@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : jhp_1091: (2015-12-20 )
MDQEILDVLIVGAGPGGIATVVECEIAGVKKVLLCEKTESHSGMLEKFYKAGKRIDKDYKKQVVELKGHIPFKDSFKEETLENFTNLLKEHRITPSYKTDIESVKKEGELFKITTTSNTTYHAKFVVVAIGKMGQPNRPTTYKIPVALSKQVVFSINDCKENEKTLVIGGGNSAVEYAIALCKTTPTTLNYRKKEFSRINEDNAKNLQEVLDNNTLKSKLGVDIESLEEDNTQIKVNFTDNTSESFDRLLYAIGGSTPLEFFKRCSLELDPSTNIPVVKENLESNNIPNLFIVGDILFKSGASIATALNHGYDVAIEIAKRLQS

Atome Classification :

(20 SA) ..--------.......10........20........30--........------40..------------------..---------------.---..--.50.....-----...60.--.-.....----.--70...--.....80.----...----..---..90........100.....--.---..-110--.-----.....--------------..--.120.........130..--.-...-.140.--.-.--.--.--.----.-150--...---.--.---..--..160--.--..----......170-----.......180.-..-.--.-..190....--...200.......----210...-..---.-...220.------.....--.230---.-.---.....-----.-----240-.--.--.---.-----.---.----...250..--.....260-....----.....270.......280.......290.......300.--....-....310.......320..---
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) MD--------QEILDVLIVGAGPGGIATVVECEIAGVKK--VLLCEKTE------SHSG------------------ML---------------E---KF--YKAGKRID-----KDYKKQ--V-VELKG----H--IPFKD--SFKEETLE----NFT----NL---LKEHRITPSYKTD-IESVKK--E---GE-L----F-----KITTT--------------SN--TT--YHAKFVVVAIGKMG--Q-PNR-PTTYK--I-P--V--A--L----S-K----QVV---F--S---IN--DCK----E--NE----KTLVIGGGN-----SAVEYAIALCK-TT-P--T-TLNYRKKEF--SRINEDNAKNLQE----V--LDN-NT---L-KSKLGVD------IESLE--ED-N---T-Q---IKVNF-----T-----D---N--T--S---E-----S---F----DRLLYAIG--GSTPLE---FFKR----CSLELDPSTNIPVVKENLESNNIPNLFIVGDILFKS--G--ASIA-TALNHGYDVAIEIAKRLQS---
9 PsiBlast_PDB 77.1424% -75 - C3 -1LPF DLDH_PSEFL A:[4-341] -------------FDVVVIGAGPGGYVAAIRAAQLGLKT--ACI-EKYI------GKEGKVALGGTCLNVGCIPSKALL---------------D---SS--YKY-HEAK-----EAFKVH--G-IEAKGVTI-D--VPAMV--ARKANIVK----NLT----G--------GIATLFKANGVTSFEG--H---GK-L----LANKQVEVTGL--------------DG--KTQVLEAENVIIASG--------SR-PVEIP----P--A--P--L----S-D----DII---V--D---ST--GAL----E--FQAVPKKLGVIGAGV-----IGLELGSVWAR-LG-AEVT-VLEALDKFL--PAADEQIAKEALK----V--LTK-QG---L-NIRLGAR------VTASE--VK-K---K-Q---VTVTF-----T-----D---A--N--GEQKE-----T---F----DKLIVAV---GRRPVTTDLLAAD----SGVTLDERGFIYV--DDHCKTSVPGVFAIGDVV--R--G--AMLAHKASEEGVMVAERIAGHKAQ---
37 HHSearch 75.4225% -78 - C3 -2ZBW FENR_THET8 A:[3-317] ----------ADHTDVLIVGAGPTGLFAGFYVGMRGLS---FRFVDPLP------EPGG------------------QL---------------T---AL--YPEKYI---------Y--------DVAG-------FP--K--VYAKDLVK----GLV----EQ---VAPFNPVYSLGER-AETLER--E---GD-L----F-----KVTTS--------------QG--NA--YTAKAVIIAAGVGAF-E-PRR-I-GAP--G-E--R--E--F----E-GR---GVY---YAVK---SK--AEF----Q--GK----RVLIVGGGD-----SAVDWALNLLD-TA-RR-I-TLIHRRPQF--RAH-EASVKELMK----A--HEE-GR---L-EVLTPYE------LRRVE--GD-E---RVR---WAVVF-----H-----NQT-QEEL--A---L-----E---V----DAVLILAG--YITKLG---PLAN----WGLALE-K-NKIKVDTTMAT-SIPGVYACGDIVTYP--GKLPLIV-LGFGEAAIAANHAAAYANP---
1 PsiBlast_PDB 72.2525% -78 - C3 -2ZBW FENR_THET8 A:[7-293] --------------DVLIVGAGPTGLFAGFYVGMRGLS---FRFVDPLP------EPGG------------------QL---------------T---AL--YP--------------EKY--I-YDVAG---------FPK--VYAKDLVK----GLV----EQ---VAPFNPVYSLGER-AETLER--E---GD-L----F-----KVTTS--------------QG--NA--YTAKAVIIAAGVGAF-E-PRR-IGAPG--E-R--E--F--E----G-R----GVY---Y--A---VK--SKA----EFQGK----RVLIVGGGD-----SAVDWALNLLD-TARR--I-TLIHRRPQF---RAHEASVKELMK----A--HEE-GR---L-EVLTPYE------LRRVE--GDER---V-R---WAVVF-----H-----N---Q--T--Q---E-----E---LALEVDAVLILAG--YITKLG---PLAN----WGLALE-KNKIKV--DTTMATSIPGVYACGDIVTYP--G--KLPL-IVLGFGEAAIAANHAAAYA---
40 HHSearch 71.6319% -84 - C3 -3R9U ? A:[1-313] -S--------NAMLDVAIIGGGPAGLSAGLYATRGGLKN--VVMFEKGM-------PGG------------------QI---------------T---SS--SEI----------ENYPGV--A-QVM-----------------DGISFMA----PWS----EQ---CMRFGLKHE-MVG-VEQILKN-S---DG-S----F-----TIKLE--------------GG--KT--ELAKAVIVCTGS----A-PKK-A-GFK--G-E--D--E--F----F-GKGVSTCA---T--C---DG--FFY----K--NK----EVAVLGGGD-----TALEEALYLAN-IC-SK-I-YLIHRRDEF--RA-AP---STVEK----V--KKN-EK---I-ELITSAS------VDEVY--GD-K---M-GVAGVKVKL-----K-----D---G--SIRD---L-----N---V----PGIFTFVG--LNVRNE---ILKQDDSKFLCNMEEG-GQVSVDLKMQT-SVAGLFAAGDLRKDA--P--KQVI-CAAGDGAVAALSAMAYIES---
39 HHSearch 71.4822% -83 - C3 -3AB1 FENR_CHLTE A:[13-328] -----------DMRDLTIIGGGPTGIFAAFQCGMNNIS---CRIIESMP------QLGG------------------QL---------------A---AL--YPEKHIY-------DVA-------------------GFPE--VPAIDLVE----SLW----AQ---AERYNPDVVLNET-VTKYTK--LD--DG-T----F-----ETRTN--------------TG--NV--YRSRAVLIAAGLGA--FEPRK-LPQLG--N-I--D--H--L----T-G----SSVYYAV--K---SV--EDF----K--GK----RVVIVGGGD-----SALDWTVGLIK-NA-AS-V-TLVHRGHEF--QG-HGKTAHEVER----A--RAN-GT---I-DVYLETE------VASIE--ES-N---G-VLTRVHLRS-----S-----D---G--SKWT---V-----E---A----DRLLILIG--FKSNLG---PLAR----WDLELY-E-NALVVDSHMKT-SVDGLYAAGDIAYYPGKL--KIIQ-TGLSEATMAVRHSLSYIKP---
61 Fugue 71.1120% -73 - C3 -4NTC ? A:[2-326] MSIGKLLSNGALLVDVLIIGAGPAGLSTATGLARQLHTA--VVFDSGVY------RNAK------------------TQ---------------H---MH--NVLGWD--------------------------------HR--NPAELRAA----GRA----DL---TTRYSTIQFQNST-IEAIRQ--VET-NQ-L----F-----EARDN--------------EG--HS--WYGRKVVLATGVRD--I-PLD-IEGYS--E-C--W--ANGI----Y-H----CLF---C--D---GY--EER----G--QE----TVGVLALGPIANPARALHLARMALR-LS-E--S-VTIYTNG-------NEQLAKEIQQ----A--AEE-SP---VGASGLKFEARP---IRRFEKGDV-A---K-T---VIVHL-----G-----E---S--E--S---K-----T---E----GFLVYNPQ--TEVNGP---FAKQ----LALNMTEGGDILTTPPFYETS-VPGVFAVGDCA-TP--L--KAVT-PAVSMGSLAAGGLVAQLQAQAL
10 PsiBlast_PDB 69.8122% -86 - C3 -3LAD DLDH_AZOVI A:[4-320] -------------FDVIVIGAGPGGYVAAIKSAQLGLKT--ALI-EKYK------GKEGKTALGGTCLNVGCIPSKALL---------------DSSYKF--HEAHESF------KLHGIS--T-GEVAI----D--VPTMI--ARKDQIVR----NLTGGVASL---IKANGVTL------FEGHGKLLA---GK-K----V-----EVTAADG------------SS--QV--LDTENVILASG--------SK-PVEIP----P--A--P--V----D-Q----DVI---V--D---ST--GAL----D--FQNVPGKLGVIGAGV-----IGLELGSVWAR-LG-AEVT-VLEAMDKFL--PAVDEQVAKEAQK----I--LTK-QG---L-KILLGAR------VTGTE--VK-N---K-Q---VTVKF-----V-----DAEGE--K--S---Q-----A---F----DKLIVAV---GRRPVTTDLLAAD----SGVTLDERGFIYV--DDYCATSVPGVYAIGDVVRGA--M--LAHK-ASEEGVVVAERIAGHKAQM---
41 HHSearch 69.6720% -84 - C3 -3F8D ? A:[13-317] ----------GEKFDVIIVGLGPAAYGAALYSARYMLK---TLVIGETP--------GG------------------QL---------------T---EA--GI-----V-----DDYLG-------------------LIE--IQASDMIK----VFN----KH---IEKYEVPVLL-DI-VEKIEN--R------E----F-----VVKTK--------------RK--GE--FKADSVILGIGVK-----RRK-L-GVP--G-E--Q--E--FAGRGI-S----YCS---V--A---DA--PLF----K--NR----VVAVIGGGD-----SALEGAEILSS-YS-TK-V-YLIHRRDTF--KA-Q---PIYVET----V--KKK-PN---V-EFVLNSV------VKEIK--GD-K---V-V---KQVVVENL--K-----TGE-I--K--E---L-----N---V----NGVFIEIG--FDPPTD---FAKS----NGIETDTN-GYIKVDEWMRT-SVPGVFAAGDCTSAWLGF--RQVI-TAVAQGAVAATSAYRYVTE---
55 HHSearch 69.6023% -73 - C3 -3LAD DLDH_AZOVI A:[1-343] ----------SQKFDVIVIGAGPGGYVAAIKSAQLGLK---TALIEKYKGKEGKTALGG------------------TC---------------L---NVGCIPSKALLDSS---YKFHEAHES-FKLHGISTGEVAIDVPTMIARKDQIVR----NLTGGVASL---IKANGVTLFEGHG--KLLA-------GK-K----V-----EVTAA--------------DGSSQV--LDTENVILASGS----K-PVE-I-PPA--PVD--QDVI--V----D-S----TGA---L--D---F----QN----V--PG----KLGVIGAGV-----IGLELGSVWAR-LG-AE-V-TVLEAMDKFL-PAVDEQVAKEAQK----I--LTK-QG---L-KILLGAR------VTGTE--VK-N---K-Q---VTVKF-----V-----DAEGE--K--S---Q-----A---F----DKLIVAVG--RRPVTTDL-LAAD----SGVTLDER-GFIYVDDYCAT-SVPGVYAIGDVVRG---A--MLAH-KASEEGVVVAERIAGHKAQ---
16 PsiBlast_PDB 68.5620% -86 - C3 -2YQU ? A:[1-304] ------------MYDLLVIGAGPGGYVAAIRAAQLGM-K--VGVVEKEK------ALGG------------------TCLRVGCIPSKALLETTE---RI--YEAKKGLL-----GAKVKG--VELDLPA----L--MAHKD--KVVQANTQ----GVE----FL---FKKNGIARHQGT-----ARF--L---SE-R----K-----VLVEE--------------TG--EE--LEARYILIATGS----A-PLI-PPWAQ--V-D-------------Y-E----RVV---T--S---TE--ALS----F--PEVPK-RLIVVGGGV-----IGLELGVVWHR-LG-AEVI-VLEYMDRIL--PTMDLEVSRAAER----V--FKK-QG---L-TIRTGVR------VTAVV--PE-A---K-G---ARVEL-----E-----G---G--E--V---L-----E---A----DRVLVAVG--RRPYTEGL-SLEN----AGLSTDERGRIP-VDEHLRT-RVPHIYAIGDVVRGP--M--LAHK-ASEEGIAAVEHMVRGFGHV---
35 HHSearch 68.3021% -82 - C3 -3LZW FENR2_BACSU A:[4-315] -D--------TKVYDITIIGGGPVGLFTAFYGGMRQAS---VKIIESLP------QLGG------------------QL---------------S---AL--YPEKYIY-------D----------VAG---------FPK--IRAQELIN----NLK----EQ---MAKFDQTICLEQA-VESVEK--QA--DG-V----F-----KLVTN---------------E--ET--HYSKTVIITAGNGAF-K-PRK-L-ELE--N-A--E--Q--Y----EGK----NLH---Y--F---VDDLQKF----A--GR----RVAILGGGD-----SAVDWALMLEP-IA-KE-V-SIIHRRDKF--RA-----HEHSVE----N--LHA-SK---V-NVLTPFV------PAELI--GE-D---K-I---EQLVLEEVKGD-----R---K--E--I---L-----E---I----DDLIVNYG--FVSSLG---PIKN----WGLDIE-K-NSIVVKSTMET-NIEGFFAAGDICTYEGKV--NLIA-SGFGEAPTAVNNAKAYMDP---
2 PsiBlast_PDB 68.1123% -79 - C3 -3AB1 FENR_CHLTE A:[13-304] -----------DMRDLTIIGGGPTGIFAAFQCGMNNIS---CRIIESMP------QLGG------------------QL---------------A---AL--YP--------------EKH--I-YDVAG---------FPE--VPAIDLVE----SL------W---AQAERYNPDVVLN--ETVTK--Y---TK-LDDGTF-----ETRTN--------------TG--NV--YRSRAVLIAAG-LGAFE-PRKLPQLGN--I-D--H--L--T----G-S----SVY---Y--A---VK--SVE----DFKGK----RVVIVGGGD-----SALDWTVGLIK-NA-A--SVTLVHRGHEF--QG-HGKTAHEVER----A--RAN-GT---I-DVYLETE------VASIE--ES-NGVLT-R---VHLRS-----S-----D---G--S--K---W-----T---VEA--DRLLILIG--FKSNLG---PLAR----WDLEL--YENALVVDSHMKT-SVDGLYAAGDIAYYP--G--KLKI-IQTGLSEATMAVRHSLSYI---
15 PsiBlast_PDB 67.9520% -82 - C3 -2EQ7 ? A:[1-304] ------------MYDLLVIGAGPGGYVAAIRAAQLGM-K--VGVVEKEK------ALGG------------------TCLRVGCIPSKALLETTE---RI--YEAKKGLL-----GAKVKG--VELDLPA----L--MAHKD--KVVQANTQ----GVE----FL---FKKNGIARHQGT-----ARF--L---SE-R----K-----VLVEE--------------TG--EE--LEARYILIATGS----A-PLI-PPWAQ--V-D-------------Y-E----RVV---T--S---TE--ALS----F--PEVPK-RLIVVGGGV-----IGLELGVVWHR-LG-AEVI-VLEYMDRIL--PTMDLEVSRAAER----V--FKK-QG---L-TIRTGVR------VTAVV--PE-A---K-G---ARVEL-----E-----G---G--E--V---L-----E---A----DRVLVAVG--RRPYTEGL-SLEN----AGLSTDERGRIP-VDEHLRT-RVPHIYAIGDVVRGP--M--LAHK-ASEEGIAAVEHMVRGFGHV---
6 PsiBlast_PDB 67.0825% -64 - C3 -2A87 TRXB_MYCTU A:[14-315] ------------VRDVIVIGSGPAGYTAALYAARAQLAP---LVFEGT-------SFGG------------------AL---------------M---TT--TDV----------ENYPGF--R-NGITG----P---ELMD--EMREQALR----FGA----DL---RME---------D-VESVSL--H---GP-L----K-----SVVTA--------------DG--QT--HRARAVILAMGAAA--R-------YLQ--V-PGEQ--E--L----L-G----RGV---S--S---CA--TCDGFFFR--DQ----DIAVIGGGD-----SAMEEATFLTRFAR-S--V-TLVHRRDEFRASKIMLDRARNNDK----IRFLTN-HT---V----VAVD------GDTTV---------T-G---LRVRD-----T-----N---T--G--A---E-----TTLPV----TGVFVAI---GHEPRS---GLVR----EAIDVDPDGYV-LVQGRTTSTSLPGVFAAGDLVDRT--Y--RQAV-TAAGSGCAAAIDAERWLAE---
54 HHSearch 65.1721% -94 - C3 -1FL2 AHPF_ECOLI A:[1-305] ------------AYDVLIVGSGPAGAAAAIYSARKGIR---TGLMGE--------RFGG------------------QI---------------L---DT--VDI----------ENY-------------------ISVPK--TEGQKLAG----ALK----VH---VDEYDVDVIDSQS-ASKLIP--AAVEGG-L----H-----QIETA--------------SG--AV--LKARSIIVATGAK-----WRN-M-NVP--G-E--D--Q--Y----RTK----GVT---Y--CPHCDG--PLF----K--GK----RVAVIGGGN-----SGVEAAIDLAG-IV-EH-V-TLLEFAPEM--KA-----DQVLQD----K--LRSLKN---V-DIILNAQ------TTEVK--GD-G---S-KV--VGLEY-----RDRVSGD---I--H--N---I-----E---L----AGIFVQIG--LLPNTN---WLEG----A-VERNRM-GEIIIDAKCET-NVKGVFAAGDCTTVP--Y--KQII-IATGEGAKASLSAFDYLIR---
8 PsiBlast_PDB 65.0622% -81 - C3 -3LZX FENR2_BACSU A:[4-286] -D--------TKVYDITIIGGGPVGLFTAF---YGGMRQASVKIIESLP------QLGG------------------QL---------------S---AL--YP--------------EKY--I-YDVAG---------FPK--IRAQELIN----NLK----EQ---MAKFDQTICLEQA-VESVEK--Q---ADGV----F-----KLVTN--------------EE--TH--YSKTVIITAGNGAF--K-PRK-LELEN--A-E--Q--Y--E----G-K----NLH---Y--F---VD--DLQ----KFAGR----RVAILGGGD-----SAVDWALMLEP-IA-KE-V-SIIHRRDKF---RAHEHSVENLHASKVNV--LTP-FV---P-AELIGEDKIEQLVLEEVK--GD-R---K-E---IL----------------------------------E---I----DDLIVNYG--FVSSLG---PIKN----WGLDIE--KNSIVVKSTMET-NIEGFFAAGDICTYE--G--KVNL-IASGFGEAPTAVNNAKAYM---
19 PsiBlast_PDB 64.5121% -51 - C3 -3DGZ TRXR2_MOUSE A:[4-327] ----------QQSFDLLVIGGGSGGLACAKEAAQLG-KK--VAVADYVE------P-SP------------------RG---------------T---KW--GLGGTCVNVGCIPKKLMHQ--A-ALLGG----M--IRDAH--HYGWEVAQPVQHNWK----TMAEAVQNHVKSLNWGHR-VQLQDR--K---VK-Y----F-----NIKASFVDEHTVRGVDKGGKA--TL--LSAEHIVIATG--G--R-PRY-PTQVKGAL-E--Y--G--I----T-S----DDI---F--W---LK--E------S--PG----KTLVVGASY-----VALECAGFLTG-IGLD--T-TVMMRSIPL--RGFDQQMSSLVTE----H--MES-HGTQFL-KGCVPSH------IKKLP--TN-------Q---LQVTW-----E-----D---H--A--S---GKEDTGT---F----DTVLWAIGRVPETRTL---NLEK----AGISTNPK-NQKIIVDAQEATSVPHIYAIGDVAEGR--P--ELTP-TAIKAGKLLAQRLFGKSST---
7 PsiBlast_PDB 64.0422% -82 - C3 -3LZW FENR2_BACSU A:[4-286] -D--------TKVYDITIIGGGPVGLFTAF---YGGMRQASVKIIESLP------QLGG------------------QL---------------S---AL--YP--------------EKY--I-YDVAG---------FPK--IRAQELIN----NLK----EQ---MAKFDQTICLEQA-VESVEK--Q---ADGV----F-----KLVTN--------------EE--TH--YSKTVIITAGNGAF--K-PRK-LELEN--A-E--Q--Y--E----G-K----NLH---Y--F---VD--DLQ----KFAGR----RVAILGGGD-----SAVDWALMLEP-IA-KE-V-SIIHRRDKF---RAHEHSVENLHASKVNV--LTP-FV---P-AELIGEDKIEQLVLEEVK--GD-R---K-E---IL----------------------------------E---I----DDLIVNYG--FVSSLG---PIKN----WGLDIE--KNSIVVKSTMET-NIEGFFAAGDICTYE--G--KVNL-IASGFGEAPTAVNNAKAYM---
17 PsiBlast_PDB 63.5221% -51 - C3 -1ZDL TRXR2_MOUSE A:[31-353] -----------QSFDLLVIGGGSGGLACAKEAAQLG-KK--VAVADYVE------P-SP------------------RG---------------T---KW--GLGGTCVNVGCIPKKLMHQ--A-ALLGG----M--IRDAH--HYGWEVAQPVQHNWK----TMAEAVQNHVKSLNWGHR-VQLQDR--K---VK-Y----F-----NIKASFVDEHTVRGVDKGGKA--TL--LSAEHIVIATG--G--R-PRY-PTQVKGAL-E--Y--G--I----T-S----DDI---F--W---LK--E------S--PG----KTLVVGASY-----VALECAGFLTG-IGLD--T-TVMMRSIPL--RGFDQQMSSLVTE----H--MES-HGTQFL-KGCVPSH------IKKLP--TN-------Q---LQVTW-----E-----D---H--A--S---GKEDTGT---F----DTVLWAIGRVPETRTL---NLEK----AGISTNPK-NQKIIVDAQEATSVPHIYAIGDVAEGR--P--ELTP-TAIKAGKLLAQRLFGKSST---
18 PsiBlast_PDB 63.3621% -53 - C3 -1ZKQ TRXR2_MOUSE A:[30-353] ----------QQSFDLLVIGGGSGGLACAKEAAQLG-KK--VAVADYVE------P-SP------------------RG---------------T---KW--GLGGTCVNVGCIPKKLMHQ--A-ALLGG----M--IRDAH--HYGWEVAQPVQHNWK----TMAEAVQNHVKSLNWGHR-VQLQDR--K---VK-Y----F-----NIKASFVDEHTVRGVDKGGKA--TL--LSAEHIVIATG--G--R-PRY-PTQVKGAL-E--Y--G--I----T-S----DDI---F--W---LK--E------S--PG----KTLVVGASY-----VALECAGFLTG-IGLD--T-TVMMRSIPL--RGFDQQMSSLVTE----H--MES-HGTQFL-KGCVPSH------IKKLP--TN-------Q---LQVTW-----E-----D---H--A--S---GKEDTGT---F----DTVLWAIGRVPETRTL---NLEK----AGISTNPK-NQKIIVDAQEATSVPHIYAIGDVAEGR--P--ELTP-TAIKAGKLLAQRLFGKSST---