@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : 784_tI_MEDTR: (2014-05-15 )
VITCPDTDITLTACLSYVAYPNPPPPQPCCDAVLDVTAQARTREDRQAVCSCLKGLMIGIPGLDLTALAALPKVCGANIGYEISPGMDCSKIN

Atome Classification :

(20 SA) -------.........10--.........----20------------.--.------------.--------.-----------.-...30........40........----------50..--...-...60--------------.-------.----.----.----------.-----....70--........--80-.........90..------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) -------VITCPDTDIT---LTACLSYVA----YP------------N--P------------P--------P-----------P-QPCCDAVLDVTAQARTREDRQAV----------CSCL--KGL-MIGI---------------P-------G----L----D----------L-----TALAAL--PKVCGANI--G--YEISPGMDCSKIN------------
18 HHSearch 88.8639%-142 - C2 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[1-92] -------MITCGQVSSS---LAPCIPYVR----GG---------------G------------A--------V-----------P-PACCNGIRNVNNLARTTPDRQAA----------CNCL--KQL-SASV---------------P-------G----V----N----------P-----NNAAAL--PGKCGVSI--P--YKISASTNCATVK------------
20 HHSearch 88.7336%-147 - C2 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[1-91] --------MTCGQVQGN---LAQCIGFLQ----KG---------------G------------V--------V-----------P-PSCCTGVKNILNSSRTTADRRAV----------CSCL--KAA-AGAV---------------R-------G----I----N----------P-----NNAEAL--PGKCGVNI--P--YKISTSTNCNSIN------------
16 HHSearch 86.6744%-154 - C2 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[1-91] -------AITCGQVTSN---LAPCLAYLR----NT------------G------------------------P-----------L-GRCCGGVKALVNSARTTEDRQIA----------CTCL--KSA-AGAI---------------S-------G----I----N----------L-----GKAAGL--PSTCGVNI--P--YKISPSTDCSKVQ------------
11 SP3 86.0836%-146 - C2 -1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] -------AISCGQVASA---IAPCISYAR----GQ------------G--S------------G--------P-----------S-AGCCSGVRSLNNAARTTADRRAA----------CNCL--KNA-AAGV---------------S-------G----L----N----------A-----GNAASI--PSKCGVSI--P--YTISTSTDCSRVN------------
19 HHSearch 85.7942%-149 - C2 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[1-90] --------IDCGHVDSL---VRPCLSYVQ----GG---------------P------------G--------P-----------S-GQCCDGVKNLHNQARSQSDRQSA----------CNCL--KGI-ARGI---------------H-------N----L----N----------E-----DNARSI--PPKCGVNL--P--YTISLNIDCSRV-------------
15 HHSearch 83.9637%-148 - C2 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[1-93] -------AISCGQVASA---IAPCISYAR----GQ------------G--S------------G--------P-----------S-AGCCSGVRSLNNAARTTADRRAA----------CNCL--KNA-AAGV---------------S-------G----L----N----------A-----GNAASI--PSKCGVSI--P--YTISTSTDCSRVN------------
1 Fugue 82.4041%-153 - C2 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[1-90] --------IDCGHVDSL---VRPCLSYVQ----GG------------P---------------G--------P-----------S-GQCCDGVKNLHNQARSQSDRQSA----------CNCL--KGI-ARGI---------------H-------N----L----N-----------E----DNARSI--PPKCG--VNLP--YTISLNIDCSRV-------------
30 HHSearch 66.3027%-219 - C2 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[15-109] ---------------NP---LPSCRWYVTSRTCGI------------G--P------------R--------LPWPEL------K-RRCCRELADI--------PAYCR----------CTAL--SIL-MDGA---------------IPPGPDAQLEGR-L----EDLPGCPREVQR-----GFAATLVTEAECNLAT--I---------------------------
2 Fugue 63.2332%-142 - C2 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] ------AIDLCGMSQDE---LNECKPAVS----KE------------N--P------------T--------S-----------PSQPCCTALQHA--------DFACL----------CGYK--NSP-WLGS---------------F-------G----V----D----------P-----ELASAL--PKQCG----------LANAPTC----------------
28 HHSearch 59.9325%-165 - C2 -1SM7 - ? A:[13-100] ---------------QH---LRACQQWIR----QQLAG---------S--PFSENQWGPQQGPS--------L-----------R-EQCCNELYQE--------DQVCV----------CPTL--KQA-AKSV---------------RVQ-----GQHGPFQSTRI----------Y-----QIAKNL--PNVCNMKQ------------------------------
27 HHSearch 57.0022%-192 * C2 *1B1U - IAAT_ELECO A:[15-109] ---------------NP---LDSCRWYVS----TRTCGV--------G--P------------R--------LATQEM------K-ARCCRQLEAI--------PAYCR----------CEAV--RIL-MDGVVTPSGQHEGRLLQDLP-------GCP--R----QVQRA------F-----APKLVT--EVECNLAT--I--H------------------------
33 HHSearch 55.9518%-178 - C2 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[23-121] ---------------VN---LKPCEQHIM----QRIMG---------EQEQ------------YD-------SYDIRSTRSSDQQ-QRCCDELNEME------NTQGCM----------CEAL--QQI-MENQ---------------CDRLQ---D----R----Q----------MVQQFKRELMSL--PQQCNFRA--PQRCDLDV--------------------
21 HHSearch 55.8231%-129 - C2 -2RKN DIRL1_ARATH A:[3-75] --------DLCGMSQDE---LNECKPAVS----KE------------N--PT-----------S--------P-----------S-QPCCTALQHA--------DFACL----------CGYK--NSPWLGSF-----------------------G----V----D----------P-----ELASAL--PKQCGLAN--A--P------------------------
35 HHSearch 54.8817%-186 - C2 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[15-105] ---------------PA---LPACRPLLR----LQCN----------G--SQ-----------VPEA-----V-----------L-RDCCQQLAHIS--------EWCR----------CGAL--YSM-LDSM---------------YKEHGAFPRCRREV----V----------K-----LTAASI--TAVCRLPI--V--V------------------------
31 HHSearch 51.0122%-142 - C2 -1PSY - 2SS_RICCO A:[25-120] ---------------KD---LSSCERYLR----QSSSR---------R--STGE---------EVLRM----PGDENQQQESQQL-QQCCNQVKQV--------RDECQ----------CEAI--KYI-AEDQIQQGQL---------H-------G----EESERV----------A-----QRAGEI--VSSCGV----R--CMR----------------------
25 HHSearch 45.8616%-153 - C2 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[19-97] ---------------EM---LNHCGMYLM----KNLGER--------S--Q------------VSPRMREEDH-----------K-QLCCMQLKNLD--------EKCM----------CPAI--MMM-LNEP---------------MW------I----RMRDQV----------M-----SMAHNL--PIECNLM-------------------------------
4 Fugue 44.3215%-106 - C2 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] PYGRGRTESGCYQQMEEAEMLNHCGMYLM----KNLGERSQVSPRMRE--E------------D--------H-----------K-QLCCMQLKNLDEKCM------------------CPAI--MMM-LNEP---------------M-------W----I----RMRDQV-----M-----SMAHNL--PIECNLM-----------SQPCQM--------------
29 HHSearch 43.0622%-143 - C2 -3OB4 - ? A:[428-485] ------------------------------------------------------------------------------------Q-ERCCNELNEFE------NNQRCM----------CEAL--QQI-MENQSDRL-----------Q-------G----R----QQEQQF-----K-----RELRNL--PQQCGLRA--P---------------------------
12 SP3 33.0213%-100 - C1 -1EHX - ? A:[1-94] ---------------------------MQ----DP------------T--I------------N--------P-----------T---------SISAKAGSFADTKITLTPNGNTFNGISEL--QSS-QYTK---------------G-------TNEVTL----L----------A-----SYLNTL--PENTTKTL--T--FDFGVGTKNPKLTITVLPKDIPGLE
23 HHSearch 32.5922%-108 - C2 -1N89 NLT2G_WHEAT A:[5-65] ---------------SQ---LAVCASAIL----SG---------------A------------K--------P-----------S-GECCGNLRA-----------QQG----------CFCQYAKDP-TYG----------------Q-------Y----I----R----------S-----PHARDT--LTSCGLAV--P---------------------------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(3 SA) .........10........20........30........40........50........60........70........80........90..
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) VITCPDTDITLTACLSYVAYPNPPPPQPCCDAVLDVTAQARTREDRQAVCSCLKGLMIGIPGLDLTALAALPKVCGANIGYEISPGMDCSKIN
42 92.38100%-170 - C- -M042 - A:[1-93] VITCPDTDITLTACLSYVAYPNPPPPQPCCDAVLDVTAQARTREDRQAVCSCLKGLMIGIPGLDLTALAALPKVCGANIGYEISPGMDCSKIN
36 90.11100%-157 - C- -M036 - A:[1-93] VITCPDTDITLTACLSYVAYPNPPPPQPCCDAVLDVTAQARTREDRQAVCSCLKGLMIGIPGLDLTALAALPKVCGANIGYEISPGMDCSKIN
43 85.77100%-168 - C- -M043 - A:[1-93] VITCPDTDITLTACLSYVAYPNPPPPQPCCDAVLDVTAQARTREDRQAVCSCLKGLMIGIPGLDLTALAALPKVCGANIGYEISPGMDCSKIN