Atome 2 Filter

@TOME V2.3
(Nov 2016)

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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]

Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : Lmo1369: (2016-03-24 )
MTKSRFFSDVAETSSFVFAVAGADDEVVLETIRLALKQKLGKFLLFGKKEDKTLTANESVTWIQTDTAEAAAQGAILAVKNKEADILVKGFIPTATLMHHVLKKENGLRTDQLLSQIAIFDIPTYHKPLLITDCAMNVAPKTKEKIAITENALAVAHQIGITNPKIALLSAVEEVTAKMPSTLEAQEVVQHFGNQISVSGPLALDVAISKEAALHKGITDSSAGEADILIAPNIETGNALYKSLVYFAGAKVGSAVVGAKVPIVISSRNDSPENKLASFILTVRLVEK

Atome Classification :

	(20 SA)									---------------------------------.........10...--......20....-----....30..-----.....--.40-........-------.50..------.-----...--.----.-----------------60.----.----...---.------.----------------------------.---------------------------70........80....----....90.-.-.-.-...-.---100.....-----..110--...--.--....120..----.-....130..----.----------..-...140...-----....150......-.160.......170---.---.--...---.---.---.-180-.---.---....---...190--------------------------..--..--..-------..200.......210.......220.......230.......240.......250........260----.........-------------270--.......280.-----.....---
		(Atome)	(Ident)	(Tito)	(Num)		(Ligand)	(Uniprot)		---------------------------------MTKSRFFSDV-AET--SSFVFAVAGADD-----EVVLETIR-----LALKQ--KL--GKFLLFGK-------KEDKT------L-----TAN--E----S-----------------VTW----I----QTD---T------A----------------------------E---------------------------AAAQGAILAVKNKEAD----ILVKGFI-P-T-A-TLM-H---HVLKKENG-----LRTD---QLL--S--QIAIFDIPT----Y-HKPLL-ITD----C----------AM-NVAPKTKEK-----IAITENALAVAHQ-IGITNPKIALLSA----V---E--EVT---A---K---M-P---S---T---LEAQ---EVVQH---------------------------FG--NQ--IS-------VSGPLALDVAISKEAALHKGITDSSAGEADILIAPNIETGNALYKSLVYFAGAK-VGSAVVGAK------VPIVISSRN-------------DSP--ENKLASFILTV-----RLVEK---
16	HHSearch	99.78	100%	-126	- C1 -	3UF6		?	A:[6-290]	-----------------------------------KSRFFSDV-AET--SSFVFAVAGADD-----EVVLETIR-----LALKQ--KL--GKFLLFGK-------KEDKT------L-----TAN--E----S-----------------VTW----I----QTD---T------A----------------------------E---------------------------AAAQGAILAVKNKEAD----ILVKGFI-P-T-A-TLM-H---HVLKKENG-----LRTD---QLL--S--QIAIFDIPT----Y-HKPLL-ITD----C----------AM-NVAPKTKEK-----IAITENALAVAHQ-IGITNPKIALLSA----V---E--EVT---A---K---M-P---S---T---LEAQ---EVVQH---------------------------FG--NQ--IS-------VSGPLALDVAISKEAALHKGITDSSAGEADILIAPNIETGNALYKSLVYFAGAK-VGSAVVGAK------VPIVISSRN-------------DSP--ENKLASFILTV-----RLVE----
3	PsiBlast_PDB	99.37	98%	-126	- C1 -	3UF6		?	A:[6-290]	-----------------------------------KSRFFSDV-AET--SSFVFAVAGADD-----EVVLETIR-----LALKQ--KL--GKFLLFGK-------KEDKT------L-----TAN--E----S-----------------VTW----I----QTD---T------A----------------------------E---------------------------AAAQGAILAVKNKEAD----ILVKGFI-P-T-A-TLM-H---HVLKKENG-----LRTD---QLL--S--QIAIFDIPT----Y-HKPLL-ITD----C----------AM-NVAPKTKEK-----IAITENALAVAHQ-IGITNPKIALLSA----V---E--EVT---A---K---M-P---S---T---LEAQ---EVVQH---------------------------FG--NQ--IS-------VSGPLALDVAISKEAALHKGITDSSAGEADILIAPNIETGNALYKSLVYFAGAK-VGSAVVGAK------VPIVISSRN-------------DSP--ENKLASFILTV-----RLVE----
1	PsiBlast_PDB	98.68	98%	-124	- C1 -	3TNG		?	A:[5-291]	----------------------------------TKSRFFSDV-AET--SSFVFAVAGADD-----EVVLETIR-----LALKQ--KL--GKFLLFGK-------KEDKT------L-----TAN--E----S-----------------VTW----I----QTD---T------A----------------------------E---------------------------AAAQGAILAVKNKEAD----ILVKGFI-P-T-A-TLM-H---HVLKKENG-----LRTD---QLL--S--QIAIFDIPT----Y-HKPLL-ITD----C----------AM-NVAPKTKEK-----IAITENALAVAHQ-IGITNPKIALLSA----V---E--EVT---A---K---M-P---S---T---LEAQ---EVVQH---------------------------FG--NQ--IS-------VSGPLALDVAISKEAALHKGITDSSAGEADILIAPNIETGNALYKSLVYFAGAK-VGSAVVGAK------VPIVISSRN-------------DSP--ENKLASFILTV-----RLVEK---
2	PsiBlast_PDB	98.55	98%	-125	- C1 -	3U9E		?	A:[5-290]	----------------------------------TKSRFFSD---ET--SSFVFAVAGADD-----EVVLETIR-----LALKQ--KL--GKFLLFGK-------KEDKT------L-----TAN--E----S-----------------VTW----I----QTD---T------A----------------------------E---------------------------AAAQGAILAVKNKEAD----ILVKGFI-P-T-A-TLM-H---HVLKKENG-----LRTD---QLL--S--QIAIFDIPT----Y-HKPLL-ITD----C----------AM-NVAPKTKEK-----IAITENALAVAHQ-IGITNPKIALLSA----V---E--EVT---A---K---M-P---S---T---LEAQ---EVVQH---------------------------FG--NQ--IS-------VSGPLALDVAISKEAALHKGITDSSAGEADILIAPNIETGNALYKSLVYFAGAK-VGSAVVGAK------VPIVISSRN-------------DSP--ENKLASFILTV-----RLVE----
29	Fugue	96.99	99%	-121	- C1 -	3TNG		?	A:[5-291]	----------------------------------TKSRFFSDV-AET--SSFVFAVAGADD-----EVVLETIR-----LALKQ--KL--GKFLLFGK-------KEDKT------L-----TAN--E----S-----------------VTW----I----QTD---T------A----------------------------E---------------------------AAAQGAILAVKNKEAD----ILVKGFI-P-T-A-TL-MH---HVLKKENG-----LRTD---QLL--S--QIAIFDIPT----Y-HKPLL-ITD----C----------A-MNVAPKTKEK-----IAITENALAVAHQ-IGITNPKIALLSA----V---E--EVT-------A---KMP---S---T---LEAQ---EVVQH---------------------------FG--NQ--IS-------VSGPLALDVAISKEAALHKGITDSSAGEADILIAPNIETGNALYKSLVYFAGAK-VGSAVVGAK------VPIVISSRN-------------DSP--ENKLASFILTV-----RLVEK---
15	HHSearch	77.45	42%	-104	- C1 -	1YCO		?	A:[1-275]	--------------------------------------------------MITVSIAGGSQ-----PEILQLVK-----KALKE--AEQPLQFIVFDT-------NENLD-------------TE--N----L-----------------WKY----V----HCS---D------E----------------------------A---------------------------AVAQEAVSLVATGQAQ----ILLKGII-Q-T-H-TLL-K---EMLKSEHQ-----LKNK---PIL--S--HVAMVELPA------GKTFL-LTD----C----------AM-NIAPTQATL-----IEIVENAKEVAQK-LGLHHPKIALLSA----A---E--NFN---P---K---M-P---S---S---VLAK---EVTAH---------------------------FNDQQE--AT-------VFGPLSLDLATSEEAVAHKRYSGPIMGDADILVVPTIDVGNCLYKSLTLFGHAK-VGGTIVGTK------VPVVLTSRS-------------DST--ESKFHSLRFAM-----RQVHH---
4	PsiBlast_PDB	76.48	42%	-104	- C1 -	1YCO		?	A:[5-273]	------------------------------------------------------SIAGGSQ-----PEILQLVK-----KALKEAEQP--LQFIVFDT-------NEN--------L-----DTE--N----L-----------------WKY----V----HCS---D------E----------------------------A---------------------------AVAQEAVSLVATGQAQ----ILLKGII-Q-T-H-TLL-K---EMLKSEHQ-----LKNK---PIL--S--HVAMVELPA----G--KTFL-LTD----C----------AM-NIAPTQATL-----IEIVENAKEVAQK-LGLHHPKIALLSA----A---E--NFN---P---K---M-P---S---S---VLAK---EVTAH---------------------------FN--DQQEAT-------VFGPLSLDLATSEEAVAHKRYSGPIMGDADILVVPTIDVGNCLYKSLTLFGHAK-VGGTIVGTK------VPVVLTSRS-------------DST--ESKFHSLRFAM-----RQV-----
18	HHSearch	67.67	22%	-91	- C1 -	2AF4		PTAS_METTE	C:[3-329]	-------------------------------------TFLEKISERAKKLNKTIALPETED-----IRTLQAAA-----KILER--GI--ADIVLVGN-------EADIKALAG--D-----LDL--S----K-----------------AKI----V----DPK---T------YEKKDEYINAFYELRKHKGITLENAAEIMS---------------------------DYVYFAVMMAKLGEVD----GVVSGAA-H-S-SSDTL-R---PAVQ-IVK-----TAKGA--ALA--S--AFFIISVPDCEYGS-DGTFL-FAD----S----------GM-VEMPSVEDV-----ANIAVISAKTFEL-LVQDVPKVAMLSY----S---T--KGS---A---K---S-KLTEA---T---IAST---KLAQE---------------------------LA--PD--IA-------IDGELQVDAAIVPKVAASKAPGSPVAGKANVFIFPDLNCGNIAYKIAQRLAKAEAYGPITQGLA------KPINDLSRG-------------CSD--EDIVGAVAITC-----VQAA----
20	HHSearch	64.99	20%	-91	- C1 -	1TD9		PTAS_BACSU	A:[10-328]	--------------------------------------LFSTVQEKVAGKDVKIVFPEGLD-----ERILEAVS-----KLAGN--KV--LNPIVIGN-------ENEIQAKAKELN-----LTL--G----G-----------------VKI----Y----DPH---T------YEGMEDLVQAFVERRKGKATEEQARKAL-L---------------------------DENYFGTMLVYKGLAD----GLVSGAA-H-STA-DTV-R---PALQ-IIK-----TKEGV--KKT--S--GVFIMARG-------EEQYV-FAD----C----------AI-NIAPDSQDL-----AEIAIESANTAKM-FDI-EPRVAMLSF----S---T--KGSAKSD---E---T-E---K---V---ADAV---KIAKE---------------------------KA--PE--LT-------LDGEFQFDAAFVPSVAEKKAPDSEIKGDANVFVFPSLEAGNIGYKIAQRLGNFEAVGPILQGLN------MPVNDLSRG-------------CNA--EDVYNLALITA-----AQA-----
19	HHSearch	63.76	23%	-87	- C1 -	1VMI		EUTD_ECOLI	A:[14-335]	--------------------------------------IIERCRELALRAPARVVFPDALD-----QRVLKAAQ-----YLHQQ--GL--ATPILVAN-------PFELRQFALSHG-----VAM--D----G-----------------LQV----I----DPH---G------N----------------------------LAMREEFAHRWLARAGEKTPPDALEKLTDPLMFAAAMVSAGKAD----VCIAGNL-SST-A-NVL-R---AGLR-IIG-----LQPGC--KTL--S--SIFLM-LPQ----YSGPALG-FAD----C----------SV-VPQPTAAQL-----ADIALASAETWRAITGE-EPRVAMLSF----S---S--NGS---A---R---H-P---CVANV---QQAT---EIVRE---------------------------RA--PK--LV-------VDGELQFDAAFVPEVAAQKAPASPLQGKANVMVFPSLEAGNIGYKIAQRLGGYRAVGPLIQGLA------APMHDLSRG-------------CSV--QEIIELALVAA-----VPR-----
6	PsiBlast_PDB	54.25	26%	-65	- C1 -	1VMI		EUTD_ECOLI	A:[123-320]	-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VSAGKAD----VCIAGNL-SST-A-NVL-RAGLRIIGLQPG-----CKT------L--S--SI-FLMLPQ----Y-SGPALGFAD----C----------SV-VPQPTAAQL-----ADIALASAETWRA-ITGEEPRVAMLSF----S---S--NGS---A---R---H-P---C---V---ANVQQATEIVRE---------------------------RA--PK--LV-------VDGELQFDAAFVPEVAAQKAPASPLQGKANVMVFPSLEAGNIGYKIAQRLGGYRAVGPLIQGLA------APMHDLSRG-------------CS---------------------------
7	PsiBlast_PDB	50.42	23%	-76	- C1 -	1TD9		PTAS_BACSU	A:[157-316]	----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GVFIMAR----G-EEQYV-FAD----C----------AI-NIAPDSQDL-----AEIAIESANTAKM-FDI-EPRVAMLSF----S---T--KGS---A---K---S-D---E---TEKVADAV---KIAKE---------------------------KA--PE--LT-------LDGEFQFDAAFVPSVAEKKAPDSEIKGDANVFVFPSLEAGNIGYKIAQRLGNFEAVGPILQGLN------MPVNDLSRG-------------CNA--ED----------------------
8	PsiBlast_PDB	49.51	23%	-73	- C1 -	1XCO		PTAS_BACSU	A:[157-316]	----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GVFIMAR----G-EEQYV-FAD----C----------AI-NIAPDSQDL-----AEIAIESANTAKM-FDI-EPRVAMLSF----S---T--KGS---A---K---S-D---E---TEKVADAV---KIAKE---------------------------KA--PE--LT-------LDGEFQFDAAFVPSVAEKKAPDSEIKGDANVFVFPSLEAGNIGYKIAQRLGNFEAVGPILQGLN------MPVNDLSRG-------------CNA--ED----------------------
25	HHSearch	49.36	14%	-83	- C1 -	1YXO		PDXA1_PSEAE	A:[2-325]	--------------------------------------------------SLRFALTPGEPAGIGPDLCLLLAR-----SAQ-----P--HPLIAIAS-------RTLLQE-----RAGQLGLAI--DLK--DVSPAAWPERPAKAGQ--LYV----W----DTPLAAP------VRPGQLDRANAAYV---------------L---------------------------ETLTRAGQGCLDGHFA----GMITAPV-H-K-G-VIN-E---AGIPF-SG------HTEFLADLTHTA--QVVMMLATR----G-LRVAL-ATTHLPLR----------EV-ADAISDERL-----TRVARILHADLRDKFGIAHPRILVCGLNPHAGEGGH--LGR---E---E---I-E---V---I---EPCL---ERLRG-------------------------------EG--LD-------LIGPLPADTLFTPKH--------L-E-HCDAVLAMYHDQGLPVLKYKGFGAAV----NVTLGL--------PIIRTSVDHGTALDLAGSGR-IDS--GSLQVALETAY-----QMAA----
37	Fugue	48.78	25%	-37	- C1 -	4FYP		VSP1_ARATH	A:[34-261]	----------------------------GLSINYPNCRSWHLG-VET--SNIIN---------------FDTVP-----ANCKA--YV--EDYLI---------------------------TSK--Q----Y-----------------QYD----S----KTV---N------K----------------------------E---------------------------AYFYAKGLALKNDTV-------------------------------------------------------NVWIFDLD---------------D----T----------LL-SSIPYYAKY-----GYGTEN------------TAPGAYWSW----L---ESGEST---P---G---L-P---E---T---LHLY---ENLLE---------------------------LGI-EP--II-------ISDRWKKLSEVTVENLKAVGVTKW---KHLILKPNGSKLTQVVYKSKVRNSLVK-KGYNIVGNI------GDQWADLVE-------------DTPGRVFKLPNPLYYV-----PSLEHHHH
26	HHSearch	47.92	16%	-80	- C1 -	3TSN		PDXA_CAMJE	A:[3-365]	-------------------------------------------------AMKKLAISIGDINSIGLEILVRSHE-----ELS----KI--CTPFYFIH-------ESLLNKALKLLN-----LKLF-NAKIVAFKDDKDYEFNFIKKENSLEIYSFCLPLGFKVD---E------NF---------------------------EIQAGEIDAKSGLYGF------------LSFKAASYFVYEKHAH----ALLTLPI-H-K-K-AWE-D---AGLKY-KG------HTDALRDFF--KK-NAIMMLGCK----E-LFVGL-FSEHIPLA----------KV-SKKITFKNL-----SIFLKDFYKE------THFKKMGLLGFNPHAGDYGV--IGG---E---E---E-K---I---M---EKAI---AFVNAFLHSKKDEKFFKKALKDENLQKELLLNFKG-KG--VY-------LPYPLVADTAFTKTGL----------KNCNRLVAMYHDLALAPLKALYFDKSI----NVSLNL--------PIIRVSVDHGTAFDKAYKNAKINT--KSYFEAAKFAI-----NLHS----
12	PsiBlast_PDB	47.27	26%	-64	- C1 -	4E4R		PTAS_STAAR	A:[166-317]	---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------I-FGD----C----------AI-NPELDSQGL-----AEIAVESAKSALS-FG-MDPKVAMLSF----S---T--KGS---A---K---S-D---D---V---TKVQ---EAVKL---------------------------AQ--QK--AEEEKLEAIIDGEFQFDAAIVPGVAEKKAPGAKLQGDANVFVFPSLEAGNIGYKIAQRLGGYDAVGPVLQGLN------SPVNDLSRG-------------CSI--ED----------------------
23	HHSearch	47.17	13%	-76	- C1 -	3LXY		PDXA_YERPE	A:[7-330]	-------------------------------------------------HNNRLVITPGEPAGVGPDLAITLAQ-----QD-----WP--VELVVCAD-------PALLLARASQLN-----LPLQLR----EYQADQPAIAQQAGS---LTI----L----PVK---TA-----VNVVPGKLDVGNSHYV-------------V---------------------------ETLAKACDGAISGEFA----ALVTGPV-Q-K-S-IIN-D---AGIPF-IG------HTEFFADRS--HCQRVVMMLATE----E-LRVAL-ATTHLPLL----------AV-PGAITQASL-----HEVITILDNDLKTKFGITQPQIYVCGLNPHAGEGGH--MGH---E---E---I-D---T---I---IPAL---NTLRQ-------------------------------QG--IN-------LIGPLPADTLFQPKY--------L-Q-HADAVLAMYHDQGLPVLKYQGFGRAV----NITLGL--------PFIRTSVDHGTALELAATGT-ADV--GSFITALNLAI-----KMIN----
32	Fugue	44.32	20%	-64	- C2 -	4ZOX	-	SQT1_YEAST	A:[3-381]	MSNNSLTYFDKHTDSVFAIGHHPNLPLVCTGGGDNLAHLWTSH-SQP--PKFAGTLTGYGE-----SVISCSFTSEGGFLVTAD--MS--GKVLVHMGQKGGAQWKLASQ------M-----QEV--E----E-----------------IVW----L----KTH---PTIARTFA----------------------------F---------------------------GATDGSVWCYQINEQDGSLEQLMSGFVHQ-Q-D-CSM-G---EFINTDKGENTLELVTC---SLD--S--TIVAWNCFT----G-QQLFK-ITQ----AEIKGLEAPWISL-SLAPETLTKGNSGVVACGSNNGLLAVI-NCNNGGAILHLST----V---I--ELK---PEQDE---L-D---A---S---IESI---SWSSK---------------------------FS--LMA-IG-------LVCGEILLYDTSAWRVRHKFVLEDS---VTKLMFDNDDLFASCINGKVYQFNAR-TGQEKFVCVGHNMGVLDFILLHPV-------------ANT--GTEQKRKVITAGDEGVSLVFEVPN
17	HHSearch	43.79	23%	15	* C1 *	1R5J	-	?	A:[2-327]	----------------------------------SIRSLFGGLREKILGKNMKIVFPEGND-----ERVVRAAA-----RLKFE--GL--LEPIILGQ-------SEEVRNLLTKLG-----FAD--Q----D-----------------YTI----I----NPN---E------Y----------------------------ADFDKMKEAFVEVRKGKATLEDADKMLRDVNYFGVMLVKMGLAD----GMVSGAI-H-STA-DTV-R---PALQ-IIK-----TKPGI--SRT--S--GVFLMNREN----T-SERYV-FAD----C----------AI-NIDPTAQEL-----AEIAVNTAETAKI-FDI-DPKIAMLSF----S---T--KGS---G---KAPQV-D---K---V---REAT---EIATG---------------------------LN--PD--LA-------LDGELQFDAAFVPETAAIKAPDSAVAGQANTFVFPDLQSGNIGYKIAQRLGMFDAIGPILQGLN------KPVNDLSRG-------------SSA--EDIYKLAIITA-----AQAI----