@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : Lmo0101: (2016-03-12 )
MKKLNELSKSDLLLIFQALSDPIRLDIFLCLLKSKEKRFSGTTYNISKSTMSHHIKLLKEAKLINLRKEGTTHIYSVNQELVSLISHFFEECGEKDE

Atome Classification :

(20 SA) --.........10-.......--..---20........30.....-...40-...--.--.--------.---...50........60.......--.---70......-..80........90......----
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) --MKKLNELSKS--DLLLIFQ--AL---SDPIRLDIFLCLLKSKE-KRFS--GTT--Y--N--------I---SKSTMSHHIKLLKEAKLINLRK--E---GTTHIYSV-NQELVSLISHFFEECGEKDE----
45 Fugue 83.7523%-119 - C1 -1SMT - SMTB_SYNE7 A:[24-121] -ELQAIAPEVAQ--SLAEFFA--VL---ADPNRLRLLSLLARSELCVGDL--AQA--I--G--------V---SESAVSHQLRSLRNLRLVSYRK--Q---GRHVYYQLQDHHIVALYQNALDHLQEC------
24 HHSearch 82.8028%-117 - C1 -1R1U - ? A:[9-98] ------NTDTLE--RVTEIFK--AL---GDYNRIRIMELLSV-SE-ASVG--HISHQL--N--------L---SQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKR--Q---GQSMIYSL-DDIHVATMLKQAIHHA--------
9 PsiBlast_PDB 82.2327%-136 - C1 -3CUO - YGAV_ECOLI A:[1-89] --MTELAQLQASAEQAAALLK--AM---SHPKRL-LILCMLSGSP-GTSA--GEL--T--R--------ITGLSASATSQHLARMRDEGLIDSQR--D---AQRILYSI-KNEAVNAI----------------
29 HHSearch 78.9824%-143 - C1 -3F6V - ? A:[26-104] ---------------VLDQLE--VA---AEPTRRRLVQLLT-SGE-QTVN--NLAAHF--P--------A---SRSAISQHLRVLTEAGLVTPRK--D---GRFRYYRL-DPQGLAQLRALF------------
13 PsiBlast_PDB 78.8924%-134 - C1 -3F6O ? A:[11-91] ------------------IFQ--AL---ADPTRRAV-LGRLSRGP-ATVSELAKP--F--D--------M---ALPSFMKHIHFLEDSGWIRTHK--Q---GRVRTCAI-EKEPFTAVEAWLAEQQE-------
7 PsiBlast_PDB 78.3827%-117 - C1 -3F72 CADC_STAAU A:[35-107] ------------------ILK--AI---ADENRAKITYALCQDEE-LCVCDIANI--L--G--------V---TIANASHHLRTLYKQGVVNFRK------GKLALYSL-GGEAIRQI----------------
6 PsiBlast_PDB 75.7225%-122 - C1 -3F6V - ? A:[26-105] ------------------VLD--QLEVAAEPTRRRL-VQLLTSGE-QTVNNLAAH--F--P--------A---SRSAISQHLRVLTEAGLVTPRK--D---GRFRYYRL-DPQGLAQLRALFD-----------
27 HHSearch 75.2524%-124 - C1 -3F6O ? A:[5-81] ----------PE--QLNGIFQ--AL---ADPTRRAVLGRLS-RGP-ATVS--ELAKPF--D--------M---ALPSFMKHIHFLEDSGWIRTHK--Q---GRVRTCAI-EKEPFTA-----------------
34 HHSearch 75.0123%-116 - C1 -2KKO - ? A:[12-96] ----------LD--QVARVGK--AL---ANGRRLQILDLLAQ-GE-RAVE--AIATAT--G--------M---NLTTASANLQALKSGGLVEARR--E---GTRQYYRI-AGEDVARLFALVQVV---------
32 HHSearch 74.7221%-143 - C1 -1UB9 - ? A:[4-90] ---------------LKEIMKSHIL---GNPVRLGIMIFLLPRRK-APFS--QIQKVL--D--------L---TPGNLDSHIRVLERNGLVKTYK--VIADRPRTVVEI-TDFGMEEAKRFLSS----------
49 Fugue 74.2421%-115 - C1 -1UB9 - ? A:[1-100] --MEELKEIMKS--------H--IL---GNPVRLGIMIFLLPRRK-APFS--QIQ--KVLD--------L---TPGNLDSHIRVLERNGLVKTYK--VIADRPRTVVEI-TDFGMEEAKRFLSSLKAVIDGLDL
10 PsiBlast_PDB 72.5127%-110 - C1 -1U2W CADC_STAAU A:[35-107] ------------------ILK--AI---ADENRAKITYALCQDEE-LCVCDIANI--L--G--------V---TIANASHHLRTLYKQGVVNFR---------LALYSL-GDEHIRQI----------------
31 HHSearch 71.8824%-115 - C1 -1U2W CADC_STAAU A:[26-116] -------TVDIS--GVSQILK--AI---ADENRAKITYALCQDEE-LCVC--DIANIL--G--------V---TIANASHHLRTLYKQGVVNFR---------LALYSL-GDEHIRQIMMIALAHKK-------
8 PsiBlast_PDB 71.6929%-113 - C1 -4OOI - HLYU_VIBCH A:[26-92] ----------------VVLLK--AM---ANERRLQI-LCMLLDNE-LSVGELSSR--L--E--------L---SQSALSQHLAWLRRDGLVNTRK--E---AQTVFYTL-S-----------------------
1 PsiBlast_PDB 71.1636%-110 - C1 -4GGG ? A:[18-82] ------------------IFK--AL---GDYNRIRI-MELLSVSE-ASVG--HIS--HQLN--------L---SQSNVSHQLKLLKSAHVVKAKR--Q---GQSMIYSL-D-----------------------
21 PsiBlast_CBE 70.7836%-115 - C1 -4GGG ? B:[18-82] ------------------IFK--AL---GDYNRIRI-MELLSVSE-ASVG--HIS--HQLN--------L---SQSNVSHQLKLLKSAHVVKAKR--Q---GQSMIYSL-D-----------------------
47 Fugue 70.4721%-124 - C1 -3CUO - YGAV_ECOLI A:[1-98] MTELAQLQASAE--QAAALLK--AM---SHPKRLLILCMLSGSPG-TSAG--ELT--R--I--------TGL-SASATSQHLARMRDEGLIDSQR--D---AQRILYSIKNEAVNAIIATLKNVYC--------
26 HHSearch 69.9420%-121 - C1 -2OQG ? A:[5-89] -------VGTYA--ELASVFA--AL---SDETRWEILTELGR-AD-QSAS--SLATRL--P--------V---SRQAIAKHLNALQACGLVESVK--V---GREIRYRA-LGAELNKTARTL------------
40 HHSearch 69.6615%-136 - C1 -3F8B - ? A:[6-94] -------------------KE--ML---RAQTNVILLNVLKQ-GD-NYVY--GIIKQV--KEASNGEMEL---NEATLYTIFKRLEKDGIISSYWGD----GRRKYYRL-TEIGHENMRLAFE-----------
28 HHSearch 69.4724%-121 - C1 -3CUO - YGAV_ECOLI A:[10-97] ---------SAE--QAAALLK--AM---SHPKRLLILCMLSGSPG-TSAG--ELTRIT--G--------L---SASATSQHLARMRDEGLIDSQR--D---AQRILYSI-KNEAVNAIIATLKNVY--------