@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : jhp_0104: (2015-12-12 )
MLNMNTHTRGIDSGLIHSLQSISLSMFRKGFFGLYQGSISARIGANQFVINKRNAVFDQLNENTLLVLHDKIDYRWKEASLDSPIHASVYREFLDAKFIAYARPPYSLAYSLRHNRLLPRDYLGYRSLGEEIAIFNPKDYDSWQERADTEILRQLQESKKYFVFIKGCGIFAYHRELSKLMEVFDLIENSCKVLRLGDLMDYCYNDDPRLSV

Atome Classification :

(20 SA) -----.......-..10........20-------......-.-.30........40..-..----.----.----------------------------..50........60---......--..---.70----.-.----------------------.--.----.-----...80..-.......90......-----..100.......110...-....120--.-.......--------130...-..-----.---------.----140-..----....---------..150.---....--.-----.---160-------.----....--.---...170...------....---180-.....---...190.......-200.......210---------------------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) -----MLNMNTH-TRGIDSGLIHSLQS-------ISLSMF-R-KGFFGLYQGSISARI-GA----N----Q----------------------------FVINKRNAVFDQL----NENTLL--VL---HDK----I-D----------------------Y--R----W-----KEAS-LD-SPIHASVYREFLDAK-----FIAYARPPYSLAYSLRHN-RLLPR-D--Y-LGYRSLG--------EEIAIF-NP-----K---------D----YD--SW----QERA---------DTEILR---QLQE--S-----K---K---------Y----FVFI--K---GCGIFAYHR------ELSK---LM--EVFDL---IENSCKVLRLGDL-MDYCYNDDPRLSV---------------------------
15 HHSearch 96.2523%-120 - C1 -2FK5 ? A:[3-196] ------------------ARLYAAFRQ-------VGEDLF-A-QGLISATAGNFSVRT-K-----G----G----------------------------FLITKSGVQKARL----TPEDLL--EV---PLE----G-P----------------------I-------P-----EGAS-VE-SVVHREVYR-RTGAR-----ALVHAHPRVAVALSFHLS-RLRPL-D--L-EGQHYLK---------EVPVLAPK-----T---------V----SA--T------EEA---------ALSVAE---ALRE------------H---------R----ACLL--R---GHGAFAVGLKEAPEEALLE---AY--GLMTT---LEESAQILLYHRL-WQGAGPAL--------------------------------
2 PsiBlast_PDB 90.6025% -96 - C1 -2FLF - ? A:[8-183] -----------------------AFRQ-------VGEDLF-A-QGLISATAGNFSVRT-KG----G---------------------------------FLITKSGVQKARL----TPEDLLEVPL---EGP----I-P------------------------------------EGAS-VE-SVVHREVYRR-TGAR-----ALVHAHPRVAVALSFHLS-RLRPL-D--L-EGQHYL---------KEVPVL-AP-----K-------------------T----EE-A---------ALSVAE---ALRE--H-----R---A---------------CLL--R---GHGAFAVGL------KEAPEEALL--EAYGLMTTLEESAQILLYHRL-WQGAG-----------------------------------
1 PsiBlast_PDB 88.1025% -95 - C1 -2FK5 ? A:[8-183] -----------------------AFRQ-------VGEDLF-A-QGLISATAGNFSVRT-KG----G---------------------------------FLITKSGVQKARL----TPEDLLEVPL---EGP----I-P------------------------------------EGAS-VE-SVVHREVYRR-TGAR-----ALVHAHPRVAVALSFHLS-RLRPL-D--L-EGQHYL---------KEVPVL-AP-----K---------T----VS--AT----EE-A---------ALSVAE---ALRE--H-----R---A---------------CLL--R---GHGAFAVGL------KEAPEEALL--EAYGLMTTLEESAQILLYHRL-WQGAGPAL--------------------------------
19 HHSearch 86.1616% -97 - C1 -2IRP MTNB_AQUAE A:[2-207] ---------NVE-LFKKFSEKVEEIIE-------AGRILH-S-RGWVPATSGNISAKV-SE----E----Y----------------------------IAITASGKHKGKL----TPEDIL--LI---DYE----GRP----------------------V--G----G-----GKPS-AE-TLLHTTVYKLFPEVN-----AVVHTHSPNATVISIVEKKDFVELED--Y-ELLKAFPDIHTHEVKIKIPIF-PN-----E--------------QN--I------PLL---------AKEVEN---YFKT--SE----D---K---------Y----GFLI--R---GHGLYTWGR------SMEE---AL--IHTEA---LEFIFECELKLLS-FH--------------------------------------
16 HHSearch 84.8215%-102 - C1 -2Z7B ? A:[34-240] -------------SFTMRRKVFEELVT-------ATKILL-N-EGIMD-TFGHISARD-PE----DPA--S----------------------------FFLA-QKLAPSLI----TVDDIQ--RF---NLD----GET----------------------S--D----------NRPSYLE-RYIHSEIYKTRPDVQ-----CVLHTHSPAVLPYCFVDT-PLRPV-T--H-M-GAFIG--------ESVPVY-EI-----RDKHGDETDLF----GG--S------PDV---------CADIAE---SLGS------------Q---------T----VVLM--A---RHGVVNVGK------SVRE---VV--FRAFY---LEQEAAALTAGLK-IGNVKYLSPGEIK---------------------------
14 HHSearch 81.0814% -89 * C1 *1E4C FUCA_ECOLI P:[3-191] -----------------RNKLARQIID-------TCLEMT-R-LGLNQGTAGNVSVRY-Q-----D----G----------------------------MLITPTGIPYEKL----TESHIV--FI---DGN----GKH----------------------E--E----G-----KLPQ-SE-WRFHMAAYQSRPDAN-----AVVHNHAVHCTAVSILNR-SIPAI-H--Y-MIAAAGG--------NSIPCA-PY-----A---------T----FG--T------REL---------SEHVAL---ALKN------------R---------K----ATLL--Q---HHGLIACEV------NLEK---AL--WLAHE---VEVLAQLYLTTLA-ITDPVPVLSDEEI---------------------------
17 HHSearch 80.6815% -92 - C1 -2OPI ? A:[3-197] -----------------TDEHIELFLA-------QAHRYG-D-AKLMLCSSGNLSWRI-G-----E----E----------------------------ALISGTGSWVPTL----AKEKVS--IC---NIAS---G-T----------------------PT-N----G-----VKPS-ME-STFHLGVLRERPDVN-----VVLHFQSEYATAISCMKN-KPTNF-NVTA-EIPCHVG--------SEIPVI-PY-----Y---------R----PG--S------PEL---------AKAVVE---AMLK------------H---------N----SVLL--T---NHGQVVCGK------DFDQ---VY--ERATF---FEMACRIIVQSG---GDYSVLTPEEIE---------------------------
34 Fugue 79.4013% -89 - C1 -1JDI ARAD_ECOLI A:[1-223] ----------------MLEDLKRQVLE-------ANLALP-K-HNLVTLTWGNVSAVDRER----G----V----------------------------FVIKPSGVDYSIM----TADDMV--VVSIETGE----V-V----------------------E--G----A-----KKPS-SD-TPTHRLLYQAFPSIG-----GIVHTHSRHATIWAQAGQ-SIPAT-G--T-THADYFY--------GTIPCT-RK-----M---------T----DA--EI----NGEY---------EWETGN---VIVE--T-----F---EKQGIDAAQMP----GVLV--H---SHGPFAWGK------NAED---AV--HNAIV---LEEVAYMGIFCRQ-LAPQLPDMQQTLLNKHYLRKH-------------------
18 HHSearch 79.3113%-100 - C1 -3OCR - ? A:[25-226] ----------DR-VSPQEWEVRVKLAA-------AYRLAA-L-KRWTDHIYTHFSARV-PGPD--E----H----------------------------FLINAFGLLFDEI----TASNLV--KV---DID----GTI----------------------V--DDPTGL-----GINY-AG-YVIHSAIHAARHDLQ-----AVLHTHTRDGIAVSAQKD-GLLPI-S--Q-HSIAFSG---------RVAYH-GY-----E---------G----IA--LD-----LSE---------RERLVA---DLGD------------K---------S----VMIL--R---NHGLLTGGV------SVEH---AI--QQLHA---LEYACNIQIAAQS-AGNAELVFPPREV---------------------------
20 HHSearch 78.8714% -93 - C1 -1K0W ARAD_ECOLI A:[2-206] -----------------LEDLKRQVLE-------ANLALP-K-HNLVTLTWGNVSAVD-RER---G----V----------------------------FVIKPSGVDYSIM----TADDMV--VV---SIET---G-EV---------------------V--EG---A-----KKPS-SD-TPTHRLLYQAFPSIG-----GIVHTHSRHATIWAQAGQ-SIPATGT--T-HANYFYG---------TIPCT-RK-----M---------TDAEING--EY----EWET---------GNVIVE---TFEK--QGIDAAQ---M---------P----GVLV--H---SHGPFAWGK------NAED---AV--HNAIV---LEEVAYMGIFCRQ-LAPQLPDMQQTLL---------------------------
35 Fugue 76.4517% -90 - C1 -1GT7 - RHAD_ECOLI A:[1-274] -----MQNITQ-------SWFVQGMIK-------ATTDAW-L-KGWDERNGGNLTLRL-DD----A----DIAPYHDNFHQQPRYIPLSQPMPLLANTPFIVTGSGKFFRNVQLDPAANLGI--VK---VDSDGAGY-H----------------------I--L----WGLTNEAVPT-SE-LPAHFLSHCERIKATNGKDRVIMHCHATNLIALTYVLE-NDTAV-F--T-RQLWEGS--------TECLVV-FP-----D---------G----VGILPW----MVPG---------TDEIGQ---ATAQEMQ-----K---H---------S----LVLW--P---FHGVFGSGP------TLDE---TF--GLIDT---AEKSAQVLVKVYS-MGGMKQTISREELIALGKRFGVTPLASALAL---------
36 Fugue 70.5512% -79 - C1 -2Z7B ? A:[34-270] ---------SFTMRRKVFEELVTATKI-------LLNEGIMD-------TFGHISARD-PEDP--A----S----------------------------FFLAQ-KLAPSLI----TVDDIQ--RF---NLD----G-E----------------------T--S----D-----NRPS-YLERYIHSEIYKTRPDVQ-----CVLHTHSPAVLPYCFVDT-PLRPV-T--HMGAFIGES--------VPVYEI-RD-----K---------H----GD--ET----DLFGGS-------PDVCAD---IAES--L-----G---S---------Q----TVVLM-A---RHGVVNVGK------SVRE---VV--FRAFY---LEQEAAALTAGLK-IGNVKYLSPGEIKTAGKLVGAQIDRGWNHWSQRLRQAGLA
23 HHSearch 67.8210%-102 - C1 -3M4R ? A:[4-216] -----MQNRWAE-T--KFDSDIDEVVY-------GSRLIG-SDPDLVL-GGGNTSVKT-TERDHAGRIISV----------------------------LRVKNSGSNLGTI----DSRGFT--GI---RMD----D-ALAAAKIDKMTDEAMVDYLKKSMVNPS----E-----PSPS-VE-TFLHAFL-----PYK-----FVMHSHADAILSITNT---DLPS-----D-QIAKILG---------NVVVL-PY-----I---------P----PG--F-------TL---------AKEVMN---CFKK--------G---I---------D----GIVL--R---KHGLLTFGD------TGKE---AY--DRHIN---IVSRAENFIR--------------------------------------------
37 Fugue 58.3113% -74 - C1 -3QVL ? A:[1-245] SVRIQVINPNT--SLAMTETIGAAARAVAAPGTEILAVCP-R-AGVPSI-EGHFDEAI-AA----V----G----------------------------VLEQIRAGREQGV----DGHVIA--SF---GDP----G-L----------------------L--A----A-----REL--AQ-GPVIGIAEAAMHMAT-----MVA---TRFSIVTTLPRT-LIIAR-H--L-LHQYGFH--------QHCAAL-HAIDLPVL---------A----LE--DG----SGLA---------QEKVRE---RCIR--A-----L---K---------EDGSGAIVL--G---SGGMATLAQ------QLTR---ELRVPVIDG---VSAAVKMVESLVA-LGLATSKHGDLAFPEKKALSGQFQSLNPF-----------
11 PsiBlast_PDB 48.1926% -44 - C1 -1UC2 RTCB_PYRHO A:[216-326] -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PEVAKAYGLFEG-QVVVM-V--H-TGSRGLG--------HQVA----------S---------D----YL--RI----MERAIRKYRIPWPDRELVSVPFQSEE--G-----Q---R---------Y----FSAM--K---AAANFAWAN------RQMI---TH--WVRES---FQEVFKQDPEGDLGMDIVYDVAHNIGK---------------------------
10 PsiBlast_PDB 47.9726% -50 - C1 -4DWR RTCB_PYRHO B:[216-326] -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PEVAKAYGLFEG-QVVVM-V--H-TGSRGLG--------HQVA----------S---------D----YL--RI----MERAIRKYRIPWPDRELVSVPFQSEE--G-----Q---R---------Y----FSAM--K---AAANFAWAN------RQMI---TH--WVRES---FQEVFKQDPEGDLGMDIVYDVAHNIGK---------------------------
12 PsiBlast_PDB 47.5926% -44 - C1 -4DWQ RTCB_PYRHO A:[216-326] -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PEVAKAYGLFEG-QVVVM-V--H-TGSRGLG--------HQVA----------S---------D----YL--RI----MERAIRKYRIPWPDRELVSVPFQSEE--G-----Q---R---------Y----FSAM--K---AAANFAWAN------RQMI---TH--WVRES---FQEVFKQDPEGDLGMDIVYDVAHNIGK---------------------------
9 PsiBlast_PDB 38.9032% -9 - C1 -2FZF - ? A:[39-116] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YKSLA--------EKIKIE-AL-----K---------E----KI--NWLAE-EEKK---------HEALLR---KLYS--Q-----MFPGK---------E----VVFP--KEHIGPELQPVAR------ELEK---VQ--DIIDL---IRWAMKAEEIAAE-FYLKLEEMVKEEE---------------------------
38 Fugue 31.467% -38 - C1 -2EEE - OARD1_HUMAN A:[1-149] -------GSSGS-SGG----------------------------SRITYVKGDLFACP-KT----D----S----------------------------LAHCISEDC--RM----GAGIAV--LF---KKK----F-G----------------------G--V----Q-----ELLN-QQ-KKSGEVAVLKRDGRY-----IYYLITKKRA------------------------------------------SH-----K---------P----TY--EN----LQKS---------LEAMKS---HCLK--N-----G---V---------T----DLSMPRI---GCGLDRLQW------ENVS---AM--IEEVF---EATDIKITVYTL------------------------------------------
30 HHSearch 28.7515% -24 - C1 -1GP6 - LDOX_ARATH A:[46-88] ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QVPTI-DL-----K---------N----IE--SDDEKIRENC---------IEELKK---ASLD------------W---------G----VMHL--I---NHGIPADLM------ERVK---KA--GEEFF---SLSVEEKEKYAND-QATGKIQGYGSKL---------------------------