@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : Lmo1087: (2016-03-21 )
MINQVYRLVSERQFEEANIEEALTEDVVVVRPTYLSICAADQRYYTGSRGKEMLSKKLPMALIHEGVGQVTYDATGEFEIGTKVVMIPNTPTEDDPVIAENYRRSSLFRSSGYDGLMQENVFMRRDRVVRLPENMDMEVAAYSELISVAFHAITRFKQKANANQSVFGVWGDGNLGFITCLLLKTIYPESKVIIFGKTQYKLDFFSFVDEAHLVDEIPEGLVIDNAFECAGGKGSQYAVEQIIDLIKPEGTISLLGVSENPIEFNSRMVLEKGLTVFGSSRSGKEDFQNTVNFLSENERAVEYLSSLIGQRKVVRNLQDIIEAFETDLRNPFGKTVMEWKV

Atome Classification :

(20 SA) .........--10--.---.-.-......20.-.-......30........40-...-.....50........60........70.....--.----..80........----90--..---------.---..---....-----------100-..--....---.---------------------.----------------------110---.---.---.......120....-...130.......140.-.......150.......-----------160..---....-------.170-.......180------..-------..-.-------..----190.......---200-....--.------...210.-...----------.----------.-.----220---------.-........230.......240..-....-.-250.......------260-----..--...----.-.---.270......-----.280---.---.---....-.290.......300........310-.......320.......330........340
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) MINQVYRLV--S---E---R-Q-FEEANIEEA-L-TEDVVVVRPTYLSICAAD-QRY-YTGSRGKEMLSKKLPMALIHEGVGQVTYDATG--E----FEIGTKVVMIPN----T---PT---------E---DD---PVIA-----------EN--YR--RSSL---F---------------------R----------------------S-----S---G---YDGLMQENVFMRRD-RVVRLPENMDMEVAA-Y-SELISVAFHAITRFKQK-----------ANANQ---SVFG-------VWGD-GNLGFITCLL------LK-------TI-Y-------PE----SKVIIFGKTQ---Y-K-LDFF--S------FVDEAHL-VDE----------I----------P-E----G-----------L-VIDNAFECAGGKGSQYAVEQIID-LIKP-E-GTISLLGVSE------N-P-----IE--FNS----R-M---VLEKGLTVFG-----SSRS---G---K---EDFQ-NTVNFLSENERA-VEYLSSLIGQRK-VVRNLQDIIEAFETDLRNP-FGKTVMEWKV-
9 PsiBlast_PDB 84.8023% -90 - C1 -4ILK ? A:[47-349] ---------------------------------------VRVKVKLAGICGSD-SHI-Y---RGHNP----YPRVIGHEFFGVI--DAVG--EGVESARVGERVAV---------------------------D---PVVSCGHCYPCSIGKPN--VC--TTLA---V---------------------L----------------------G-----V---H---ADGGFSEYAVVPAK-NAWKIPEAVADQYAV-M-IEPFTIAAN-VTGHGQP-----------TE-ND---TVL--------VYGA-GPIGLTIVQV------LK-------GV-Y-------NV----KNVIVADRID---E-R-LEKAKES------GADWAIN-NSQ----------T----------P-L----GESFAEKGIKPTL-IIDAACH-------PSILKEAVT-LASP-A-ARIVLMGFSS------E-P-----SE--VIQ----Q-G---ITGKELSIF------SSRL---N---A---NKFP-VVIDWLSKGLIK-PE---KLITHTF-DFQHVADAISLFELDQKH-------------
25 HHSearch 82.2520% -95 - C1 -2D8A TDH_PYRHO A:[3-347] EKMVAIMKT--K---P---G-YGAELVEVDVPKP-GPGEVLIKVLATSICGTD-LHI-YEWNEWAQ-SRIKPPQIMGHEVAGEVVEIGPGVEG----IEVGDYVSVETH----I---VC---------G---KCY---------------------------TK---I---------------------F----------------------G-----V---D---TDGVFAEYAVVPAQ-NIWKNPKSIPPEYAT-L-QEPLGNAVDTVLA--G-------------PISG---KSVL-------ITGA-GPLGLLGIAV------AK-------A--S-------GA----YPVIVSEPSD---F-R-RELAK-KV-----GADYVIN-PFEEDVVKEVMD-I----------T-D----G-----------N-GVDVFLEFSGA---PKALEQGLQ-AVTP-A-GRVSLLGLYP------G-K-----VT--IDF----NNL---IIFKALTIYG-----ITGRH--L---W---ETWY-TVSRLLQ-SGKL---NLDPIITHKYKG---FDKYEEAFELMRAGK-TGKVVFML---
29 HHSearch 82.1920% -79 - C1 -2B5W GLCDH_HALMT A:[1-355] --MKAIAVK--R---GE--D-R-PVVIEKPRPEP-ESGEALVRTLRVGVCGTD-HEV-IAGGHGGF-PEGEDHLVLGHEAVGVVVDPNDT--E----LEEGDIVVPTVRRP--P---AS---------G---TNEYFERDQ-----------PD--MA--PDGM---Y---------------------F----------------------E-----RGIVG---AHGYMSEFFTSPEK-YLVRIPRSQ-AELGF-L-IEPISITEKALEHAYASRSA--------FDWDP---SSAF-------VLGN-GSLGLLTLAM------LK-------VDDK-------GY----ENLYCLGRRDRPDP-T-IDIIE-EL-----DATYVDS-RQTPVED------VP---------D-V----Y-----------E-QMDFIYEATGF---PKHAIQSVQ-ALAP-N-GVGALLGVPS------D-WA----FE--VDAGAFHR-E---MVLHNKALVG-----SVNS---H---V---EHFE-AATVTFTKLPK---WFLEDLVTGVH-P---LSEFEAAFDDDDT---TIKTAIEFS--
39 HHSearch 77.7919% -80 - C1 -2DQ4 TDH_THET8 A:[1-342] --MRALAKL--A---PE--E-G-LTLVDRPVPEP-GPGEILVRVEAASICGTD-LHI-WKWDAWAR-GRIRPPLVTGHEFSGVVEAVGPGVRR----PQVGDHVSLESH----I---VC---------H---ACPACRTGN-----------YH--VC--LNTQ---I---------------------L----------------------G-----V---D---RDGGFAEYVVVPAE-NAWVNPKDLPFEVAA-I-LEPFGNAVHTVYAGS--------------GVSG---KSVL-------ITGA-GPIGLMAAMV------VR-------A--S-------GA----GPILVSDPNP---Y-R-LAFA--RP-----YADRLVN-PLEEDLLEV----VRR--------V-T----G-----------S-GVEVLLEFSGN---EAAIHQGLM-ALIP-G-GEARILGIPS------D-P-----IR--FDLA---G-E---LVMRGITAFG-----IAGR---RL--W---QTWM-QGTALVY-SGRV---DLSPLLTHRL-P---LSRYREAFGLLASGQ-AVKVILDPK--
33 HHSearch 75.4519% -78 - C1 -3JV7 ? A:[1-345] --MKAVQYT--E---I---GSE-PVVVDIPTPTP-GPGEILLKVTAAGLCHSD-IFV-MDMPAAQ--YAYGLPLTLGHEGVGTVAELGEGVTG----FGVGDAVAVYGP----W---GC---------G---ACHACARGR-----------EN--YC--TRAA---D---------------------L----------------------GITPPGL---G---SPGSMAEYMIVDSARHLVPIG-DLDPVAAAPL-TDAGLTPYHAISRVLPL------------LGPG---STAV-------VIGV-GGLGHVGIQI------LR-------A--V-------SA----ARVIAVDLDD---D-R-LALAR-EV-----GADAAVK-SGAGAADAIRE--L----------T-G----G-----------Q-GATAVFDFVGA---QSTIDTAQQ-VVAV-D-GHISVVGIHA------G-AH----AK--VGF----F-M---I-PFGASVVT-----PYWG---T---R---SELM-EVVALAR-AGR-----LDI-HTETF-T---LDEGPAAYRRLREGSIRGRGVVVP---
7 PsiBlast_PDB 74.6522% -68 - C1 -4UEK ? A:[16-316] -------------------------ESVIPEI-K-HQDEVRVKIASSGLCGSDLPRI-FKNG------AHYYPITLGHEFSGYIDAVGSGVDD----LHPGDAVACVPL----L---PC---------F---TC---PECL-----------KG--FY--SQCAKYDF---------------------I----------------------G-----S---R---RDGGFAEYIVVKRK-NVFALPTDMPIEDGA-F-IEPITVGLHAFHLAQGC-----------ENKNV---IIIG-------AGTI-GLLA-IQCAVALGAKSVT-------AI-D-------IS----SEKLALAKSF---G-A-MQTFNSS------EMSAPQM-QSV----------L----------R-ELRFNQ-----------L-ILETA-------GVPQTVELAVE-IAGP-H-AQLALVGTLH------Q-D-----LH--LTS----A-TFGKILRKELTVIGSWMNYSSPW---P---G---QEWE-TASRLLTERKLS-LEPL----------------------------------------
24 HHSearch 74.5019% -84 - C1 -2EIH ? A:[1-342] --MRAVVMR--A---RGGPE-V-LEVADLPVPEP-GPKEVRVRLKAAALNHLD-VWV-RKGVASP---KLPLPHVLGADGSGVVDAVGPGVEG----FAPGDEVVINPG----L---SC---------G---RCERCLAGE-----------DN--LC--PRYQ---I---------------------L----------------------G-----E---H---RHGTYAEYVVLPEA-NLAPKPKNLSFEEAAAI-PLTFLTAWQMVVDKLG-------------VRPG---DDVL-------VMAAGSGVSVAAIQI------AK-------L--F-------G-----ARVIATAGSE---D-K-LRRAK-AL-----GADETVN-YTHPDWPKEVRR-L----------T-G----G-----------K-GADKVVDHTGA----LYFEGVIK-ATAN-G-GRIAIAGASS------GYE-----GT--LPF----A-H---VFYRQLSILG-----STMA---S---K---SRLF-PILRFVE-EG-----KLKPVVGQVL-P---LEAAAEGHRLLEERRVFGKVVLQV---
6 PsiBlast_PDB 73.0822% -70 - C1 -4UEJ ? A:[16-316] -------------------------ESVIPEI-K-HQDEVRVKIASSGLCGSDLPRI-FKNG------AHYYPITLGHEFSGYIDAVGSGVDD----LHPGDAVACVPL----L---PC---------F---TC---PECL-----------KG--FY--SQCAKYDF---------------------I----------------------G-----S---R---RDGGFAEYIVVKRK-NVFALPTDMPIEDGA-F-IEPITVGLHAFHLAQGC-----------ENKNV---IIIG-------AGTI-GLLA-IQCAVALGAKSVT-------AI-D-------IS----SEKLALAKSF---G-A-MQTFNSS------EMSAPQM-QSV----------L----------R-ELRFNQ-----------L-ILETA-------GVPQTVELAVE-IAGP-H-AQLALVGTLH------Q-D-----LH--LTS----A-TFGKILRKELTVIGSWMNYSSPW---P---G---QEWE-TASRLLTERKLS-LEPL----------------------------------------
5 PsiBlast_PDB 73.0622% -69 - C1 -4A2C GATD_ECOLI A:[16-316] -------------------------ESVIPEI-K-HQDEVRVKIASSGLCGSDLPRI-FKNG------AHYYPITLGHEFSGYIDAVGSGVDD----LHPGDAVACVPL----L---PC---------F---TC---PECL-----------KG--FY--SQCAKYDF---------------------I----------------------G-----S---R---RDGGFAEYIVVKRK-NVFALPTDMPIEDGA-F-IEPITVGLHAFHLAQGC-----------ENKNV---IIIG-------AGTI-GLLA-IQCAVALGAKSVT-------AI-D-------IS----SEKLALAKSF---G-A-MQTFNSS------EMSAPQM-QSV----------L----------R-ELRFNQ-----------L-ILETA-------GVPQTVELAVE-IAGP-H-AQLALVGTLH------Q-D-----LH--LTS----A-TFGKILRKELTVIGSWMNYSSPW---P---G---QEWE-TASRLLTERKLS-LEPL----------------------------------------
32 HHSearch 73.0321% -72 - C1 -3UOG ? A:[26-363] KWMQEWSTETVA---P---H-D-LKLAERPVPEA-GEHDIIVRTLAVSLNYRD-KLV-LETGMGL---DLAFPFVPASDMSGVVEAVGKSVTR----FRPGDRVISTFA----P---GW---------L---DG---LRPG-----------TG--RT--PAYE---T---------------------L----------------------G-----G---A---HPGVLSEYVVLPEG-WFVAAPKSLDAAEASTL-PCAGLTAWFALVEKGH-------------LRAG---DRVV-------VQGT-GGVALFGLQI------AK-------A--T-------G-----AEVIVTSSSR---E-K-LDRAF-AL-----GADHGIN-RLEEDWVERVYA-L----------T-G----D-----------R-GADHILEIAGG----AGLGQSLK-AVAP-D-GRISVIGVLE------GFE-----VS--GPV----G-P---LLLKSPVVQG-----ISVG---H---R---RALE-DLVGAVD-RL-----GLKPVIDMRY-K---FTEVPEALAHLDRGP-FGKVVIEF---
27 HHSearch 71.0718% -82 - C1 -3S2E ? A:[2-339] -MMKAAVVR--A---F---GAP-LTIDEVPVPQP-GPGQVQVKIEASGVCHTD-LHA-ADGDWPV---KPTLPFIPGHEGVGYVSAVGSGVSR----VKEGDRVGVPWLY---SACGYC---------E---HC---LQGW-----------ET--LC--EKQQ---N---------------------T----------------------G-----Y---S---VNGGYGEYVVADPN-YVGLLPDKVGFVEIAPI-LCAGVTVYKGLKVTD--------------TRPG---QWVV-------ISGI-GGLGHVAVQY------AR-------A--M-------G-----LRVAAVDIDD---A-K-LNLAR-RL-----GAEVAVN-ARD----------TDPAAWLQ---KEI----G-----------G-AHGVLVTAVS----PKAFSQAIG-MVRR-G-GTIALNGLPP------G-D-----FG--TPI----F-D---VVLKGITIRG-----SIVG---T---R---SDLQ-ESLDFAA-HG-----DVKATV-STA-K---LDDVNDVFGRLREGKVEGRVVLDFS--
38 HHSearch 70.2117% -69 - C1 -2CDC GLCDH_SULSF A:[1-363] --MKAIIVK--P---P---NAG-VQVKDVDEKKLDSYGKIKIRTIYNGICGAD-REI-VNGKL------GKDFLVLGHEAIGVVEESYH---G----FSQGDLVMPVNR----R---GC---------G---ICRNCLVGR-----------PD--FC--ETGE---F---------------------G----------------------E-----AGIHK---MDGFMREWWYDDPK-YLVKIPKSIEDIGILAQ-PLAD--IEKSIEEILEVQKRVPVWTCDDGTLNC---RKVL-------VVGT-GPIGVLFTLL------FR-------T--Y-------G-----LEVWMANRRE---PTE-VEQTVIEE-----TKTNYYN-SSNGYDK------LK---------D-S----V-----------G-KFDVIIDATGAD--VNILGNVIP-LLGR-N-GVLGLFGFST------S-GS----VP--LDYKTL-Q-E---IVHTNKTIIG-----LVNG---Q---K---PHFQ-QAVVHLASWKTLYPKAAKMLITKTV-S---INDEKELLKVLREKE-HGEIKIRI---
8 PsiBlast_PDB 69.8822% -67 - C1 -4UEO ? A:[16-316] -------------------------ESVIPEI-K-HQDEVRVKIASSGLCGSDLPRI-FKNG------AHYYPITLGHEFSGYIDAVGSGVDD----LHPGDAVACVPL----L---PC---------F---TC---PECL-----------KG--FY--SQCAKYDF---------------------I----------------------G-----S---R---RDGGFAEYIVVKRK-NVFALPTDMPIEDGA-F-IEPITVGLHAFHLAQGC-----------ENKNV---IIIG-------AGTI-GLLA-IQCAVALGAKSVT-------AI-D-------IS----SEKLALAKSF---G-A-MQTFNSS------EMSAPQM-QSV----------L----------R-ELRFNQ-----------L-ILETA-------GVPQTVELAVE-IAGP-H-AQLALVGTLH------Q-D-----LH--LTS----A-TFGKILRKELTVIGSWMNYSSPW---P---G---QEWE-TASRLLTERKLS-LEPL----------------------------------------
30 HHSearch 69.6718% -75 - C1 -2FZW ADHX_HUMAN A:[6-371] -KCKAAVAWE-A---G---K-P-LSIEEIEVAPP-KAHEVRIKIIATAVCHTD-AYT-LSGADP----EGCFPVILGHLGAGIVESVGEGVTK----LKAGDTVIPLYI----P---QC---------G---ECKFCLNPK-----------TN--LC--QKIR---V---------------------TQGKGLMPDGTSRFTCKGKTIL-H-----Y---M---GTSTFSEYTVVADI-SVAKIDPLAPLDKVC-LLGCGISTGYGAAVNTAK-------------LEPG---SVCA-------VFGL-GGVGLAVIMG------CK-------V--A-------GA----SRIIGVDINK---D-K-FARAK-EF-----GATECIN-PQDFSKPIQEVLIE----------M-T----D-----------G-GVDYSFECIGN---VKVMRAALE-ACHKGW-GVSVVVGVAA------S-G-----EE--IAT----RPF---QLVTGRTWKG-----TAFG---G---WKSVESVP-KLVSEYM-SKKI---KVDEFVTHNL-S---FDEINKAFELMHSGK-SIRTVV-----
36 HHSearch 68.8318% -78 - C1 -1YQD ? A:[14-358] -PVKAFGWA--ARDQS---G-H-LSPFNFSRRAT-GEEDVRFKVLYCGVCHSD-LHS-IKNDWGF----SMYPLVPGHEIVGEVTEVGSKVKK----VNVGDKVGVGCLVGACH---SC---------E---SC---ANDL-----------EN--YC--PKMI---LTYASIYH--------------D----------------------G-----T---I---TYGGYSNHMVANER-YIIRFPDNMPLDGGAPL-LCAGITVYSPLKYFGL-------------DEPG---KHIG-------IVGL-GGLGHVAVKF------AK-------A--F-------G-----SKVTVISTSP---S-K-KEEAL-KNF----GADSFLV-SRDQEQ-------MQ---------A-A----A-----------G-TLDGIIDTVSA---VHPLLPLFG-LLKS-H-GKLILVGAPE------K-P-----LE--LPA----F-S---LIAGRKIVAG-----SGIG---G---M---KETQ-EMIDFAA-KH-----NITADI-EVI-S---TDYLNTAMERLAKNDVRYRFVIDVG--
31 HHSearch 67.5319% -77 - C1 -2CF5 CADH5_ARATH A:[8-351] RKTTGWAAR--D---PS--G-I-LSPYTYTLRET-GPEDVNIRIICCGICHTD-LHQ-TKNDLGM----SNYPMVPGHEVVGEVVEVGSDVSK----FTVGDIVGVGCLV---G---CC---------GGCSPC---ERDL-----------EQ--YC--PKKI---W---------------------SYNDVYIN---------------G-----Q---P---TQGGFAKATVVHQK-FVVKIPEGMAVEQAAPL-LCAGVTVYSPLSHFGL-------------KQPG---LRGG-------ILGL-GGVGHMGVKI------AK-------A--M-------G-----HHVTVISSSN---K-KREEALQ-DL-----GADDYVI-GSD----------QAKMS------E-L----A-----------D-SLDYVIDTVPV---HHALEPYLS-LLKL-D-GKLILMGVIN------N-P-----LQ--FLT----P-L---LMLGRKVITG-----SFIG---S---M---KETE-EMLEFCK-EK-----GLSSII-EVV-K---MDYVNTAFERLEKNDVRYRFVVDVE--
40 HHSearch 65.4417% -81 - C1 -1CDO ADH1_GADMC A:[7-374] IKCKAAVAW--EA--N---K-P-LVIEEIEVDVP-HANEIRIKIIATGVCHTD-LYHLFEGKH-----KDGFPVVLGHEGAGIVESVGPGVTE----FQPGEKVIPLFI----S---QC---------G---ECRFCQSPK-----------TN--QC--VKGW---ANESPDVMSPKETRFTCKGRKVL----------------------Q-----F---L---GTSTFSQYTVVNQI-AVAKIDPSAPLDTVCLL-GCGVSTGFGAAVNTAK-------------VEPG---STCA-------VFGL-GAVGLAAVMG------CH-------S--A-------GA----KRIIAVDLNP---D-K-FEKA--KVF----GATDFVN-PNDHSEPISQVLSK----------M-T----N-----------G-GVDFSLECVGN---VGVMRNALESCLKG-W-GVSVLVGWTD------L-HD----VA--TRP------I---QLIAGRTWKG-----SMFG---GFKGK---DGVP-KMVKAYL-DKKV---KLDEFITHRM-P---LESVNDAIDLMKHGK-CIRTVLSL---
16 PsiBlast_PDB 64.9725% -71 - C1 -2B5W GLCDH_HALMT A:[28-316] ---------------------------------------ALVRTLRVGVCGTD-HEV-IAGGHGG-FPEGEDHLVLGHEAVGVVVDPNDT--E----LEEGDIVVPTVR----R---PPASGTNEYFER---DQ---PDMA-----------PDGMYF--ERGI---V---------------------G----------------------A-----H---G---Y---MSEFFTSPEK-YLVRIPRSQ-AELGF-L-IEPISITEKAL----EH-----------AYASR---SAFDWDPSSAFVLGN-GSLGLLTLAM------LKVDDKGYENL-YCLGRRDRPD----PTIDII-------E-E-LD-A--T------YVDSRQTPVED----------V----------P-D----V-----------YEQMDFIYEATGFP--KHAI-QSVQ-ALAP-N-GVGALLGVPSDWAFEVD-A-----GA--FHR----E-M---VLHNKALV-G-----SVNS---H---V---EHFEAATVTF----------------------------------------------------
42 Fugue 64.4720% -64 - C1 -2B5W GLCDH_HALMT A:[1-357] MKAIAVKRG--E---D---R-P-VVIEKPRPE-P-ESGEALVRTLRVGVCGTD-HEV-IAGGHGGFPEGED-HLVLGHEAVGVVVDPNDT--E----LEEGDIVVPTVR----R---PP---------ASGTNE---YFER-----------DQ--PDMAPDGM---Y---------------------F----------------------E-----R---GIVGAHGYMSEFFTSPEK-YLVRIPRSQAEL-GF-L-IEPISITEKALEHAYAS-----------RSAFDWDPSSAF-------VLGN-GSLGLLTLAM------LK-------VD-D-------KGYENLYCLGRRDRPD---P-T-IDII--EELDATYVDSRQTP-VED----------V----------P-DV---Y-----------E-QMDFIYEATG---FPKHAIQSVQ-ALAP-N-GVGALLGVPS------D-WAFEVDAG--AFH----R-E---MVLHNKALVG-----SVNS---H---V---EHFE-AATVTFTKL--P-KWFLEDLVTGVH-PLSEFEAAFDDDDTTI------KTAIEFSTV
34 HHSearch 64.2916% -77 * C1 *3UKO ADHX_ARATH A:[7-377] ITCKAAVAY--E---P---N-KPLVIEDVQVAPP-QAGEVRIKILYTALCHTD-AYT-WSGKDP----EGLFPCILGHEAAGIVESVGEGVTE----VQAGDHVIPCYQ----A---EC---------R---ECKFCKSGK-----------TN--LC--GKVR---S---------------------ATGVGIMMNDRKSRFSVNGKPIYH-----F---M---GTSTFSQYTVVHDV-SVAKIDPTAPLDKVCLL-GCGVPTGLGAVWNTAK-------------VEPG---SNVA-------IFGL-GTVGLAVAEG------AK-------T--A-------GA----SRIIGIDIDS---K-K-YETAK-KF-----GVNEFVN-PKD----------HDKPIQEVIVDL-T----D-----------G-GVDYSFECIGN---VSVMRAALE-CCHK-GWGTSVIVGVAA------S-G-----QEISTRP----F-Q----LVTGRVWKG-----TAFGGFKS---R---TQVP-WLVEKYM-NKEI---KVDEYITHNL-T---LGEINKAFDLLHEGT-CLRCVLDTS--