----L---N-AGNA-ASI--PSKCGV--------SIPYTISTSTDCSRVN-------
1 Fugue 71.2033% -82 - C2 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] -----AIDLC--GMS-----------Q--D--E-----LNECKPAVSK----ENP------T---------------------S-----------------PS------------QP---------------------CCTALQHA-----------------D-------F-------ACLCGYKNS-----P---W----------L------------G------S------------F--------G-----V---D-PELA-SAL--PKQCGL--------A-NAP-----TC-----------
4 Fugue 70.1229% -99 - C2 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[5-124] --------MCYPGQAFQVPALPACRPL--L--R-----LQCNGS--QV----P--------E---------------------A-----------------VL------------RD---------------------CCQQLAHI-----------------S-------E-------WCRCGALYS-----M---L----------DSMYKEHGAFPRCR------R------------E--------V-----V---K-LTAASITA----VCRLPIVVDASGD-GAYVC--KDVAAYPDA-----
20 HHSearch 65.8522% -83 - C2 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[2-78] ---------------DCG------HVD--S--L-----VRPCLSYVQG----G--------P---------------------G-----------------PS------------GQ---------------------CCDGVKNLHNQAR----SQSDR---Q-------S-------ACNCLKGIA-----R----------------------------------G------------IH-------N-----L---N-EDNA-RSI--PPKCGV--------N-LP-------------------
7 Fugue 65.5819% -66 - C2 -1PSY - 2SS_RICCO A:[1-125] AEFMESKGER--EGSSSQ------QCR--Q--EVQRKDLSSCERYLRQ----S-S------S---------------------R-----------------RS------------TGEEVLRMPGDENQQQESQQLQQCCNQVKQV-----------------R-------D-------ECQCE-AIK-----Y---I----------A------------E------D------------Q--------I-----Q---Q-GQLH-GEE--SERVAQ--------R-AGEIV--SSCGVRCMRQTRTN
24 HHSearch 64.5826% -83 - C2 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[2-78] --------------ITCG------QVT--S--N-----LAPCLAYLRN----T-G----------------------------------------------PL------------GR---------------------CCGGVKALVN-------S-------A-------RTTEDRQIACTC--LKS-----A--------------A------------G------A------------IS-------G-----I---N-LGKA-AGL--PSTCGV--------N-IP-------------------
35 HHSearch 64.0318%-133 - C2 -1SM7 - ? A:[14-100] --------------------------------H-----LRACQQWIRQ----Q-L------AGSPFSENQWGPQQGP------S-----------------LR------------EQ---------------------CCNELYQE-----------------D-------Q-------VCVCPTLKQ-----A---A----------KSVRV--------QG-----Q------------H--------GPFQSTR---I-YQIA-KNL--PNVCNM--------K-Q--------------------
34 HHSearch 62.6022% -93 * C2 *1HSS - IAA1_WHEAT A:[16-106] --------------------------------A-----LPACRPLLRL----Q-CNGSQ--VPE-------------------A-----------------VL------------RD---------------------CCQQLAHI-----------------S-------E-------WCRCGALYS-----M---L----------D------------SMYK---E------------HGAFPRCRRE-----V---V-KLTA-ASI--TAVCRL--------P-IVVD-----------------
23 HHSearch 61.6320% -73 - C2 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[2-79] --------------ITCG------QVS--S--S-----LAPCIPYVRG----G--------G---------------------A-----------------VP------------PA---------------------CCNGIRNVNNLARTTPDR-------Q-------A-------ACNC--LKQ-----L--------------S------------A------S------------VP-------G-----V---N-PNNA-AAL--PGKCGV--------S-IP-------------------
37 HHSearch 61.1917%-105 - C2 -1B1U - IAAT_ELECO A:[16-110] --------------------------------P-----LDSCRWYVST----R-TCGVGPRLATQ------------------E-----------------MK------------AR---------------------CCRQLEAI-----------------P-------A-------YCRCEAVRI-----LMDGV----------V------------T------PSGQHEGRLLQDLP--------GCPRQ-VQ--RAFAPK-LVT--EVECNL--------A-TIHG-----------------
21 HHSearch 60.9926% -75 - C2 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[2-78] ---------------TCG------QVQ--G--N-----LAQCIGFLQK----G--------G---------------------V-----------------VP------------PS---------------------CCTGVKNILN-------SSRTTADRR-------A-------VCSCL--KA---------A----------A------------G------A------------VR-------G-----I---N-PNNA-EAL--PGKCGV--------N-IP-------------------
5 Fugue 60.6417% -97 - C2 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] -----PYGRG--RTESGC------YQQ--M--EEAEM-LNHCGMYLMK----N-L------G---------------------E-----------------RSQVSPRMREEDHKQL---------------------CCMQLKNL-----------------D-------E-------KCMCPAIMMMLNEPM---W----------I------------R------M------------R--------D-----Q---V-MSMA-HNL--PIECNL--------M-SQ------PCQM---------
19 HHSearch 59.2030% -66 - C2 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[2-80] --------------ISCG------QVA--S--A-----IAPCISYARG----Q-G------S---------------------G-----------------PS------------AG---------------------CCSGVRSLNN-------A-------ARTTADRRA-------ACNC--LKN-----A--------------A------------A------G------------VS-------G-----L---N-AGNA-ASI--PSKCGV--------S-IP-------------------
25 HHSearch 58.4028% -92 - C2 -1N89 NLT2G_WHEAT A:[5-65] -----------------------------S--Q-----LAVCASAILS----G--------A---------------------K-----------------PS------------GE---------------------CCGNLRAQ-----------------Q---------------GCFCQYAKD-----P---T----------Y------------G------Q---------------------Y-----I---R-SPHA-RDT--LTSCGL--------A-VP-------------------
18 HHSearch 58.1830% -73 - C2 -2RKN DIRL1_ARATH A:[2-75] -------------IDLCG------MSQ--D--E-----LNECKPAVSK----E-NP-----T---------------------S-----------------PS------------QP---------------------CCTALQHA-----------------D-------F-------ACLCGYKNS-----P---W----------L------------G------S------------F--------G-----V---D-PELA-SAL--PKQCGL--------A-NAP------------------
36 HHSearch 56.8819% -86 - C2 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[16-109] --------------------------------P-----LPSCRWYVTS----R-TCGIG--PR--------------------LPWPE-------------LK------------RR---------------------CCRELADI-----------------P-------A-------YCRCTALSI-----LMDGA----------I------------PPGPDAQLEGR---------LEDLPGCPRE-----V---Q-RGFA-ATLVTEAECNL--------A-TI-------------------
32 HHSearch 55.7319% -72 - C2 -1PSY - 2SS_RICCO A:[16-116] --------------QQCR------QEV--QRKD-----LSSCERYLRQ----S-S------SRRSTGEEVLRMPGDENQQQESQ-----------------QL------------QQ---------------------CCNQVKQV-----------------R-------D-------ECQCEAIKY-----I---AEDQIQQGQLHG------------E------E------------S--------E-----R---V-AQRA-GEI--VSSCGV-------------------------------
29 HHSearch 55.0516%-107 - C2 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[16-112] ----------------CE------RQVDRV--N-----LKPCEQHIMQ----R-I------M---------------------GEQEQYDSYDIRSTRSSDQQ------------QR---------------------CCDELNEME--------N-------T-------Q-------GCMCEALQQ-----I---M----------ENQC---------D------RL-----------Q--------DRQ---MVQQF-KREL-MSL--PQQCNF--------R----------------------
38 HHSearch 54.3823% -88 - C2 -2LVF - ? A:[16-101] -----------------------------Q--M-----LSHCRMYMRQQMEES-T------YQTMPRRGME------------P-----------------HM------------SE---------------------CCEQLEGM-----------------D-------E-------SCRCEGLRM-----M---M----------R------------MMQQKEMQ------------PR-------GEQMR-R---M-MRLA-ENI--PSRCNL--------S----------------------
30 HHSearch 52.5522%-148 - C2 -2DS2 - ? B:[7-63] ------------------------------------------------------------------------------------------------------L------------RQ---------------------CCNQLRQV-----------------D-------R-------PCVCPVLRQ-----A---A----------Q------------QVLQRQII------------Q--------GPQQLRR---L-FDAA-RNL--PNICNI--------P-N--------------------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(4 SA) .........10........20........30........40........50........60........70........80........90.
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) AGECGATPPDRMALKLAPCASAAQNPSSAPSNGCCTAVHTIGKQSPQCLCAVMLSKTAKKSGIKPEVAITIPKRCNLVDRPVGYKCGDYTLP
39 90.96100% -97 - C- -M039 - A:[1-162] AGECGATPPDRMALKLAPCASAAQNPSSAPSNGCCTAVHTIGKQSPQCLCAVMLSKTAKKSGIKPEVAITIPKRCNLVDRPVGYKCGDYTLP
40 89.72100% -94 - C- -M040 - A:[1-162] AGECGATPPDRMALKLAPCASAAQNPSSAPSNGCCTAVHTIGKQSPQCLCAVMLSKTAKKSGIKPEVAITIPKRCNLVDRPVGYKCGDYTLP
43 83.23100% -81 - C- -M043 - A:[1-156] AGECGATPPDRMALKLAPCASAAQNPSSAPSNGCCTAVHTIGKQSPQCLCAVMLSKTAKKSGIKPEVAITIPKRCNLVDRPVGYKCGDYTLP
44 81.56100% -98 - C- -M044 - A:[1-156] AGECGATPPDRMALKLAPCASAAQNPSSAPSNGCCTAVHTIGKQSPQCLCAVMLSKTAKKSGIKPEVAITIPKRCNLVDRPVGYKCGDYTLP